蛋白質(zhì)學(xué)組翻譯后修飾的類(lèi)型:翻譯后修飾的類(lèi)型包括N端fMet或Met的去除、二硫鍵的形成,、化學(xué)修飾和肽鍵的裂解,,其中磷酸化是比較常見(jiàn)的。蛋白質(zhì)的化學(xué)修飾反應(yīng)是在維持蛋白質(zhì)的完整性和功能性的基礎(chǔ)上,,通過(guò)基于其氨基酸殘基的化學(xué)反應(yīng)獲得新的生物結(jié)合物,。翻譯后修飾在哪里發(fā)生?翻譯后修飾主要發(fā)生在氨基酸側(cè)鏈或蛋白質(zhì)的C端或N端?,F(xiàn)有的官能團(tuán)或新官能團(tuán)的引入可被用于修飾蛋白質(zhì),,以擴(kuò)展20個(gè)標(biāo)準(zhǔn)氨基酸的化學(xué)組成。翻譯后修飾的位點(diǎn)通常帶有可以在化學(xué)反應(yīng)中充當(dāng)親核試劑的官能團(tuán),如絲氨酸,、蘇氨酸和酪氨酸的羥基,;賴氨酸、精氨酸和組氨酸胺形式,;同時(shí),,在蛋白質(zhì)的N端和C端,天冬酰胺也可作為翻譯后修飾中的一種聚糖連接點(diǎn),。翻譯后修飾也發(fā)生在氧化的蛋氨酸和側(cè)鏈位點(diǎn)的一些亞甲基上,。蛋白質(zhì)翻譯后修飾可以改變蛋白質(zhì)的物理、化學(xué)性質(zhì),。貴陽(yáng)氧化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)分析
蛋白質(zhì)學(xué)組翻譯后修飾自下而上分析策略:常用的糖蛋白分離和富集技術(shù)有:a. 凝集素親和技術(shù),;b. 肼化學(xué)富集;c. 親水性相互作用色譜法,;d. β-消除/邁克爾加成反應(yīng),。基于質(zhì)譜的糖蛋白鑒定和糖基化位點(diǎn)測(cè)定方法有:a. PNGase F酶法,;b. Endo H酶法,;c. 三氟甲烷磺酸(TFMS)法。泛素化:泛素是一種由76個(gè)氨基酸組成的多肽,,在真核生物中高度保守,,可通過(guò)異肽鍵與目標(biāo)蛋白賴氨酸殘基的氨基進(jìn)行共價(jià)連接。泛素化蛋白的富集主要基于標(biāo)記,,泛素用親和標(biāo)簽(通常為6xHis)進(jìn)行標(biāo)記,,并通過(guò)鎳螯合色譜親和提取泛素化蛋白。由于泛素的C端為Arg-Gly-Gly結(jié)構(gòu),,經(jīng)胰蛋白酶水解后,,Gly-Gly保留在修飾蛋白的肽鏈上,使肽的質(zhì)量增加114,,因此可作為泛素定位位點(diǎn)的質(zhì)量標(biāo)記,。用HPLC對(duì)樣品進(jìn)行預(yù)分離,使用針對(duì)特定殘留結(jié)構(gòu)的抗體富集泛素化肽,,可很大程度上提高泛素化蛋白的濃度,。串聯(lián)質(zhì)譜可以鑒定泛素化位點(diǎn)。河南琥珀?;揎椀鞍踪|(zhì)組學(xué)質(zhì)譜鑒定蛋白質(zhì)翻譯后修飾是指對(duì)翻譯后的蛋白質(zhì)進(jìn)行共價(jià)加工的過(guò)程,。
蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué):血漿蛋白糖基化修飾分析:蛋白質(zhì)糖基化指碳水化合物通過(guò)共翻譯或翻譯后修飾的方式附著到蛋白質(zhì)上的過(guò)程,是一種常見(jiàn)的蛋白質(zhì)翻譯后修飾,。分泌的細(xì)胞外蛋白常被糖基化,,糖基化蛋白通常是重要的整合膜蛋白,。血漿中的蛋白質(zhì)包括維持機(jī)體正常生理狀態(tài)的蛋白質(zhì)和機(jī)體分泌、滲漏,、脫落的蛋白質(zhì),,其中不乏存在一些糖基化蛋白質(zhì)。而蛋白質(zhì)糖基化修飾不只影響蛋白質(zhì)的空間構(gòu)象,、生物活性,、運(yùn)輸和定位,而且在分子識(shí)別,、細(xì)胞通信,、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)等特定生物過(guò)程中發(fā)揮著至關(guān)重要的作用。因此對(duì)血漿蛋白糖基化進(jìn)行分析,,有助于研究血漿蛋白的生理功能等,。
翻譯后修飾蛋白組分析:蛋白質(zhì)翻譯后修飾是影響蛋白質(zhì)功能并調(diào)節(jié)整個(gè)細(xì)胞過(guò)程的重要方式,,幾乎在每個(gè)細(xì)胞過(guò)程中都是不可或缺的,。分析和鑒定翻譯后修飾蛋白質(zhì)對(duì)揭示蛋白質(zhì)的功能和深入了解各種生理現(xiàn)象具有重要意義。大多數(shù)翻譯后修飾蛋白以低化學(xué)計(jì)量和豐度存在,,這限制了在分析全細(xì)胞裂解液時(shí)對(duì)其的檢測(cè),。因此,要在蛋白質(zhì)組學(xué)的范圍內(nèi)表征翻譯后修飾蛋白,,純化方法是必要的,,以分離修飾蛋白和肽段,然后再進(jìn)行后續(xù)分析,。后續(xù)分析一般采用質(zhì)譜技術(shù)進(jìn)行,,可以對(duì)翻譯后修飾蛋白組進(jìn)行定性和定量研究,。蛋白質(zhì)的翻譯后修飾通過(guò)可逆的共價(jià)鍵將小分子或蛋白質(zhì)與底物蛋白質(zhì)上特定的氨基酸結(jié)合,。
蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學(xué):磷酸化蛋白質(zhì)是由蛋白激酶將ATP或GTP分子上的磷酸基團(tuán)轉(zhuǎn)移到底物蛋白特定的氨基酸側(cè)鏈上形成的,。蛋白質(zhì)磷酸化是一種可逆的蛋白質(zhì)翻譯后修飾,。在哺乳動(dòng)物的細(xì)胞生命周期中,,至少有三分之一的蛋白質(zhì)發(fā)生磷酸化修飾,。磷酸化修飾參與許多信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑和細(xì)胞代謝過(guò)程,,且許多已知的疾病也與蛋白質(zhì)的異常磷酸化有關(guān),。因此,,對(duì)磷酸化蛋白質(zhì)組進(jìn)行定量研究,,尋找差異表達(dá)的磷酸化蛋白質(zhì),,有助于發(fā)現(xiàn)疾病的生物標(biāo)志物和尋找新的具有診療潛力的藥物靶標(biāo),。泛素化修飾是一種重要的翻譯后修飾,。北京糖基化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)方法
質(zhì)譜可以用于已知和未知的翻譯后修飾檢測(cè)。貴陽(yáng)氧化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)分析
蛋白質(zhì)磷酸化修飾定義,?在哺乳動(dòng)物細(xì)胞生命周期中,,大約有1/3的蛋白質(zhì)發(fā)生過(guò)磷酸化修飾,,在脊椎動(dòng)物基因中,,約有5%的基因編碼的蛋白質(zhì)是參與磷酸化和去磷酸化過(guò)程的蛋白激酶和磷酸酶,。它可以通過(guò)激發(fā),、調(diào)節(jié)諸多信號(hào)通路進(jìn)而參與調(diào)控生物體的生長(zhǎng),、發(fā)育,、逆境應(yīng)激,、疾病發(fā)生等多種生命過(guò)程,,一直是生物學(xué)研究的重點(diǎn)與熱點(diǎn),。蛋白磷酸化是指在激酶催化作用下把ATP或者GTP的磷酸基團(tuán)(P04)轉(zhuǎn)移到不同種類(lèi)的氨基酸上(主要包括絲氨酸S,、蘇氨酸T,、酪氨酸Y),,從而使蛋白質(zhì)發(fā)生翻譯后修飾的過(guò)程,。貴陽(yáng)氧化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)分析
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