宏轉(zhuǎn)錄學(xué)組概念：宏轉(zhuǎn)錄組測序是對某一特定時期、特定環(huán)境樣品中的全部微生物的RNA進(jìn)行高通量測序,，直接獲得該環(huán)境中所有微生物轉(zhuǎn)錄組信息的一種測序技術(shù)的新應(yīng)用,。宏轉(zhuǎn)錄組中不只包含有微生物的物種信息，還有微生物的基因表達(dá)信息,。如果說宏基因組能告訴我們微生物群,，那么宏轉(zhuǎn)錄組則能告訴我們這些微生物，這有助于挖掘微生物功能基因和探索微生物與環(huán)境,、疾病,、動植物等關(guān)系的機(jī)制。宏轉(zhuǎn)錄組分析：從以G為單位的高通量測序數(shù)據(jù)中獲取研究所需的微生物種類,、基因,、通路等信息是進(jìn)行宏轉(zhuǎn)錄組研究必須經(jīng)歷的一步。現(xiàn)在網(wǎng)絡(luò)上分析組學(xué)數(shù)據(jù)的工具五花八門,。能否從眾多組學(xué)工具中選擇出適合分析宏轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的軟件,，能否搭建一套完整、快速,、高效,、靈敏、高精確的宏轉(zhuǎn)錄組分析pipline,，直接關(guān)乎到后期數(shù)據(jù)分析的進(jìn)行,。轉(zhuǎn)錄組具有組織特異性的特點(diǎn)。深圳circ RNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)

轉(zhuǎn)錄組學(xué)(Transcriptomics),，是一門在真整體水平上研究細(xì)胞中基因轉(zhuǎn)錄的情況及轉(zhuǎn)錄調(diào)控規(guī)律的學(xué)科,，從RNA水平研究基因的表達(dá)情況。轉(zhuǎn)錄組測序是通過二代測序平臺快速全方面地獲得某一物種特定細(xì)胞或組織在某一狀態(tài)下的幾乎所有的轉(zhuǎn)錄本及基因序列,，可以用來研究基因表達(dá)量,、基因功能、結(jié)構(gòu),、可變剪接和預(yù)測新的轉(zhuǎn)錄本等等,。轉(zhuǎn)錄組（transcriptome），是指特定生長階段某組織或細(xì)胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的匯合,，狹義上指所有mRNA的匯合,。轉(zhuǎn)錄組學(xué)即特定細(xì)胞在某一功能狀態(tài)下轉(zhuǎn)錄出來的所有RNA的總和，包括mRNA和非編碼RNA,。湖北高通量轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究內(nèi)容轉(zhuǎn)錄組學(xué)測序必須做生物學(xué)重復(fù)么,？

轉(zhuǎn)錄組學(xué)應(yīng)用領(lǐng)域：海洋水產(chǎn)：生長發(fā)育機(jī)制,，漁業(yè)資源，漁業(yè)環(huán)境與水產(chǎn)品安全等,；微生物：致病機(jī)理,，耐藥機(jī)制，病原體-宿主相互作用研究等,；生物醫(yī)藥：生物標(biāo)志物,，疾病機(jī)理機(jī)制，疾病分型,，藥物開發(fā),，個性化醫(yī)治等；環(huán)境科學(xué)：發(fā)酵過程優(yōu)化,，生物燃料生產(chǎn),，環(huán)境危害風(fēng)險評估研究等；食品科學(xué)：食品儲藏及加工條件優(yōu)化,，食品組分及品質(zhì)鑒定,，功能性食品開發(fā)，食品安全監(jiān)檢測等,。轉(zhuǎn)錄組是特定發(fā)育階段或生理?xiàng)l件下細(xì)胞內(nèi)的完整轉(zhuǎn)錄信息的匯合,，表示了基因表達(dá)的中間狀態(tài)。

轉(zhuǎn)錄組學(xué)測序結(jié)果的影響因素,？RNA的降解嚴(yán)重影響測序的質(zhì)量,，RNA降解后，加入poly-A后無法捕獲純化mRNA,，因此,，隨機(jī)引物反轉(zhuǎn)錄無法得到全部的cDNA，導(dǎo)致測序結(jié)果出現(xiàn)明顯的3‘-和5’-偏向,。文庫中的poly-A多聚物的存在會對測序信號產(chǎn)生干擾,，影響測序結(jié)果的準(zhǔn)確性；同時由于轉(zhuǎn)錄組中轉(zhuǎn)錄本的豐度不一致,，實(shí)驗(yàn)前需要對樣本進(jìn)行均一化處理,，否則高豐度的表達(dá)基因會掩蓋低豐度表達(dá)基因，導(dǎo)致尋找新基因失敗或者是獲得大量無意義的重復(fù)序列,。RNA-Seq轉(zhuǎn)錄組學(xué)有著巨大的應(yīng)用前景,。

轉(zhuǎn)錄組學(xué)：轉(zhuǎn)錄組學(xué)是研究特定的細(xì)胞、組織或個體在特定時間和狀態(tài)下所轉(zhuǎn)錄出所有RNA的學(xué)科,，轉(zhuǎn)錄組測序是指利用高通量測序方法,，研究特定的細(xì)胞、組織或個體在特定時間和狀態(tài)下所轉(zhuǎn)錄出的所有mRNA,，用于揭示不同功能狀態(tài)下的基因表達(dá),、結(jié)構(gòu)的差異,，闡明分子機(jī)制。應(yīng)用領(lǐng)域：醫(yī)學(xué)研究：疾病標(biāo)志物篩查,、疾病的診斷和分型、疾病復(fù)發(fā)診斷,、病因與病理機(jī)制探究,、臨床療效評價、藥物毒理學(xué)評價,。生命科學(xué)研究：非生物環(huán)境關(guān)系研究,、植物與微生物、在表型鑒定中的應(yīng)用,、代謝途徑及功能基因組研究,、藥用植物研究中的應(yīng)用。轉(zhuǎn)錄組學(xué)可應(yīng)用于基因點(diǎn)突變及多態(tài)性檢測,。湖北高通量轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究內(nèi)容

轉(zhuǎn)錄學(xué)組測序是目前深入研究轉(zhuǎn)錄組復(fù)雜性的強(qiáng)大工具,。深圳circ RNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)

轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的方法：轉(zhuǎn)錄組學(xué)是一門在整體水平上研究細(xì)胞中所有基因轉(zhuǎn)錄及轉(zhuǎn)錄調(diào)控規(guī)律的學(xué)科。在早期,，由于測序價格昂貴,、基因序列數(shù)目有限，轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究者只能進(jìn)行極少數(shù)特定基因的結(jié)構(gòu)功能分析和表達(dá)研究,。近十幾年,，分子生物學(xué)技術(shù)的快速發(fā)展使高通量分析成為可能，這為真正意義上的轉(zhuǎn)錄組學(xué)的研究奠定了基礎(chǔ),。這些高通量研究方法主要可以分為兩類：一類是基于這類方法包括表達(dá)序列標(biāo)簽技術(shù),、基因表達(dá)系列分析技術(shù)、大規(guī)模平行測序技術(shù),、RNA測序技術(shù)其中,。深圳circ RNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)