定量蛋白質(zhì)組學(xué)方法學(xué)介紹:iTRAQ:iTRAQ定量是目前定量蛋白質(zhì)組學(xué)應(yīng)用比較普遍的技術(shù),,該技術(shù)的關(guān)鍵原理是多肽標(biāo)記和定量,,將多肽的含量轉(zhuǎn)化為114、115,、116和117同位素的含量(或113,、114、115,、116,、117,、118、119和121的8標(biāo)記),,從而簡化了定量的復(fù)雜性,,然后通過多肽定量值回歸到蛋白的定量值,從而測定出不同樣本之間蛋白質(zhì)的差異,。iTRAQ定量不依賴樣本,,可檢測出較低豐度蛋白,胞漿蛋白,、膜蛋白,、胞外蛋白等,且定量準(zhǔn)確,,可同時(shí)對(duì)8個(gè)樣本進(jìn)行分析,并可同時(shí)得出鑒定和定量的結(jié)果,,特別適用于采用多種處理方式或來自多個(gè)處理時(shí)間的樣本的差異蛋白分析,。近兩年來蛋白質(zhì)組研究技術(shù)已被應(yīng)用到各種生命科學(xué)領(lǐng)域,如細(xì)胞生物學(xué),、神經(jīng)生物學(xué)等,。湖北醫(yī)學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法
蛋白質(zhì)組研究內(nèi)容:1.蛋白質(zhì)鑒定:可以利用一維電泳和二維電泳并結(jié)合Western等技術(shù),利用蛋白質(zhì)芯片和抗體芯片及免疫共沉淀等技術(shù)對(duì)蛋白質(zhì)進(jìn)行鑒定研究,。2.翻譯后修飾:很多mRNA表達(dá)產(chǎn)生的蛋白質(zhì)要經(jīng)歷翻譯后修飾如磷酸化,,糖基化,酶原刺激等,。翻譯后修飾是蛋白質(zhì)調(diào)節(jié)功能的重要方式,,因此對(duì)蛋白質(zhì)翻譯后修飾的研究對(duì)闡明蛋白質(zhì)的功能具有重要作用?;?受體結(jié)合分析,。可以利用基因敲除和反義技術(shù)分析基因表達(dá)產(chǎn)物-蛋白質(zhì)的功能,。另外對(duì)蛋白質(zhì)表達(dá)出來后在細(xì)胞內(nèi)的定位研究也在一定程度上有助于蛋白質(zhì)功能的了解,。深圳定量乙酰化蛋白質(zhì)組學(xué)檢測多少錢在對(duì)早老性癡呆等人類重大疾病的臨床診斷和治理方面蛋白質(zhì)組技術(shù)也有十分誘人的前景,。
PRM靶向蛋白質(zhì)組學(xué):產(chǎn)品分類:a.相對(duì)定量(目的同WB),。b.一定定量(目的同Elisa)。技術(shù)優(yōu)勢(shì):(1)無需抗體,,可直接對(duì)樣本中目標(biāo)蛋白質(zhì)進(jìn)行定量分析,。(2)高特異性、準(zhǔn)確度和靈敏度,,靶向檢測目標(biāo)蛋白對(duì)應(yīng)的多個(gè)unique肽段,。(3)通量高,,可以同時(shí)實(shí)現(xiàn)幾十個(gè)蛋白的定量檢測。樣本要求:動(dòng)物及臨床組織標(biāo)本100mg/sample,,血清,、血漿200μL/sample,細(xì)胞,、微生物1×107cells/sample,。應(yīng)用方向:驗(yàn)證修飾和非修飾定量蛋白組學(xué)結(jié)果;目標(biāo)蛋白相對(duì)定量和一定定量分析,。蛋白質(zhì)組學(xué)屬于后基因組時(shí)代的科學(xué)研究,,針對(duì)基因表達(dá)產(chǎn)物進(jìn)行檢測與定量。
蛋白質(zhì)組學(xué)在醫(yī)學(xué)的研究應(yīng)用:蛋白質(zhì)組學(xué)(Proteomics)是研究細(xì)胞,、組織或生物體中蛋白質(zhì)組成,、定位、變化及其相互作用規(guī)律的科學(xué),,包括對(duì)蛋白質(zhì)表達(dá)模式和蛋白質(zhì)組功能模式的研究,。蛋白質(zhì)組學(xué)的發(fā)展對(duì)尋找疾病的診斷標(biāo)志、篩選藥物靶點(diǎn),、毒理學(xué)研究等有重要意義,,也因此被普遍應(yīng)用于醫(yī)學(xué)研究。蛋白質(zhì)組學(xué)研究,,總體可分為一下幾個(gè)步驟:(1)差異篩選(Discovery)(2)初步驗(yàn)證(Verification)(3)然后確診(Validation),。基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)是目前比較主流的高通量蛋白質(zhì)研究手段,,當(dāng)前在醫(yī)療健康方面的應(yīng)用主要集中于基礎(chǔ)研究和轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué),。蛋白質(zhì)組學(xué)現(xiàn)已被普遍應(yīng)用于生命科學(xué)研究領(lǐng)域。
蛋白質(zhì)組學(xué):質(zhì)譜分析蛋白質(zhì)組學(xué)的基本原理主要是通過測定被測樣品離子的理化性質(zhì)來進(jìn)行分析,,根據(jù)樣品的質(zhì)量譜圖和相關(guān)信息從而得到定性和定量結(jié)果,。目前,蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜分析一般是根據(jù)保留時(shí)間(retentiontime),、質(zhì)荷比(m/z),、離子強(qiáng)度(intensity)這三個(gè)維度對(duì)肽蛋白質(zhì)進(jìn)行鑒定和定量,即3D蛋白質(zhì)組學(xué),。4D蛋白質(zhì)組學(xué)在3D蛋白質(zhì)組學(xué)的基礎(chǔ)之上增加了第四維度,,離子淌度(mobility),主要根據(jù)離子的形狀和截面對(duì)離子進(jìn)行分離,,能夠區(qū)分m/z差值非常小的肽段,,使低豐度蛋白信號(hào)能夠被區(qū)分和識(shí)別出來。4D蛋白質(zhì)組學(xué)基于timsTOFPro質(zhì)譜儀,,結(jié)合PASEF(ParallelAccumulationSerialFragmentation,,同步累積連續(xù)碎裂)與TIMS(TrappedIonMobilitySpectrometry,,離子遷移譜),可重復(fù)測量所有檢測離子的碰撞截面(CCS),,能更快,、更靈敏的進(jìn)行蛋白質(zhì)組定性和定量。蛋白質(zhì)組學(xué)在應(yīng)用中,,更多地用于提供高通量蛋白質(zhì)定性定量信息,。河南蛋白質(zhì)定量組學(xué)價(jià)錢
蛋白質(zhì)組學(xué)相關(guān)技術(shù)目前在一小部分]應(yīng)用中具有獨(dú)特優(yōu)勢(shì)。湖北醫(yī)學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法
定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù):定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)主要分為標(biāo)記(label)和非標(biāo)記(labelfree)定量策略,,標(biāo)記策略又分為體內(nèi)標(biāo)記和體外標(biāo)記兩種,。細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)組豐度的動(dòng)態(tài)變化對(duì)各種生命過程有重要影響。例如在許多疾病的發(fā)生和發(fā)展進(jìn)程中,,常常伴隨著某些蛋白質(zhì)的表達(dá)異常,。定量蛋白質(zhì)組學(xué)就是把一個(gè)基因組表達(dá)的全部蛋白質(zhì)或一個(gè)復(fù)雜的混合體系中所有的蛋白質(zhì)進(jìn)行精確的定量和鑒定。非標(biāo)記(labelfree)的定量蛋白組學(xué)技術(shù),,Labelfree定量蛋白組學(xué)技術(shù)是通過液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)對(duì)蛋白質(zhì)酶解肽段進(jìn)行質(zhì)譜分析,,無需使用昂貴的穩(wěn)定同位素標(biāo)簽做內(nèi)部標(biāo)準(zhǔn),只需分析大規(guī)模鑒定蛋白質(zhì)時(shí)所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù),,比較不同樣品中相應(yīng)肽段的信號(hào)強(qiáng)度,從而對(duì)肽段對(duì)應(yīng)的蛋白質(zhì)進(jìn)行相對(duì)定量,。湖北醫(yī)學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法