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北京靶向代謝組學(xué)服務(wù)

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-04-28

代謝組學(xué)研究方法:代謝組學(xué)的研究方法與蛋白質(zhì)組學(xué)的方法類(lèi)似,,通常有兩種方法,。一種方法稱(chēng)作代謝物指紋分析 (metabolomic fingerprinting),,采用液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用(LC-MS)的方法,比較不同血樣中各自的代謝產(chǎn)物以確定其中所有的代謝產(chǎn)物,。從本質(zhì)上來(lái)說(shuō),,代謝指紋分析涉及比較不同個(gè)體中代謝產(chǎn)物的質(zhì)譜峰,,然后了解不同化合物的結(jié)構(gòu),,建立一套完備的識(shí)別這些不同化合物特征的分析方法。另一種方法是代謝輪廓分析(metabolomic profiling),研究人員假定了一條特定的代謝途徑,,并對(duì)此進(jìn)行更深入的研究,。代謝組學(xué)的研究處于生物信息流的中游。北京靶向代謝組學(xué)服務(wù)

非靶向代謝組學(xué):非靶向代謝組學(xué)可用于檢測(cè)生物體內(nèi)大多數(shù)小分子代謝物的動(dòng)態(tài)變化,,通過(guò)數(shù)據(jù)處理,,多維統(tǒng)計(jì)和數(shù)學(xué)建模來(lái)分析生物擾動(dòng)下的代謝指紋圖譜。尋找兩組間發(fā)生明顯變化的差異代謝物,,富集差異代謝通路,, 獲得整個(gè)生物體的代謝輪廓。 技術(shù)優(yōu)勢(shì): 1,、代謝組學(xué)能放大基因組和蛋白組的微小變化,,具有較高的靈敏度、分辨率,; 2,、具有較寬的動(dòng)態(tài)檢測(cè)范圍;3,、相比于基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué),,檢測(cè)費(fèi)用更為低廉;4,、代謝組學(xué)比較貼近生物體表型,,能更直接、準(zhǔn)確地反映生物體的生理病理狀態(tài),,適合于生物樣本中潛在標(biāo)志物的篩選,,疾病分期等。武漢植物靶向代謝組學(xué)分析方法代謝組學(xué)技術(shù)可應(yīng)用于疾病早期診斷,。

代謝組學(xué)的研究領(lǐng)域有哪些,?1、疾病機(jī)制研究,。2,、疾病診斷與防治。3,、新藥篩選和開(kāi)發(fā),。4,、藥物作用機(jī)制的研究。5,、藥物毒性評(píng)價(jià),。6、植物的細(xì)胞代謝組學(xué)研究,。7,、微生物代謝組學(xué)研究。代謝組能夠檢測(cè)到的代謝物含量是多少,?不同檢測(cè)平臺(tái)的靈敏度不一樣,,靈敏度比較高,可達(dá)到fM級(jí),。另外,,相同含量的不同物質(zhì),由于自身化學(xué)性質(zhì)不同,,質(zhì)譜的離子化效率,、信號(hào)響應(yīng)強(qiáng)度會(huì)差異很大。物質(zhì)的檢測(cè)靈敏度跟自身的化學(xué)性質(zhì)有關(guān),,化學(xué)性質(zhì)的影響主要表現(xiàn)在離子化效率和質(zhì)譜碎裂行為兩方面,。因此,相同含量的不同物質(zhì),,可能一個(gè)能檢測(cè)出來(lái),,另一個(gè)檢測(cè)不出來(lái)。

代謝組學(xué)尿液樣本收集:1)取空腹晨尿,、中段尿(臨床)或晨間1 h尿(動(dòng)物)于50 mL離心管中,;2)4 ℃ 下10000 rpm離心10 min取上清,用1.5 mL離心管分裝,,保存于-80 ℃,。3)動(dòng)物1 h尿量不夠的情況下,可分多次收集尿液,;如需收取24 h尿液,,需要使用帶低溫裝置的代謝籠收集,并且及時(shí)凍存樣本,。4)收集完尿液樣本后,,建議使用液氮淬滅15 min后,再分裝多管后于-80 ℃凍存,。組織樣本收集:動(dòng)物組織(包括腦,、心、肝,、脾,、肺,、腎、肌肉和皮膚等,;軟體動(dòng)物如血吸蟲(chóng)):1)取適量組織,,用預(yù)冷的PBS緩沖液或生理鹽水清洗干凈;2)迅速剝?nèi)シ潜匦璧闹竞徒Y(jié)締組織,,再用PBS緩沖液或生理鹽水沖洗干凈,;3)用干凈的無(wú)塵吸水紙吸干水分,將組織分成50-100 mg / 管分裝待用,;4)管子上做好標(biāo)記后迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min,,-80 ℃凍存;干冰運(yùn)輸,。靶向代謝組學(xué)著重對(duì)于設(shè)定好的目標(biāo)代謝物進(jìn)行定性、量檢測(cè)分析和研究,。

代謝組學(xué)細(xì)胞樣本收集:懸浮細(xì)胞:1)連同培養(yǎng)基轉(zhuǎn)移到1.5 mL的進(jìn)口離心管中,。2)低速離心5 min(低于3000 rpm),使細(xì)胞沉淀于離心管的底部(1*107個(gè)細(xì)胞為宜),。3)倒掉培養(yǎng)基(盡量倒干凈),,用預(yù)冷的PBS反復(fù)沖洗2 ~ 3次,低速離心5 min,,棄上清,。4)標(biāo)記離心管,將離心管的尖的一端插入液氮中,,淬滅細(xì)胞沉淀1 min,,-80 ℃凍存,干冰寄送,。注意事項(xiàng):1. 培養(yǎng)基傾倒時(shí)盡量倒干凈,,可使用濾紙將殘留培養(yǎng)液吸凈;2. 甲醇/水請(qǐng)使用色譜純及以上規(guī)格,;3. 液氮淬滅細(xì)胞時(shí),,請(qǐng)小心避免離心管破碎導(dǎo)致樣本受損;4. 建議細(xì)胞樣本在進(jìn)行培養(yǎng)時(shí)多準(zhǔn)備樣本,以備后續(xù)使用,。與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比,, 代謝組學(xué)的研究側(cè)重于相關(guān)特定組分的共性。武漢植物靶向代謝組學(xué)分析方法

為什么選擇代謝組學(xué)作為科研技術(shù)手段,?北京靶向代謝組學(xué)服務(wù)

代謝組學(xué)樣本收集注意事項(xiàng):1.對(duì)于動(dòng)物組織樣本無(wú)法滿(mǎn)足50mg/樣,,如海馬組織,大腦組織等,,可考慮同組混樣以達(dá)到50mg/樣的要求,。2.對(duì)于含水量高的果實(shí)進(jìn)行取樣很難保持高度均一性(如番茄的果皮,、果肉等),建議將整個(gè)果實(shí)進(jìn)行液氮研磨后凍干混勻,,對(duì)混勻后的粉末進(jìn)行稱(chēng)重分裝,,凍存。3.盡量不要使用錫箔紙以及自封袋包裝樣本,,建議將樣本液氮研磨后使用離心管/凍存管進(jìn)行分裝,。4.在使用PBS緩沖液/超純水進(jìn)行漂洗時(shí),需要盡快處理,。5.植物各類(lèi)組織樣本建議都使用超純水進(jìn)行漂洗完之后,,再研磨分裝凍存,防止因種植過(guò)程中施加的一些肥料,、農(nóng)藥等含有表面活性劑或其他雜質(zhì),,對(duì)后續(xù)實(shí)驗(yàn)造成影響。北京靶向代謝組學(xué)服務(wù)