蛋白質(zhì)組學(xué)研究應(yīng)用:近年來(lái)蛋白質(zhì)組研究技術(shù)已被應(yīng)用到各種生命科學(xué)領(lǐng)域,,覆蓋了原核微生物、真核微生物,、植物和動(dòng)物等范圍,,涉及到各種重要的生物學(xué)現(xiàn)象,,如信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞分化,、蛋白質(zhì)折疊等,。生物信息學(xué)的發(fā)展已給蛋白質(zhì)組研究提供了更方便、有效的計(jì)算機(jī)分析軟件,,隨著基因組學(xué)的迅速推進(jìn),,會(huì)給蛋白質(zhì)組研究提供更多更全的數(shù)據(jù)庫(kù)。另外,,蛋白質(zhì)組學(xué)與其它學(xué)科的交叉也將推動(dòng)新技術(shù),、新方法的發(fā)展。特別是蛋白質(zhì)組學(xué)與其它大規(guī)??茖W(xué)如基因組學(xué),,生物信息學(xué)領(lǐng)域的交叉,所呈現(xiàn)出的系統(tǒng)生物學(xué)研究模式,,將成為未來(lái)的生命科學(xué)新前沿,。蛋白質(zhì)組的概念指由一個(gè)基因組,,或一個(gè)細(xì)胞,、組織表達(dá)的所有蛋白質(zhì)。四川TMT/iTRAQ標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)費(fèi)用
蛋白質(zhì)學(xué)組翻譯后修飾的研究策略:自中而下:自中而下的分析方法是自下而上分析方法的一種替代方法,,分析組蛋白時(shí)其原理類(lèi)似于自下而上分析策略,。在使用這種分析方法時(shí),通常需要將被檢測(cè)蛋白質(zhì)消化成3-9kDa范圍內(nèi)的肽段,,因此也無(wú)法保證檢測(cè)到的肽段的完整性,。但是,由于儀器的進(jìn)步和保留了組蛋白尾部的組合修飾,,自中而下分析法正逐漸受到歡迎,。自中而下更接近于自下而上法的靈敏度。自上而下:自上而下技術(shù)可以直接對(duì)完整的蛋白質(zhì)進(jìn)行測(cè)序,,包括翻譯后修飾的蛋白質(zhì)和其他大的蛋白質(zhì)片段,,而不只是肽段。這可以比較大程度地保留與PTMs相關(guān)的信息,,使其適用于組蛋白的全方面表征和分析,。山東醫(yī)學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)服務(wù)蛋白質(zhì)組研究技術(shù)涉及到各種重要的生物學(xué)現(xiàn)象,如信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo),、細(xì)胞分化,、蛋白質(zhì)折疊等等。
蛋白質(zhì)組結(jié)果一般需要做哪些方面的生物信息學(xué)分析,?目前一般文獻(xiàn)中的分析主要為維恩圖分析,、熱圖分析,、火山圖分析、層次聚類(lèi)分析,、蛋白質(zhì)功能分析(GO分類(lèi)為主),、蛋白質(zhì)所屬代謝通路富集分析(基于KEGG的pathway)、差異蛋白互作網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建,、轉(zhuǎn)錄因子預(yù)測(cè)等方面,。其它一些比較特異的高級(jí)分析包括多組數(shù)據(jù)關(guān)聯(lián)分析、多pathway延伸分析,、磷酸蛋白激酶預(yù)測(cè)分析,、互作網(wǎng)絡(luò)及生物調(diào)控模型構(gòu)建分析。定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)主要分為標(biāo)記(label)和非標(biāo)記(labelfree)定量策略,,標(biāo)記策略又分為體內(nèi)標(biāo)記和體外標(biāo)記兩種,。細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)組豐度的動(dòng)態(tài)變化對(duì)各種生命過(guò)程有重要影響。例如在許多疾病的發(fā)生和發(fā)展進(jìn)程中,,常常伴隨著某些蛋白質(zhì)的表達(dá)異常,。定量蛋白質(zhì)組學(xué)就是把一個(gè)基因組表達(dá)的全部蛋白質(zhì)或一個(gè)復(fù)雜的混合體系中所有的蛋白質(zhì)進(jìn)行精確的定量和鑒定。
蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)有什么,?雙向凝膠電泳:雙向凝膠電泳的原理是第1向基于蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)不同用等電聚焦分離,,第二向則按分子量的不同用SDS-PAGE分離,把復(fù)雜蛋白混合物中的蛋白質(zhì)在二維平面上分開(kāi),。由于雙向電泳技術(shù)在蛋白質(zhì)組與醫(yī)學(xué)研究中所處的重要位置,,它可用于蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)錄及轉(zhuǎn)錄后修飾研究,蛋白質(zhì)組的比較和蛋白質(zhì)間的相互作用,,細(xì)胞分化凋亡研究,,致病機(jī)制及耐藥機(jī)制的研究,療效監(jiān)測(cè),,新藥開(kāi)發(fā),,研究,蛋白純度檢查,,小量蛋白純化,,新替代疫苗的研制等許多方面。近年來(lái)經(jīng)過(guò)多方面改進(jìn)已成為研究蛋白質(zhì)組的比較有使用價(jià)值的關(guān)鍵方法,。蛋白質(zhì)組學(xué)研究不僅是探索生命奧秘的必須工作,,也能為人類(lèi)健康事業(yè)帶來(lái)巨大的利益。
蛋白質(zhì)組學(xué)是以蛋白質(zhì)組為研究對(duì)象,,研究細(xì)胞,、組織或生物體蛋白質(zhì)組成及其變化規(guī)律的科學(xué)。蛋白質(zhì)組學(xué)研究不只是探索生命奧秘的必須工作,,也能為人類(lèi)健康事業(yè)帶來(lái)巨大的利益,,是生命科學(xué)進(jìn)入后基因時(shí)代的特征,。蛋白質(zhì)是生命存在和運(yùn)動(dòng)的物質(zhì)基礎(chǔ),是細(xì)胞增殖,、分化,、衰老和凋亡等重大生命活動(dòng)的執(zhí)行者,亦是基因功能活動(dòng)的執(zhí)行者,,是生命現(xiàn)象復(fù)雜性和多變性的直接體現(xiàn)者,。蛋白質(zhì)組研究是為了識(shí)別及鑒定一個(gè)細(xì)胞或組織所表達(dá)的全部蛋白質(zhì)以及它們的表達(dá)模式,是對(duì)基因組研究的重要補(bǔ)充,,是對(duì)生物體在蛋白質(zhì)水平上定量,、動(dòng)態(tài)、整體性的研究,。這類(lèi)研究有助于了解蛋白的結(jié)構(gòu),、細(xì)胞的功能、生命的本質(zhì)及活動(dòng)規(guī)律,,為疾病的診斷,、診療、疫苗及新藥開(kāi)發(fā)提供科學(xué)依據(jù),。蛋白質(zhì)組的概念與基因組的概念有許多差別,。哈爾濱定量N糖基化蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)
蛋白質(zhì)組學(xué)的研究主要促進(jìn)分子醫(yī)學(xué)的發(fā)展。四川TMT/iTRAQ標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)費(fèi)用
蛋白組學(xué)技術(shù):蛋白質(zhì)組學(xué)研究的首要任務(wù)是建立獲取和分析蛋白質(zhì)的常規(guī),、可靠,、有效的技術(shù),。為達(dá)到這一要求,,就需要樣品準(zhǔn)備、數(shù)據(jù)獲取標(biāo)準(zhǔn)化及自動(dòng)化,,也就是要有可重復(fù)的高通量的技術(shù),。蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)手段在不斷完善,其工作流程,,包括蛋白質(zhì)樣本的制備,、分離、定量及鑒定,。由雙向凝膠電泳,、質(zhì)譜技術(shù)、酵母雙雜交系統(tǒng),、蛋白質(zhì)微陣列技術(shù),、能進(jìn)行大規(guī)模數(shù)據(jù)處理的計(jì)算機(jī)系統(tǒng)和軟件、軟電離技術(shù)及生物信息學(xué)技術(shù)構(gòu)成了蛋白質(zhì)組學(xué)研究的主要技術(shù)體系,。其中蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)中的質(zhì)譜技術(shù)是現(xiàn)在比較常用的一種蛋白質(zhì)鑒定技術(shù),。四川TMT/iTRAQ標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)費(fèi)用