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貴陽個性化定制靶向代謝組學(xué)研究方法

來源: 發(fā)布時間:2022-02-17

代謝組學(xué)介紹:通過液質(zhì)聯(lián)用(LC-MS)方法檢測生物體受外界刺激前后體內(nèi)大多數(shù)小分子代謝物的動態(tài)變化,,重點尋找在實驗組和對照組中有明顯變化的代謝物,,進而研究這些代謝物與生理病理變化的相關(guān)關(guān)系,其研究對象大多是分子量1500Da以內(nèi)的小分子物質(zhì),。技術(shù)優(yōu)勢:較高的靈敏度,、分辨率,;較寬的動態(tài)范圍,;適合對標本中未知代謝物的探索研究;適合于生物樣本中復(fù)雜代謝產(chǎn)物的檢測和潛在標志物的鑒定,。代謝組學(xué)應(yīng)用方向: 土壤代謝組學(xué),。研究土壤中有機質(zhì)及土壤微生物代謝含量變化及相互作用,了解土壤微生物多樣性及其碳代謝能力,,為探索調(diào)節(jié),、控制和改善土壤環(huán)境質(zhì)量提供重要的參考。代謝組學(xué)作為系統(tǒng)生物學(xué)的重要組成部分,在臨床醫(yī)學(xué)領(lǐng)域具有普遍的應(yīng)用前景,。貴陽個性化定制靶向代謝組學(xué)研究方法

GC-MS非靶向代謝組學(xué)能檢測到哪些類別的代謝物,?衍生化極大地拓展了GC/MS的檢測分析范圍。GC/MS能檢測到有機酸,、氨基酸,、單糖、糖醇,、胺類,、脂肪酸、吲哚,、單甘油酯,、核苷、二糖,、生育酚,、甾醇和膽汁酸等代謝物。如何提高定性準確度,?GC/MS的定性有雙重標準,,一是保留指數(shù),二是質(zhì)譜信息的相似度(similarity),。不同于LC/MS的軟電離源,,GC/MS使用的EI源屬于硬電離,能量較強且穩(wěn)定,,在將代謝物分子電離后,,分子離子峰進一步碎裂產(chǎn)生豐富的碎片離子。因此,,我們很難在GC/MS上看到分子離子峰,。GC/MS提供的是代謝物的“指紋圖譜”,將儀器得到的實際指紋圖譜和質(zhì)譜庫(如NIST庫)進行比對后,,我們將會得到一個叫相似度的指標,。保留指數(shù)和相似度都必須滿足設(shè)定的閾值,軟件才會給出色譜峰的定性結(jié)果,。然后采用標準品質(zhì)譜信息進行完全比對定性,,也就是說只有經(jīng)過標準品比對,代謝物才是被100%定性,。浙江LC-MS/MS非靶向代謝組學(xué)技術(shù)代謝組學(xué)主要研究的是各種代謝路徑的底物,。

代謝組學(xué)的研究對象與層次有哪些?一般來說,,代謝組學(xué)關(guān)注的對象是分子量在1000以下的小分子化合物,。根據(jù)研究的對象和目的不同,,科學(xué)家將生物體系的代謝產(chǎn)物分析分為4個層次:代謝物靶標分析:某一個或幾個特定組分的定性和定量分析,如某一類結(jié)構(gòu),、性質(zhì)相關(guān)的化合物(氨基酸,、有機酸、順二醇類)或者某一代謝途徑的所有中間產(chǎn)物或多條代謝途徑的標志性組分,。代謝物指紋分析:同時對多個代謝物進行分析,,不分離鑒定具體單一組分。代謝輪廓分析:限定條件下對生物體內(nèi)特定組織內(nèi)的代謝產(chǎn)物的快速定性和半定量分析,。代謝組分析:對生物體或體內(nèi)某一特定組織所包含的所有代謝物的定量分析,,并研究該代謝物組在外界干預(yù)或病理生理條件下的動態(tài)變化規(guī)律。

代謝組學(xué)有哪些特點,?(1) 代謝處于系統(tǒng)生物學(xué)的末端,,更能反映基因與外部環(huán)境互作的真實情況,因此,,在多數(shù)生物表型研究上更加適用,。(2) 常規(guī)代謝組學(xué)只關(guān)注內(nèi)源性化合物,也有使用代謝組學(xué)技術(shù)測定外源性化合物的,。內(nèi)源性化合物的上調(diào)和下調(diào)指示了與疾病,、毒性、基因修飾或環(huán)境因子的影響,。(3) 高通量定量和定性研究生物小分子化合物,。(4) 內(nèi)源性化合物的結(jié)果可以作為疾病的診斷、藥物篩選或者其他分型評估等潛在生物標志物,。謝組學(xué)通過揭示內(nèi)在和外在因素影響下,,生物體的代謝整體的變化軌跡來反映某種生理或病理的一系列發(fā)展過程。代謝組學(xué)技術(shù)可應(yīng)用于功能基因組學(xué),。

代謝組學(xué)需要多少的生物學(xué)重復(fù),?生物學(xué)重復(fù)指的是相同處理的相同類型的生物樣本的數(shù)量(如相同劑量給藥后2小時的小鼠采集并且相同儲存條件和處理方法血清樣本)。相較于基因和蛋白,,代謝物處于生命活動的下游,,收到環(huán)境和遺傳背景等因素影響較大,生物學(xué)重復(fù)少可能會放大組內(nèi)差異對于整體差異的影響,,進而影響結(jié)果(如準確和足夠多的找出生物標志物),。因此根據(jù)不同的生物類型,需要不同的生物學(xué)重復(fù)來增加數(shù)據(jù)的可靠性和說服力,。代謝組學(xué)的研究方法與蛋白質(zhì)組學(xué)的方法類似,。代謝組學(xué)的研究方法與蛋白質(zhì)組學(xué)的方法類似,。湖北植物靶向代謝組學(xué)檢測多少錢

代謝組學(xué)主要技術(shù)手段是核磁共振,。貴陽個性化定制靶向代謝組學(xué)研究方法

代謝組學(xué)疾病診斷應(yīng)用:與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比,, 代謝組學(xué)的研究側(cè)重于相關(guān)特定組分的共性,是要涉及研究每一個代謝組分的共性,、特性和規(guī)律,,目前據(jù)此目標相距甚遠。盡管充滿了挑戰(zhàn),,研究人員仍然堅信,,與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比,代謝組學(xué)與生理學(xué)的聯(lián)系更加緊密,。疾病導(dǎo)致機體病理生理過程變化,,引起代謝產(chǎn)物發(fā)生相應(yīng)的改變,通過對某些代謝產(chǎn)物進行分析,,并與 正常人的代謝產(chǎn)物比較,,尋找疾病的生物標記物,將提供一種較好的疾病診斷方法,。貴陽個性化定制靶向代謝組學(xué)研究方法

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