蛋白質(zhì)組研究內(nèi)容:1.蛋白質(zhì)鑒定:可以利用一維電泳和二維電泳并結(jié)合Western等技術(shù),,利用蛋白質(zhì)芯片和抗體芯片及免疫共沉淀等技術(shù)對蛋白質(zhì)進(jìn)行鑒定研究,。2.翻譯后修飾:很多mRNA表達(dá)產(chǎn)生的蛋白質(zhì)要經(jīng)歷翻譯后修飾如磷酸化,糖基化,酶原刺激等,。翻譯后修飾是蛋白質(zhì)調(diào)節(jié)功能的重要方式,,因此對蛋白質(zhì)翻譯后修飾的研究對闡明蛋白質(zhì)的功能具有重要作用,?;?受體結(jié)合分析??梢岳没蚯贸头戳x技術(shù)分析基因表達(dá)產(chǎn)物-蛋白質(zhì)的功能,。另外對蛋白質(zhì)表達(dá)出來后在細(xì)胞內(nèi)的定位研究也在一定程度上有助于蛋白質(zhì)功能的了解。蛋白質(zhì)組學(xué)的分析主要指蛋白的生信分析,,依賴于數(shù)據(jù)庫的建立,。浙江DIA定量蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域
LabelFree(非標(biāo)記蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)):在非標(biāo)記策略的定量模型中,主要涉及兩種不同的算法:其一,以肽段的色譜峰積分面積為基礎(chǔ),,通過比較一對生物樣品中相對應(yīng)到蛋白質(zhì)酶解多肽的色譜積分面積而得到兩者的相對豐度,;其二,以肽段被質(zhì)譜檢測的計數(shù)為基礎(chǔ),,通過歸一化來表征被檢測蛋白質(zhì)的相對豐度,。非標(biāo)記技術(shù)認(rèn)為肽段在質(zhì)譜中被捕獲檢測的頻率(Counts)與其在混合物中的豐度成正相關(guān),因此蛋白質(zhì)被質(zhì)譜檢測的計數(shù)反映了蛋白質(zhì)的豐度,,通過適當(dāng)?shù)臄?shù)學(xué)公式可以將質(zhì)譜檢測計數(shù)與蛋白質(zhì)的量聯(lián)系起來,,從而對蛋白質(zhì)進(jìn)行定量。廣州常規(guī)蛋白質(zhì)組學(xué)鑒定蛋白質(zhì)組意指“一種基因組所表達(dá)的全套蛋白質(zhì)”,,即包括一種細(xì)胞乃至一種生物所表達(dá)的全部蛋白質(zhì),。
蛋白質(zhì)組學(xué):蛋白質(zhì)組一詞,源于蛋白質(zhì)與基因組兩個詞的組合,,意指“一種基因組所表達(dá)的全套蛋白質(zhì)”,即包括一種細(xì)胞乃至一種生物所表達(dá)的全部蛋白質(zhì),。蛋白質(zhì)組學(xué)本質(zhì)上指的是在大規(guī)模水平上研究蛋白質(zhì)的特征,,包括蛋白質(zhì)的表達(dá)水平,翻譯后的修飾,,蛋白與蛋白相互作用等,,由此獲得蛋白質(zhì)水平上的關(guān)于疾病發(fā)生,細(xì)胞代謝等過程的整體而全方面的認(rèn)識,。蛋白質(zhì)組的研究不只能為生命活動規(guī)律提供物質(zhì)基礎(chǔ),,也能為眾多種疾病機理的闡明及攻克提供理論根據(jù)和解決途徑。通過對正常個體及病理個體間的蛋白質(zhì)組比較分析,,我們可以找到某些“疾病特異性的蛋白質(zhì)分子”,,它們可成為新藥物設(shè)計的分子靶點,或者也會為疾病的早期診斷提供分子標(biāo)志,。確實,,那些世界范圍內(nèi)銷路*的藥物本身是蛋白質(zhì)或其作用靶點為某種蛋白質(zhì)分子。因此,,蛋白質(zhì)組學(xué)研究不只是探索生命奧秘的必須工作,,也能為人類健康事業(yè)帶來巨大的利益。
蛋白質(zhì)組的研究不但能為生命活動規(guī)律提供物質(zhì)基礎(chǔ),,也能為眾多種疾病機理的闡明及攻克提供理論根據(jù)和解決途徑,。通過對正常個體及病理個體間的蛋白質(zhì)組比較分析,我們可以找到某些“疾病特異性的蛋白質(zhì)分子”,,它們可成為新藥物設(shè)計的分子靶點,,或者也會為疾病的早期診斷提供分子標(biāo)志。確實,那些世界范圍內(nèi)銷路比較好的藥物本身是蛋白質(zhì)或其作用靶點為某種蛋白質(zhì)分子,。因此,,蛋白質(zhì)組學(xué)研究不只是探索生命奧秘的必須工作,也能為人類健康事業(yè)帶來巨大的利益,。蛋白質(zhì)組學(xué)的研究是生命科學(xué)進(jìn)入后基因時代的特征,。對人類而言,蛋白質(zhì)組學(xué)的研究終究要服務(wù)于人類的健康,。
常用的定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)方法有以下幾類:非標(biāo)記(labelfree)的定量蛋白組學(xué)技術(shù):Label free定量蛋白組學(xué)技術(shù)是通過液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)對蛋白質(zhì)酶解肽段進(jìn)行質(zhì)譜分析,,無需使用昂貴的穩(wěn)定同位素標(biāo)簽做內(nèi)部標(biāo)準(zhǔn),只需分析大規(guī)模鑒定蛋白質(zhì)時所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù),,比較不同樣品中相應(yīng)肽段的信號強度,,從而對肽段對應(yīng)的蛋白質(zhì)進(jìn)行相對定量。TMT定量蛋白組學(xué)技術(shù):這種技術(shù)采用多個(2-10)穩(wěn)定同位素標(biāo)簽,,特異性標(biāo)記多肽的氨基基團(tuán)進(jìn)行串聯(lián)質(zhì)譜分析,,能夠同時比較多達(dá)10種不同樣本中蛋白質(zhì)的相對含量,可用于研究不同病理條件下或者不同發(fā)育階段的組織樣品中蛋白質(zhì)表達(dá)水平的差異,。蛋白質(zhì)組學(xué)的研究方法主要有:蛋白質(zhì)雙向電泳,、氨基酸序列測定(包括N端測序和C端測序)、生物信息學(xué),。哈爾濱4D定量蛋白質(zhì)組學(xué)鑒定
蛋白質(zhì)組研究技術(shù)涉及到各種重要的生物學(xué)現(xiàn)象,,如信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞分化,、蛋白質(zhì)折疊等等,。浙江DIA定量蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域
蛋白質(zhì)組學(xué)研究策略:蛋白質(zhì)組學(xué)研究主要分為自底向上(Bottom-Up),自頂向下(Top-Down)和自中向下(Middle-Down)三種策略,?!白缘紫蛏稀辈呗允侵竿ㄟ^分析由蛋白質(zhì)酶解生成的肽段來鑒定蛋白質(zhì)。當(dāng)應(yīng)用該策略來分析蛋白質(zhì)組混合物時,,因其類似于基因組測序的鳥管法,,所以又被稱為鳥管法蛋白質(zhì)組學(xué)(Shotgun Proteomics),該策略依賴于蛋白酶的酶切,?!白灾邢蛳隆辈呗砸惨蕾囉诘鞍酌傅拿盖校怯捎诓捎昧肆硗獾拿?,比如OmpT,,只能酶切(Lys/Arg-Lys/Arg),因此酶切之后的分子量較大,,更利于后續(xù)的蛋白組裝環(huán)節(jié),。浙江DIA定量蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域