蛋白質(zhì)組學(xué)在醫(yī)學(xué)的研究應(yīng)用:蛋白質(zhì)組學(xué)(Proteomics)是研究細(xì)胞,、組織或生物體中蛋白質(zhì)組成,、定位,、變化及其相互作用規(guī)律的科學(xué),。labelfree-非標(biāo)定量法分析技術(shù)方法:非標(biāo)定量法[Labelfree]是近年來(lái)重要的質(zhì)譜定量方法,,通過(guò)比較質(zhì)譜分析次數(shù)或質(zhì)譜峰強(qiáng)度,,分析不同來(lái)源樣品蛋白的數(shù)量變化,。蛋白質(zhì)非標(biāo)記定量技術(shù)(LabelFree)是通過(guò)液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)對(duì)蛋白質(zhì)酶解肽段進(jìn)行質(zhì)譜分析,,無(wú)需使用昂貴的穩(wěn)定同位素標(biāo)簽做內(nèi)部標(biāo)準(zhǔn),,只需分析大規(guī)模鑒定蛋白質(zhì)時(shí)所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù),,比較不同樣品中相應(yīng)肽段的信號(hào)強(qiáng)度,從而對(duì)肽段對(duì)應(yīng)的蛋白質(zhì)進(jìn)行相對(duì)定量,。蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)有飛行時(shí)間質(zhì)譜,。濟(jì)南定量N糖基化蛋白質(zhì)組學(xué)報(bào)價(jià)
蛋白質(zhì)組學(xué)在醫(yī)學(xué)的研究應(yīng)用:蛋白質(zhì)組學(xué)(Proteomics)是研究細(xì)胞、組織或生物體中蛋白質(zhì)組成,、定位,、變化及其相互作用規(guī)律的科學(xué),包括對(duì)蛋白質(zhì)表達(dá)模式和蛋白質(zhì)組功能模式的研究,。蛋白質(zhì)組學(xué)的發(fā)展對(duì)尋找疾病的診斷標(biāo)志,、篩選藥物靶點(diǎn)、毒理學(xué)研究等有重要意義,,也因此被普遍應(yīng)用于醫(yī)學(xué)研究,。蛋白質(zhì)組學(xué)研究,總體可分為一下幾個(gè)步驟:(1)差異篩選(Discovery)(2)初步驗(yàn)證(Verification)(3)然后確診(Validation),?;谫|(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)是目前比較主流的高通量蛋白質(zhì)研究手段,當(dāng)前在醫(yī)療健康方面的應(yīng)用主要集中于基礎(chǔ)研究和轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué),。山東蛋白質(zhì)組學(xué)主要技術(shù)蛋白質(zhì)組的研究能為生命活動(dòng)規(guī)律提供物質(zhì)基礎(chǔ),。
LabelFree(非標(biāo)記蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)):在非標(biāo)記策略的定量模型中,主要涉及兩種不同的算法:其一,,以肽段的色譜峰積分面積為基礎(chǔ),,通過(guò)比較一對(duì)生物樣品中相對(duì)應(yīng)到蛋白質(zhì)酶解多肽的色譜積分面積而得到兩者的相對(duì)豐度;其二,,以肽段被質(zhì)譜檢測(cè)的計(jì)數(shù)為基礎(chǔ),,通過(guò)歸一化來(lái)表征被檢測(cè)蛋白質(zhì)的相對(duì)豐度。非標(biāo)記技術(shù)認(rèn)為肽段在質(zhì)譜中被捕獲檢測(cè)的頻率(Counts)與其在混合物中的豐度成正相關(guān),,因此蛋白質(zhì)被質(zhì)譜檢測(cè)的計(jì)數(shù)反映了蛋白質(zhì)的豐度,,通過(guò)適當(dāng)?shù)臄?shù)學(xué)公式可以將質(zhì)譜檢測(cè)計(jì)數(shù)與蛋白質(zhì)的量聯(lián)系起來(lái),從而對(duì)蛋白質(zhì)進(jìn)行定量,。
常規(guī)蛋白質(zhì)組學(xué):Labelfree多肽組學(xué):顧名思義,,就是不使用任何標(biāo)記方法,直接對(duì)肽段進(jìn)行質(zhì)譜鑒定和定性定量分析,。實(shí)驗(yàn)流程簡(jiǎn)單,,只需要對(duì)蛋白進(jìn)行常規(guī)酶解和除鹽步驟即可上機(jī)。定量方式分為兩種:峰面積(Peakintensity)和峰計(jì)數(shù)(Spectralcount),,常用的是峰面積,。不過(guò),由于質(zhì)譜采集時(shí)只選取topN的母離子進(jìn)行二級(jí)碎裂和MS2檢測(cè),所以會(huì)丟失一些豐度較低的肽段信息,,缺失值比較多,。TMT/iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué):TMT全稱(chēng)是TandemMassTag,是經(jīng)典化學(xué)標(biāo)記試劑,,普遍用于差異表達(dá)蛋白質(zhì)組分析研究中,。該技術(shù)采用6重、10重或16重同位素標(biāo)簽,,與肽段的氨基發(fā)生共價(jià)結(jié)合反應(yīng),,可實(shí)現(xiàn)同時(shí)對(duì)6個(gè)/10個(gè)/16個(gè)不同樣品中蛋白質(zhì)的定性和定量分析。(目前16標(biāo)鹿明生物可提供技術(shù)服務(wù)),。蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)并帶領(lǐng)生物技術(shù)取得關(guān)鍵性的突破,。
定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析(QuantitativeProteomics)是對(duì)一個(gè)基因組表達(dá)的全部蛋白質(zhì)或一個(gè)復(fù)雜混合體系內(nèi)所有蛋白質(zhì)進(jìn)行精確鑒定和定量??捎糜诤Y選和尋找任何因素引起的樣本之間的差異表達(dá)蛋白,,結(jié)合生物信息學(xué)揭示細(xì)胞生理病理等功能,同時(shí)也可對(duì)某些關(guān)鍵蛋白進(jìn)行定性和定量分析,。目前定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)常見(jiàn)標(biāo)記(Label)和非標(biāo)記的(LabelFree)定量策略,。定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)常見(jiàn)的幾類(lèi)主要包括:LabelFree定量蛋白組分析、SILAC與免疫共沉淀蛋白互作分析,、MRM/PRM定量蛋白組學(xué)分析,、SILAC/Dimethyl標(biāo)記定量蛋白組分析、SWATH定量蛋白組學(xué),、TMT/iTRAQ/multinotch定量蛋白組學(xué)分析。蛋白質(zhì)組學(xué)在應(yīng)用中,,更多地用于提供高通量蛋白質(zhì)定性定量信息,。北京蛋白質(zhì)定量組學(xué)研究?jī)?nèi)容
蛋白質(zhì)組的研究能為眾多種疾病機(jī)理的闡明及攻克提供理論根據(jù)和解決途徑。濟(jì)南定量N糖基化蛋白質(zhì)組學(xué)報(bào)價(jià)
蛋白組究竟研究的是什么呢,?第1,,蛋白質(zhì)定性,或者說(shuō)大規(guī)模檢測(cè)某些蛋白質(zhì)是否存在于樣品當(dāng)中,;第2,,蛋白質(zhì)定量,也就是大規(guī)模檢測(cè)某些蛋白質(zhì)的含量(包括一定含量與相對(duì)含量),;第3,,蛋白質(zhì)翻譯后修飾,這些修飾主要包括磷酸化,,泛素化,,糖基化,乙酰化等等,,也包括對(duì)這些翻譯后修飾的定量研究,。這三大塊中所提到的大規(guī)模,既可以是樣品數(shù)量的大規(guī)模高通量,,也可以是少量樣本中蛋白數(shù)量的大規(guī)模高通量,。研究原因:首先,由于翻譯調(diào)控和翻譯后調(diào)控的存在,,RNA的表達(dá)量與實(shí)際對(duì)應(yīng)蛋白質(zhì)的含量相關(guān)性并不高,,就簡(jiǎn)單地測(cè)試了酵母中mRNA和對(duì)應(yīng)蛋白質(zhì)的定量相關(guān)性,結(jié)果是,,低豐度蛋白與mRNA的相關(guān)性尤其低,,而高豐度蛋白和其mRNA的相關(guān)性則高,經(jīng)過(guò)平均后r值只為0.4。濟(jì)南定量N糖基化蛋白質(zhì)組學(xué)報(bào)價(jià)
上海拜譜生物科技有限公司致力于商務(wù)服務(wù),,是一家服務(wù)型公司,。公司業(yè)務(wù)分為多組學(xué)服務(wù),質(zhì)譜檢測(cè),,蛋白質(zhì)組學(xué),代謝組學(xué)等,,目前不斷進(jìn)行創(chuàng)新和服務(wù)改進(jìn),,為客戶(hù)提供良好的產(chǎn)品和服務(wù)。公司注重以質(zhì)量為中心,,以服務(wù)為理念,,秉持誠(chéng)信為本的理念,打造商務(wù)服務(wù)良好品牌,。拜譜生物秉承“客戶(hù)為尊,、服務(wù)為榮、創(chuàng)意為先,、技術(shù)為實(shí)”的經(jīng)營(yíng)理念,,全力打造公司的重點(diǎn)競(jìng)爭(zhēng)力。