全長轉(zhuǎn)錄組學(xué)測序：由于在轉(zhuǎn)錄組研究中通常所使用的第二代測序技術(shù)具有測序讀長的限制,，因此在進(jìn)行測序之前,，需要先將樣本的mRNA打碎為小片段,，之后再通過與參考基因組比對或拼接的方式識別轉(zhuǎn)錄本,，這就會造成一定的錯誤比例,，同時(shí)在也很難區(qū)分單堿基水平的差異,。全長轉(zhuǎn)錄組測序的優(yōu)勢：1,、全方面鑒定可變剪切,；2,、發(fā)現(xiàn)更多新基因,；3、有效改善基因組注釋,；4,、鑒定更多的LncRNA；5,、準(zhǔn)確定位融合基因,。研究思路：由于全長轉(zhuǎn)錄組測序是基于第三代測序技術(shù)，因而其成本依然較高,，如果全部研究項(xiàng)目均基于全長轉(zhuǎn)錄組,，通常來說很難承擔(dān)，因此,，全長轉(zhuǎn)錄組測序一般與普通轉(zhuǎn)錄組測序相結(jié)合,。轉(zhuǎn)錄學(xué)組測序是目前深入研究轉(zhuǎn)錄組復(fù)雜性的強(qiáng)大工具,。北京外泌體轉(zhuǎn)錄組學(xué)方法
普通轉(zhuǎn)錄組學(xué)測序適用于哪些情況？普通轉(zhuǎn)錄組測序主要適用于兩大類：一是不同的生長階段或者發(fā)育過程,；二是不同的環(huán)境,、藥物、病原菌等逆境脅迫處理,。轉(zhuǎn)錄組學(xué)測序必須做生物學(xué)重復(fù)么,？需要幾個(gè)重復(fù)？生物學(xué)重復(fù)是生物實(shí)驗(yàn)所必須的,，轉(zhuǎn)錄組測序也不例外,，至少3次生物學(xué)重復(fù)。準(zhǔn)備生物重復(fù)樣品時(shí),，通過對實(shí)驗(yàn)的預(yù)先設(shè)計(jì)和控制,，盡可能將與實(shí)驗(yàn)處理無關(guān)的背景條件控制在同一水平，減少批次效應(yīng)對結(jié)果的影響,。轉(zhuǎn)錄組學(xué)測序可以同時(shí)測到mRNA,、lncRNA、micRNA以及circRNA么,？我們通常所講的轉(zhuǎn)錄組測序只能測到mRNA,。但是全轉(zhuǎn)錄組測序通過構(gòu)建兩個(gè)測序文庫（一是小RNA測序文庫、二是lncRNA測序文庫）是可以測到以上4種RNA的,。濟(jì)南靶向轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析鑒定RNA-Seq轉(zhuǎn)錄組學(xué)有著巨大的應(yīng)用前景,。
轉(zhuǎn)錄組學(xué)，基因組學(xué),，蛋白質(zhì)組學(xué)的區(qū)別：蛋白組學(xué)針對的是全體蛋白,，組要以2D-Gel和質(zhì)譜為主，分為top-down和bottom-up分析方法,。理念和基因組類似,，將蛋白用特定的物料化學(xué)手段分解成小肽段，在通過質(zhì)量反推蛋白序列,，之后進(jìn)行搜索,，標(biāo)識已知未知的蛋白序列。轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的是某個(gè)時(shí)間點(diǎn)的mRNA總和,，可以用芯片,，也可以用測序。芯片是用已知的基因探針,，測序則有可能發(fā)現(xiàn)新的mRNA,。基因組學(xué)研究的主要是基因組DNA，使用方法目前以二代測序?yàn)橹?，將基因組拆成小片段后再用生物信息學(xué)算法進(jìn)行迭代組裝,。當(dāng)然這只是第1步，隨后還有繁瑣的基因注釋等數(shù)據(jù)分析工作,。
轉(zhuǎn)錄組分析是目前應(yīng)用比較廣的高通量測序分析技術(shù)之一,。常見設(shè)計(jì)是不同樣品之間比較，尋找差異基因,、標(biāo)志基因,、協(xié)同變化基因、差異剪接和新轉(zhuǎn)錄本,，并進(jìn)行結(jié)果可視化,、功能注釋和網(wǎng)絡(luò)分析等。轉(zhuǎn)錄組的測序分析也相對成熟,，從RNA提取,、構(gòu)建文庫、上機(jī)測序再到結(jié)果解析既可以自己完成,，又可以在專業(yè)公司進(jìn)行,。概括來看轉(zhuǎn)錄組的分析流程比較簡單，序列比對-轉(zhuǎn)錄本拼接(可選)-表達(dá)定量-差異基因-功能富集-定制分析,。整個(gè)環(huán)節(jié)清晰流暢,，可以作為剛開始接觸高通量測序?qū)W習(xí)比較合適的技術(shù)之一。轉(zhuǎn)錄學(xué)組測序能夠提供更高的檢測通量,。
轉(zhuǎn)錄組學(xué)測序結(jié)果的影響因素,？RNA的降解嚴(yán)重影響測序的質(zhì)量，RNA降解后,，加入poly-A后無法捕獲純化mRNA,，因此，隨機(jī)引物反轉(zhuǎn)錄無法得到全部的cDNA,，導(dǎo)致測序結(jié)果出現(xiàn)明顯的3‘-和5’-偏向,。文庫中的poly-A多聚物的存在會對測序信號產(chǎn)生干擾，影響測序結(jié)果的準(zhǔn)確性,；同時(shí)由于轉(zhuǎn)錄組中轉(zhuǎn)錄本的豐度不一致，實(shí)驗(yàn)前需要對樣本進(jìn)行均一化處理,，否則高豐度的表達(dá)基因會掩蓋低豐度表達(dá)基因,，導(dǎo)致尋找新基因失敗或者是獲得大量無意義的重復(fù)序列。轉(zhuǎn)錄組學(xué)能夠檢測未知基因,，發(fā)現(xiàn)新的轉(zhuǎn)錄本,。濟(jì)南靶向轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析鑒定
轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析轉(zhuǎn)錄本的結(jié)構(gòu)和表達(dá)水平的同時(shí)，還能發(fā)現(xiàn)未知轉(zhuǎn)錄本和稀有轉(zhuǎn)錄本。北京外泌體轉(zhuǎn)錄組學(xué)方法
RNA-Seq轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)優(yōu)勢：相比基因芯片和標(biāo)記的堿基序列的測序方法,，RNA-seq具有一定的優(yōu)越性,。與基因芯片相比，RNA-Seq不只可以在更高的分辨率下用來測量基因的表達(dá)水平情況,，還可以揭示未知的轉(zhuǎn)錄組和拼接亞型,，并為選擇性拼接亞型提供定量分析。相對于傳統(tǒng)的芯片雜交平臺,，轉(zhuǎn)錄組測序無需預(yù)先針對已知序列設(shè)計(jì)探針,，即可對任意物種的整體轉(zhuǎn)錄活動進(jìn)行檢測，提供更精確的數(shù)字化信號,、更高的檢測通量以及更普遍的檢測范圍,，是目前深入研究復(fù)雜性轉(zhuǎn)錄組的強(qiáng)大工具。鑒于這些優(yōu)勢,，RNA-Seq很快就被應(yīng)用到關(guān)于瘤病相關(guān)研究的多個(gè)方面,。北京外泌體轉(zhuǎn)錄組學(xué)方法
上海拜譜生物科技有限公司位于東川路555號丙樓1171室。公司業(yè)務(wù)分為多組學(xué)服務(wù),，質(zhì)譜檢測,，蛋白質(zhì)組學(xué)，代謝組學(xué)等,，目前不斷進(jìn)行創(chuàng)新和服務(wù)改進(jìn),，為客戶提供良好的產(chǎn)品和服務(wù)。公司注重以質(zhì)量為中心,，以服務(wù)為理念,，秉持誠信為本的理念，打造商務(wù)服務(wù)良好品牌,。拜譜生物秉承“客戶為尊,、服務(wù)為榮、創(chuàng)意為先,、技術(shù)為實(shí)”的經(jīng)營理念,，全力打造公司的重點(diǎn)競爭力。