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廣東甲基化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)有哪些類型

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-04-07

蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)是什么,?蛋白質(zhì)翻譯后修飾是指蛋白質(zhì)在翻譯中或翻譯后經(jīng)歷的一個(gè)共價(jià)加工過程,,即通過1個(gè)或幾個(gè)氨基酸殘基加上修飾基團(tuán)或通過蛋白質(zhì)水解剪去基團(tuán)而改變蛋白質(zhì)的性質(zhì),。蛋白質(zhì)氨基酸序列的特定位置可以與化學(xué)基團(tuán)或者小分子量的蛋白共價(jià)結(jié)合從而發(fā)生蛋白質(zhì)翻譯后修飾(post-translational modifications,PTMs),,相較于沒有發(fā)生修飾的蛋白,,PTMs會(huì)導(dǎo)致特定序列分子量的增加。在蛋白翻譯后修飾方式的鑒定過程中,,蛋白會(huì)首先被酶切成肽段,,然后進(jìn)入質(zhì)譜進(jìn)行分析;通過質(zhì)譜分析,,得到的是一系列肽段的分子質(zhì)量信息,。對(duì)于某一個(gè)特定肽段而言,在沒有發(fā)生任何翻譯后修飾的情況下,,其序列信息和分子量是確定的,。蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)有什么重要的作用呢?廣東甲基化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)有哪些類型

蛋白質(zhì)糖基化修飾組學(xué)技術(shù)怎么確定位點(diǎn),?蛋白質(zhì)經(jīng)過酶解后利用凝集素(lectin)富集N-糖基化肽段,,然后用N-糖酰胺酶(PNGase)在H218O中切除連接在天冬酰胺殘基(Asn)上的糖鏈。該處理致使Asn分子量增加2.9890Da,。之后用高精度LC-MS質(zhì)譜儀檢測(cè)脫糖后的肽段,并通過MASCOT軟件檢索數(shù)據(jù)庫(kù),,確認(rèn)脫糖后分子量與其理論分子量的變化以及糖基化修飾肽段的序列,,從而確定該蛋白質(zhì)的N-糖基化位點(diǎn)。琥珀?;揎椀鞍踪|(zhì)組技術(shù)特點(diǎn):采用主流抗體親和富集方法,,特異性高,富集效率好,。山東蛋白質(zhì)棕櫚?;揎椊M學(xué)有哪些類型乙酰化修飾組學(xué)技術(shù)服務(wù)采用肽段預(yù)分離降低高豐度組蛋白對(duì)蛋白乙?;b定的影響,。

蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用是蛋白質(zhì)發(fā)揮功能的主要機(jī)制之一,在DNA損傷修復(fù),自噬和代謝等過程中都扮演著非常重要的角色,蛋白相互作用異常便會(huì)導(dǎo)致疾病的發(fā)生.在蛋白質(zhì)的賴氨酸,絲氨酸和蘇氨酸等氨基酸殘基上,可發(fā)生甲基化,乙酰化,磷酸化和泛素化等200多種翻譯后修飾,這些修飾通常能改變蛋白質(zhì)的電性,疏水性和空間結(jié)構(gòu)等屬性,為與之結(jié)合的蛋白提供結(jié)合的錨定或產(chǎn)生位阻效應(yīng),像一把開關(guān)在時(shí)空上精確調(diào)控蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用的發(fā)生以及動(dòng)態(tài)變化.結(jié)構(gòu)研究表明,蛋白質(zhì)之間的相互作用通常由臨近的幾個(gè)氨基酸殘基直接結(jié)合,替換該區(qū)域的氨基酸殘基,通常能破壞結(jié)合,使其失去部分功能或酶活性,可以針對(duì)性地開發(fā)和設(shè)計(jì)抑制劑,用于疾病的診療,。

磷酸化修飾蛋白質(zhì)組學(xué):磷酸化修飾蛋白質(zhì)組的研究主要集中于真核生物中普遍存在的絲氨酸,、蘇氨酸和酪氨酸的磷酸化。由于體內(nèi)磷酸化蛋白的含量很低,,因此在分析前必須對(duì)其進(jìn)行分離和富集,。目前,常用的磷酸化蛋白質(zhì)的分離和富集技術(shù)包括固定化金屬親和色譜,、免疫沉淀,、強(qiáng)陽(yáng)離子交換色譜,、強(qiáng)陰離子交換色譜、反相色譜等,。這些技術(shù)被整合和優(yōu)化用于不同生物樣品的磷酸化蛋白質(zhì)組分析,。翻譯后修飾分析自中而下分析策略:自中而下的蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)可用于組蛋白修飾的分析。樣品制備與普遍使用的自下而上的分析策略相同,,直到得到純化的組蛋白,。提取組蛋白后,用GluC進(jìn)行消化,。然后用弱陽(yáng)離子交換/親水相互作用色譜與配備電子轉(zhuǎn)移解離(的高分辨率質(zhì)譜聯(lián)機(jī)聯(lián)用,,對(duì)樣品進(jìn)行理想的分離。譜識(shí)別可以用傳統(tǒng)的軟件進(jìn)行,,但是由于估計(jì)適當(dāng)?shù)腻e(cuò)誤發(fā)現(xiàn)率的問題,,需要對(duì)結(jié)果進(jìn)行過濾。蛋白質(zhì)發(fā)生翻譯后修飾時(shí)其分子質(zhì)量會(huì)發(fā)生響應(yīng)的改變,,通過質(zhì)譜能夠精確測(cè)定蛋白質(zhì)或多肽的分子質(zhì)量,。

蛋白質(zhì)翻譯后修飾在蛋白質(zhì)中磷酸化位點(diǎn)分析時(shí)應(yīng)該注意些什么問題?覆蓋率:覆蓋率越高,,檢測(cè)和鑒定含有修飾基團(tuán)的肽幾率就越大,。修飾位點(diǎn)的占有率:被修飾的蛋白質(zhì)的百分比低,則檢測(cè)到修飾肽的機(jī)會(huì)會(huì)隨之減少,。如果百分比較高(> 30%),,則有助于識(shí)別修飾位點(diǎn)。棕櫚?;鞍仔揎椯|(zhì)譜鑒定方法:S-棕櫚?;闹饕δ苁谴龠M(jìn)蛋白質(zhì)與細(xì)胞膜的結(jié)合。蛋白質(zhì)可以由一個(gè)棕櫚?;M成,,也可以與更多棕櫚基或與其他脂質(zhì),如豆蔻?;?。由于對(duì)S-棕櫚酰化蛋白分析仍然具有挑戰(zhàn)性,,由于S-棕櫚?;揎椀鞍讈喫揭约笆杷院蜐撛诓环€(wěn)定的硫代質(zhì)鏈的S-脂酰化肽?,F(xiàn)在常用的幾種方法可以捕獲S-脂?;鞍滓约皩?duì)目標(biāo)修飾蛋白進(jìn)行捕獲。翻譯后修飾是指對(duì)翻譯后的蛋白質(zhì)進(jìn)行共價(jià)加工的過程。山東蛋白質(zhì)棕櫚?;揎椊M學(xué)有哪些類型

乙?;揎椀鞍捉M學(xué)應(yīng)用方向有什么?廣東甲基化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)有哪些類型

蛋白質(zhì)糖基化修飾組學(xué)技術(shù)服務(wù):糖基化是在酶的控制下,蛋白質(zhì)或脂質(zhì)附加上糖類的過程,發(fā)生于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)和高爾基體等部位,。在糖基轉(zhuǎn)移酶作用下將糖轉(zhuǎn)移至蛋白質(zhì),和蛋白質(zhì)上的氨基酸殘基共價(jià)結(jié)合,。蛋白質(zhì)經(jīng)過糖基化作用,形成糖蛋白。糖基化是對(duì)蛋白的重要的修飾作用,有調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)功能作用,。凝素親和法是目前糖蛋白質(zhì)組學(xué)中應(yīng)用比較普遍的分離富集方法,。凝集素(lectin)是一類糖結(jié)合蛋白質(zhì),能專一識(shí)別某一特殊結(jié)構(gòu)的單糖或聚糖中特定的糖基序列而與之結(jié)合,,它們與糖鏈可逆非共價(jià)結(jié)合,,糖蛋白或糖肽被凝集素捕獲之后,通常用特定的單糖通過競(jìng)爭(zhēng)結(jié)合凝集素將糖蛋白或糖肽洗脫下來,。廣東甲基化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)有哪些類型