蛋白質(zhì)組(Proteome)的概念指由一個(gè)基因組(genome),,或一個(gè)細(xì)胞、組織表達(dá)的所有蛋白質(zhì)(Protein).蛋白質(zhì)組的概念與基因組的概念有許多差別,它隨著組織,、甚至環(huán)境狀態(tài)的不同而改變.在轉(zhuǎn)錄時(shí),,一個(gè)基因可以多種mRNA形式剪接,并且,,同一蛋白可能以許多形式進(jìn)行翻譯后的修飾.故一個(gè)蛋白質(zhì)組不是一個(gè)基因組的直接產(chǎn)物,,蛋白質(zhì)組中蛋白質(zhì)的數(shù)目有時(shí)可以超過(guò)基因組的數(shù)目.蛋白質(zhì)組學(xué)(Proteomics)處于早期“發(fā)育”狀態(tài),這個(gè)領(lǐng)域的**否認(rèn)它是單純的方法學(xué),,就像基因組學(xué)一樣,,不是一個(gè)封閉的、概念化的穩(wěn)定的知識(shí)體系,,而是一個(gè)領(lǐng)域.蛋白質(zhì)組學(xué)集中于動(dòng)態(tài)描述基因調(diào)節(jié),,對(duì)基因表達(dá)的蛋白質(zhì)水平進(jìn)行定量的測(cè)定,鑒定疾病,、藥物對(duì)生命過(guò)程的影響,,以及解釋基因表達(dá)調(diào)控的機(jī)制.作為一門(mén)科學(xué),。質(zhì)譜技術(shù)相較于傳統(tǒng)蛋白質(zhì)鑒定技術(shù)而言,,擁有靈敏、準(zhǔn)確,、高通量,、自動(dòng)化等特點(diǎn)。江蘇外泌體蛋白質(zhì)組學(xué)價(jià)錢(qián)
定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析(QuantitativeProteomics)是對(duì)一個(gè)基因組表達(dá)的全部蛋白質(zhì)或一個(gè)復(fù)雜混合體系內(nèi)所有蛋白質(zhì)進(jìn)行精確鑒定和定量,??捎糜诤Y選和尋找任何因素引起的樣本之間的差異表達(dá)蛋白,結(jié)合生物信息學(xué)揭示細(xì)胞生理病理等功能,,同時(shí)也可對(duì)某些關(guān)鍵蛋白進(jìn)行定性和定量分析,。目前定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)常見(jiàn)標(biāo)記(Label)和非標(biāo)記的(LabelFree)定量策略。定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)常見(jiàn)的幾類(lèi)主要包括:LabelFree定量蛋白組分析,、SILAC與免疫共沉淀蛋白互作分析,、MRM/PRM定量蛋白組學(xué)分析、SILAC/Dimethyl標(biāo)記定量蛋白組分析,、SWATH定量蛋白組學(xué),、TMT/iTRAQ/multinotch定量蛋白組學(xué)分析。濟(jì)南定量蛋白組學(xué)項(xiàng)目iTRAQ定量是目前定量蛋白質(zhì)組學(xué)應(yīng)用比較普遍的技術(shù),。
定量蛋白質(zhì)組學(xué)方法學(xué)介紹:iTRAQ:iTRAQ定量是目前定量蛋白質(zhì)組學(xué)應(yīng)用比較普遍的技術(shù),,該技術(shù)的關(guān)鍵原理是多肽標(biāo)記和定量,將多肽的含量轉(zhuǎn)化為114,、115,、116和117同位素的含量(或113、114、115,、116,、117、118,、119和121的8標(biāo)記),,從而簡(jiǎn)化了定量的復(fù)雜性,然后通過(guò)多肽定量值回歸到蛋白的定量值,,從而測(cè)定出不同樣本之間蛋白質(zhì)的差異,。iTRAQ定量不依賴樣本,可檢測(cè)出較低豐度蛋白,,胞漿蛋白,、膜蛋白、胞外蛋白等,,且定量準(zhǔn)確,,可同時(shí)對(duì)8個(gè)樣本進(jìn)行分析,并可同時(shí)得出鑒定和定量的結(jié)果,,特別適用于采用多種處理方式或來(lái)自多個(gè)處理時(shí)間的樣本的差異蛋白分析,。
蛋白質(zhì)組學(xué)概念:蛋白質(zhì)組學(xué)(英語(yǔ):proteomics,又譯作蛋白質(zhì)體學(xué)),,是以蛋白質(zhì)組為研究對(duì)象,,研究細(xì)胞、組織或生物體蛋白質(zhì)組成及其變化規(guī)律的科學(xué),。蛋白質(zhì)組(Proteome)一詞,,源于蛋白質(zhì)(protein)與基因組(genome)兩個(gè)詞的組合,意指“一種基因組所表達(dá)的全套蛋白質(zhì)”,,即包括一種細(xì)胞乃至一種生物所表達(dá)的全部蛋白質(zhì),。蛋白質(zhì)組學(xué)本質(zhì)上指的是在大規(guī)模水平上研究蛋白質(zhì)的特征,包括蛋白質(zhì)的表達(dá)水平,,翻譯后的修飾,,蛋白與蛋白相互作用等,由此獲得蛋白質(zhì)水平上的關(guān)于疾病發(fā)生,,細(xì)胞代謝等過(guò)程的整體而全方面的認(rèn)識(shí),。蛋白質(zhì)組學(xué)包括蛋白質(zhì)的表達(dá)水平。
定量蛋白質(zhì)組學(xué)的方法學(xué)背景和意義:從生命活動(dòng)的直接執(zhí)行者——蛋白質(zhì)的角度研究生命現(xiàn)象和規(guī)律(特別是疾病防治和病理研究)已成為研究生命科學(xué)的主要手段,。而這些研究往往離不開(kāi)對(duì)細(xì)胞,、組織中含有蛋白質(zhì)種類(lèi)和表達(dá)量的研究。對(duì)處不同時(shí)期,、不同條件下蛋白質(zhì)表達(dá)水平變化的研究,,識(shí)別功能模塊和路徑,,監(jiān)控疾病的生物標(biāo)志物,這些研究都需要對(duì)蛋白質(zhì)進(jìn)行鑒定和定量,。生物質(zhì)譜技術(shù)的出現(xiàn)和不斷成熟為蛋白質(zhì)差異表達(dá)分析提供了更可靠,、動(dòng)態(tài)范圍更廣的研究手段?;谫|(zhì)譜技術(shù),,科學(xué)家們不斷開(kāi)發(fā)出新的定量蛋白質(zhì)組學(xué)方法,來(lái)了解細(xì)胞,、組織或生物體的整體蛋白質(zhì)動(dòng)力學(xué),。蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)的本質(zhì)(從分析化學(xué)角度來(lái)看),就是對(duì)蛋白質(zhì)的定性定量分析,。哈爾濱蛋白質(zhì)定量組學(xué)研究方法
蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)的發(fā)展已經(jīng)成為現(xiàn)代的生物技術(shù)快速發(fā)展的重要支撐,。江蘇外泌體蛋白質(zhì)組學(xué)價(jià)錢(qián)
蛋白質(zhì)組學(xué),指對(duì)某一基因組所表達(dá)的所有蛋白質(zhì)及其特征進(jìn)行大規(guī)模,、系統(tǒng)化地研究,,以期望在蛋白質(zhì)水平上解釋控制復(fù)雜的生命活動(dòng)的分子網(wǎng)絡(luò)。研究的內(nèi)容主要包括:組成蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)氨基酸的序列特征,、蛋白質(zhì)的豐度,、蛋白質(zhì)活性、蛋白質(zhì)的修飾,、亞細(xì)胞定位和三維結(jié)構(gòu),、蛋白質(zhì)之間的相互作用以及對(duì)蛋白質(zhì)的高階復(fù)合物結(jié)構(gòu),。質(zhì)譜技術(shù)的發(fā)展為這些研究提供了有力的技術(shù)支撐,,使得許多有實(shí)際應(yīng)用的蛋白質(zhì)組功能研究成為可能,包括翻譯后修飾的整體分析,,蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)的重建和模式生物蛋白表達(dá)譜的定量研究,;在臨床醫(yī)學(xué)和轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究中也越來(lái)越多地應(yīng)用到蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)。江蘇外泌體蛋白質(zhì)組學(xué)價(jià)錢(qián)
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