RIP實(shí)驗(yàn)步驟通常包括:
1. 細(xì)胞收集與交聯(lián):培養(yǎng)細(xì)胞至適當(dāng)密度。使用交聯(lián)劑(如甲醛)進(jìn)行交聯(lián),,以固定蛋白質(zhì)-RNA復(fù)合物,。
2. 細(xì)胞裂解:收集細(xì)胞并進(jìn)行裂解,釋放RNA-蛋白質(zhì)復(fù)合物,。在裂解過(guò)程中添加蛋白酶抑制劑以防止蛋白質(zhì)降解,。
3. 超聲處理:使用超聲波破壞細(xì)胞,獲得更小的染色質(zhì)片段,,這有助于后續(xù)步驟中抗體的接觸,。
4. 除去細(xì)胞碎片:通過(guò)離心去除細(xì)胞碎片和未裂解的細(xì)胞,收集含RNA-蛋白質(zhì)復(fù)合物的上清液,。
5. 免疫沉淀:將針對(duì)特定RNA結(jié)合蛋白(RBP)的抗體加入到上清液中,。孵育一段時(shí)間,使抗體與目標(biāo)蛋白充分結(jié)合,。
6. 捕獲免疫復(fù)合物:添加蛋白A或蛋白G結(jié)合的磁珠或瓊脂糖珠,。孵育使抗體-蛋白質(zhì)-RNA復(fù)合物與珠子結(jié)合。
7. 洗滌:多次洗滌珠子以去除未特異性結(jié)合的蛋白質(zhì)和RNA,。
8. 洗脫與逆轉(zhuǎn)交聯(lián):使用適當(dāng)?shù)木彌_液洗脫免疫復(fù)合物,。使用蛋白酶K處理樣品以逆轉(zhuǎn)交聯(lián),釋放RNA,。
9. RNA提取與純化:從免疫沉淀樣品中提取RNA,,并進(jìn)行純化。
10. RNA分析:使用qPCR,、Northern blot,、RNA-Seq等方法分析沉淀的RNA,以確定與目標(biāo)蛋白相互作用的RNA種類(lèi),。
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Co-IP的優(yōu)勢(shì):
1. 生理相關(guān)性:Co-IP可以在接近生理?xiàng)l件的條件下捕獲蛋白質(zhì)相互作用。
2. 特異性:使用特異性抗體可以提高實(shí)驗(yàn)的特異性。
3. 廣泛應(yīng)用:Co-IP技術(shù)適用于多種樣本類(lèi)型,,包括細(xì)胞培養(yǎng),、組織樣本等。
Co-IP的局限性:
1. 抗體依賴(lài)性:需要高質(zhì)量的特異性抗體,,否則可能得到假陽(yáng)性或假陰性結(jié)果,。
2. 非特異性結(jié)合:可能存在非特異性結(jié)合問(wèn)題,需要仔細(xì)的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)和對(duì)照來(lái)控制,。
3. 技術(shù)挑戰(zhàn):對(duì)于低豐度或弱相互作用的蛋白質(zhì),,Co-IP可能面臨技術(shù)挑戰(zhàn)。
北京IP免疫沉淀外包公司免疫沉淀技術(shù)IP的原理是什么,?
免疫沉淀技術(shù)(Immunoprecipitation, IP)的實(shí)驗(yàn)方法通常包括以下步驟:
1. 樣本準(zhǔn)備
2. 蛋白質(zhì)濃度測(cè)定:使用BCA,、Bradford或Lowry等方法測(cè)定裂解液中蛋白質(zhì)的濃度。
3. 抗體預(yù)處理:如果使用預(yù)固定的抗體,,需先將抗體固定在固相支持物上,,如瓊脂糖珠或磁性微珠。
4. 免疫沉淀反應(yīng):將裂解液與特異性抗體(固定或未固定)混合,,并在4°C下緩慢搖晃孵育過(guò)夜,,以允許抗體與目標(biāo)蛋白質(zhì)充分結(jié)合。
5. 固相支持物的回收:對(duì)于未固定的抗體,,加入與抗體特異性結(jié)合的蛋白A或蛋白G結(jié)合的固相支持物,。
6. 洗滌:去除未結(jié)合的蛋白質(zhì)和雜質(zhì),通常需要多次洗滌固相支持物,。
7. 洗脫:使用適當(dāng)?shù)南疵摼彌_液(如加熱的SDS加載緩沖液或酸性緩沖液)從固相支持物上洗脫免疫復(fù)合物,。
8. 后續(xù)分析:對(duì)洗脫的蛋白質(zhì)進(jìn)行SDS-PAGE電泳、Western Blot,、質(zhì)譜分析等,,以進(jìn)一步分析目標(biāo)蛋白質(zhì)。
免疫沉淀技術(shù)(Immunoprecipitation, IP)是一種用于研究蛋白質(zhì)相互作用,、蛋白質(zhì)復(fù)合物組成以及特定蛋白質(zhì)的表達(dá)和純化的實(shí)驗(yàn)技術(shù),。
基本原理
免疫沉淀技術(shù)基于抗體與特定蛋白質(zhì)(抗原)之間的特異性相互作用。通過(guò)使用針對(duì)目標(biāo)蛋白質(zhì)的特異性抗體,,可以從含有多種蛋白質(zhì)的復(fù)雜樣本中捕獲并富集目標(biāo)蛋白質(zhì),。
免疫沉淀技術(shù)有多種類(lèi)型,包括:
1. 個(gè)別免疫沉淀法(Individual IP)
2. 免疫共沉淀法(Co-IP)
3. 染色質(zhì)免疫沉淀法(ChIP)
4. RNA免疫沉淀法(RIP)
近年來(lái),,免疫沉淀技術(shù)在固相支持物的選擇上有了很大進(jìn)步,。磁性微珠因其操作簡(jiǎn)便、快速和自動(dòng)化程度高而逐漸取代了傳統(tǒng)的瓊脂糖樹(shù)脂,。
免疫沉淀技術(shù)Co-IP的實(shí)驗(yàn)方法,。
免疫沉淀技術(shù)的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)通常包括以下幾個(gè)關(guān)鍵步驟:
1. 目標(biāo)蛋白質(zhì)的選擇:
2. 抗體的選擇:選擇特異性強(qiáng),、親和力高的抗體來(lái)捕獲目標(biāo)蛋白質(zhì)
3. 樣本的準(zhǔn)備:收集和準(zhǔn)備細(xì)胞或組織樣本。
4. 蛋白質(zhì)的裂解和釋放:選擇合適的裂解條件,,如pH值,、離子強(qiáng)度、去污劑等,。
5. 蛋白質(zhì)濃度的測(cè)定:確定裂解液中蛋白質(zhì)的濃度,,以便于后續(xù)步驟的標(biāo)準(zhǔn)化。
6. 免疫沉淀的操作:將特異性抗體與裂解液混合,,并在適宜的條件下孵育,,以形成抗體-抗原復(fù)合物。
7. 非特異性結(jié)合的減少:通過(guò)預(yù)純化步驟去除可能的非特異性結(jié)合蛋白,。
8. 洗滌:多次洗滌以去除未結(jié)合的蛋白質(zhì)和雜質(zhì),。
9. 目標(biāo)蛋白質(zhì)的洗脫:使用適當(dāng)?shù)木彌_液洗脫抗體-抗原復(fù)合物。
10. 后續(xù)分析:對(duì)洗脫的蛋白質(zhì)進(jìn)行進(jìn)一步分析,,如Western Blot.
11. 對(duì)照實(shí)驗(yàn):設(shè)計(jì)適當(dāng)?shù)恼龑?duì)照和負(fù)對(duì)照,,以評(píng)估實(shí)驗(yàn)的特異性和敏感性,。
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免疫沉淀和免疫共沉淀的區(qū)別?南京ChIP免疫沉淀磁珠應(yīng)用
免疫沉淀技術(shù)RIP(RNA Immunoprecipitation,,RNA免疫沉淀)的實(shí)驗(yàn)方法基于以下幾個(gè)關(guān)鍵步驟:
1. 細(xì)胞裂解:首先,,細(xì)胞或組織樣本被裂解,以釋放細(xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì)和RNA復(fù)合物,。
2.抗體特異性結(jié)合:裂解后的樣本中加入針對(duì)特定RNA結(jié)合蛋白的抗體,。這些抗體能夠特異性地識(shí)別并結(jié)合到目標(biāo)蛋白。
3. 免疫復(fù)合物形成:抗體與目標(biāo)蛋白結(jié)合后,,形成抗體-蛋白質(zhì)-RNA復(fù)合物,。
4. 親和介質(zhì)捕獲:使用蛋白A或蛋白G結(jié)合的珠子(如瓊脂糖或磁性珠子)來(lái)捕獲這些抗體-蛋白質(zhì)-RNA復(fù)合物。蛋白A或蛋白G能夠與抗體的Fc部分結(jié)合,,從而拉下與之結(jié)合的復(fù)合物,。
5. 洗滌:捕獲的復(fù)合物被洗滌以去除未特異性結(jié)合的蛋白質(zhì)和RNA。
6. RNA分離和分析:從珠子上洗脫或消化復(fù)合物,,分離出RNA,,并進(jìn)行進(jìn)一步的分析,如qPCR,、Northern blot或高通量測(cè)序(RNA-Seq),。
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