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靶向代謝組學(xué):靶向代謝組學(xué)(Targeted Metabolomics)是代謝組學(xué)研究的重要組成部分,,也是全代謝組研究的延伸與拓展。相對于全代謝組分析而言,,靶向代謝組分析具有特異性強(qiáng),,檢測靈敏度高和定量準(zhǔn)確等幾個(gè)特點(diǎn)。通過對血液,、尿液或其他體液以及組織中某一特定的代謝物的富集與準(zhǔn)確定量定性分析,,一方面可以結(jié)合其它實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)揭示相關(guān)的分子生物學(xué)作用機(jī)制,另一方面,,也可以為后續(xù)代謝分子標(biāo)志物的深入研究和開發(fā)利用提供有力支持,。靶向代謝組學(xué)可以用于:驗(yàn)證有非靶向代謝組學(xué)實(shí)驗(yàn)提出的假說;進(jìn)行基于假說的探索性實(shí)驗(yàn),,針對特定代謝物,,研究代謝模型。代謝組學(xué)是要涉及研究每一個(gè)代謝組分的共性,、特性和規(guī)律,。湖北LC-MS/MS非靶向脂質(zhì)組學(xué)分析
代謝組學(xué)樣品收集方法及所需樣本量是什么?(1) 血清樣品: 避免反復(fù)凍融,。血液收集在離心管中靜置30分鐘進(jìn)行凝血,。8000rpm離心10分鐘,取上清分裝到凍存管中,,放置液氮中或-80度凍存,;單個(gè)樣本要求體積為50μL。(2) 尿液樣品:臨床樣本請全部取清晨第1次尿液,。尿液直接分裝到離心管中,,8000rpm離心10分鐘,取上清分裝到凍存管中,,放置液氮中或-80度凍存,,-80度凍存,;單個(gè)樣本要求體積為100μL。(3) 其他樣本收集辦法請咨詢譜領(lǐng)工作人員,。江蘇植物靶向代謝組學(xué)分析代謝組學(xué)技術(shù)可應(yīng)用于疾病早期診斷,。
GC-MS非靶向代謝組學(xué)能檢測到哪些類別的代謝物?衍生化極大地拓展了GC/MS的檢測分析范圍,。GC/MS能檢測到有機(jī)酸,、氨基酸、單糖,、糖醇,、胺類、脂肪酸,、吲哚,、單甘油酯、核苷,、二糖,、生育酚、甾醇和膽汁酸等代謝物,。如何提高定性準(zhǔn)確度,?GC/MS的定性有雙重標(biāo)準(zhǔn),一是保留指數(shù),,二是質(zhì)譜信息的相似度(similarity),。不同于LC/MS的軟電離源,GC/MS使用的EI源屬于硬電離,,能量較強(qiáng)且穩(wěn)定,,在將代謝物分子電離后,分子離子峰進(jìn)一步碎裂產(chǎn)生豐富的碎片離子,。因此,,我們很難在GC/MS上看到分子離子峰。GC/MS提供的是代謝物的“指紋圖譜”,,將儀器得到的實(shí)際指紋圖譜和質(zhì)譜庫(如NIST庫)進(jìn)行比對后,,我們將會(huì)得到一個(gè)叫相似度的指標(biāo)。保留指數(shù)和相似度都必須滿足設(shè)定的閾值,,軟件才會(huì)給出色譜峰的定性結(jié)果,。然后采用標(biāo)準(zhǔn)品質(zhì)譜信息進(jìn)行完全比對定性,也就是說只有經(jīng)過標(biāo)準(zhǔn)品比對,,代謝物才是被100%定性,。
代謝組學(xué)有哪些應(yīng)用?近年來,代謝組學(xué)技術(shù)得到了迅速發(fā)展,,主要可應(yīng)用于:功能基因組學(xué),、疾病早期診斷、病因病機(jī)研究,、藥物毒理學(xué),、中醫(yī)藥現(xiàn)代化、植物代謝組學(xué),、微生物代謝組學(xué),、營養(yǎng)學(xué)、環(huán)境科學(xué)等生命科學(xué)的各個(gè)領(lǐng)域,。為什么要選擇代謝組學(xué),?首先需要明確的是代謝組學(xué)的目標(biāo)分析物主要為生物小分子及其代謝產(chǎn)物,如糖,、有機(jī)酸、脂質(zhì),、維生素,、氨基酸、芳香烴之類等化合物,。所以,,如果關(guān)注的是小分子物質(zhì),那么采用代謝組學(xué)的方法,,可以對樣品內(nèi)檢測到的小分子物質(zhì)進(jìn)行定性,、定量分析。同于基因組學(xué)和蛋白組學(xué),,代謝組學(xué)的研究反映某一時(shí)刻下正在發(fā)生的生命活動(dòng)情況,,研究代謝物的表達(dá)量、代謝物與生理病理變化的關(guān)系,,能夠幫助尋找新的生物標(biāo)記物,,發(fā)現(xiàn)新的代謝途徑,以及更進(jìn)一步深入了解目前已知的這些途徑,,應(yīng)用于疾病的早期診斷,、藥物靶點(diǎn)的發(fā)現(xiàn)、疾病的病理生理研究,。代謝組學(xué)技術(shù)可應(yīng)用于病因病機(jī)研究,。
代謝組學(xué)比較常用到的數(shù)據(jù)分析方法:代謝組學(xué)分析數(shù)據(jù)用于統(tǒng)計(jì)分析時(shí),數(shù)據(jù)集通常為一個(gè)N × K的矩陣(X矩陣),,N表示N個(gè)樣本數(shù),,每一行表示一個(gè)樣品, K表示K個(gè)變量,每一列表示一個(gè)變量,,在代謝組學(xué)中變量通常是指代謝物含量,。單變量分析方法只分別分析單個(gè)變量,,不考慮多個(gè)變量的相互作用與內(nèi)在聯(lián)系。具有簡單性、易應(yīng)用性和可解釋性,。但是無法基于整體數(shù)據(jù)對所測樣品的優(yōu)劣、差異進(jìn)行綜合評(píng)價(jià)和分析,。差異倍數(shù)變化大?。‵old Change,F(xiàn)C)表示實(shí)驗(yàn)組與對照組的含量比值,,可以快速考察各個(gè)代謝物在不同組別之間的含量變化大小,。代謝組學(xué)可以檢測的樣品種類有哪些?廣州常規(guī)靶向代謝組學(xué)分析
代謝組學(xué)技術(shù)可應(yīng)用于功能基因組學(xué),。湖北LC-MS/MS非靶向脂質(zhì)組學(xué)分析
GC-MS非靶向代謝組學(xué)醫(yī)學(xué)分析生物樣本為何要衍生化處理,?有哪些衍生化的方法?GC的流動(dòng)相為氣體(通常為高純氦),,這就要求被分析物必須能夠氣化,,而生物樣本中很多內(nèi)源性代謝物都含有極性基團(tuán),具有沸點(diǎn)高,、不易氣化特點(diǎn),。衍生化能夠降低這些代謝物的沸點(diǎn),增加它們的熱穩(wěn)定性,,以便分析能夠順利進(jìn)行,。衍生化方法及試劑種類繁多,根據(jù)不同的分析目標(biāo),,需選擇合適的衍生化方法,。如分析脂肪酸,我們可以采用甲酯化衍生,。在GC/MS代謝平臺(tái)上,,比較常用的衍生化方法是硅烷化衍生,因?yàn)樗膹V譜高效,。在進(jìn)行硅烷化衍生之前,,還需添加甲氧胺吡啶溶液,以封閉羰基(針對α-酮酸和糖類,,保護(hù)作用),,減少衍生化副產(chǎn)物的生成。湖北LC-MS/MS非靶向脂質(zhì)組學(xué)分析
上海拜譜生物科技有限公司是一家從事生物科技,、醫(yī)療科技,、化工科技和檢測科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā),,技術(shù)轉(zhuǎn)讓,技術(shù)咨詢,,技術(shù)服務(wù),,軟件開發(fā),化工原料及產(chǎn)品(除危險(xiǎn)化學(xué)品,,監(jiān)控化學(xué)品,,煙花爆竹,民用物,,易制毒化學(xué)品),、儀器儀表的銷售。,。,。....的公司,致力于發(fā)展為創(chuàng)新務(wù)實(shí),、誠實(shí)可信的企業(yè),。拜譜生物擁有一支經(jīng)驗(yàn)豐富、技術(shù)創(chuàng)新的專業(yè)研發(fā)團(tuán)隊(duì),,以高度的專注和執(zhí)著為客戶提供多組學(xué)服務(wù),,質(zhì)譜檢測,蛋白質(zhì)組學(xué),,代謝組學(xué),。拜譜生物始終以本分踏實(shí)的精神和必勝的信念,,影響并帶動(dòng)團(tuán)隊(duì)取得成功,。拜譜生物始終關(guān)注自身,在風(fēng)云變化的時(shí)代,,對自身的建設(shè)毫不懈怠,,高度的專注與執(zhí)著使拜譜生物在行業(yè)的從容而自信。