轉(zhuǎn)錄組學(xué)測序有什么樣的樣品要求？（1）樣品純度要求：OD值應(yīng)在1.8至2.2之間,；電泳檢測28S:18S至少大于1.8。（2）樣品濃度：totalRNA濃度不低于400ng/μg,。（3）totalRNA樣品請置于-20℃保存,；請?zhí)峁﹖otalRNA樣品具體濃度、體積,、制備時間,、溶劑名稱及物種來源。請同時附上QC數(shù)據(jù),，包括電泳膠圖,、分光光度或Nanodrop儀器檢測數(shù)據(jù)。（4）樣品請置于1.5ml管中,，管上注明樣品名稱,、濃度以及制備時間，管口使用Parafilm封口,。建議使用干冰運(yùn)輸,，并且盡量選用較快的郵遞方式,，以降低運(yùn)輸過程中樣品降解的可能性。轉(zhuǎn)錄組具有組織特異性的特點(diǎn),。廣東高通量轉(zhuǎn)錄組學(xué)質(zhì)譜鑒定

轉(zhuǎn)錄組是特定發(fā)育階段或生理?xiàng)l件下細(xì)胞內(nèi)的完整轉(zhuǎn)錄信息的匯合,，表示了基因表達(dá)的中間狀態(tài)。轉(zhuǎn)錄組測序可以對所有轉(zhuǎn)錄物進(jìn)行分類,、確定基因的轉(zhuǎn)錄結(jié)構(gòu),、量化轉(zhuǎn)錄物的表達(dá)水平。蛋白質(zhì)是生命功能的直接執(zhí)行者,，蛋白組是一種細(xì)胞乃至一種生物所表達(dá)的全部蛋白質(zhì),。整合轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的表達(dá)數(shù)據(jù)對生物樣本進(jìn)行研究，可以從整體上解釋生物學(xué)問題,，探究生物體生理和疾病機(jī)理等,。轉(zhuǎn)錄組學(xué)應(yīng)用于胃腸瘤發(fā)生機(jī)制研究：利用轉(zhuǎn)錄組學(xué)可檢測瘤細(xì)胞惡化過程中的RNA（編碼RNA及非編碼RNA）的變化，有助于更好地理解胃腸瘤的發(fā)生機(jī)制,。湖北IncRNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)方法轉(zhuǎn)錄組學(xué)靈敏度高,，可以檢測細(xì)胞中少至幾個拷貝的稀有轉(zhuǎn)錄本。

什么叫轉(zhuǎn)錄組學(xué),？廣義轉(zhuǎn)錄組是指生命單元(通常是一種細(xì)胞)中所有按基因信息單元轉(zhuǎn)錄和加工的RNA分子(包括編碼和非編碼RNA功能單元),或者是一個特定細(xì)胞所有轉(zhuǎn)錄本的總和.它的研究對象就是這些RNA與蛋白質(zhì)分子和它們所組成的基因功能網(wǎng)絡(luò)以及它們與細(xì)胞功能的關(guān)系.而狹義轉(zhuǎn)錄組是指可直接參與翻譯蛋白質(zhì)的mRNA總和.研究生物細(xì)胞中轉(zhuǎn)錄組的發(fā)生和變化規(guī)律的科學(xué)就稱為轉(zhuǎn)錄組學(xué)(tran—scriptomics),。轉(zhuǎn)錄組學(xué)即特定細(xì)胞在某一功能狀態(tài)下轉(zhuǎn)錄出來的所有RNA的總和，包括mRNA和非編碼RNA,。

轉(zhuǎn)錄組分析是目前應(yīng)用比較廣的高通量測序分析技術(shù)之一,。常見設(shè)計是不同樣品之間比較，尋找差異基因,、標(biāo)志基因,、協(xié)同變化基因、差異剪接和新轉(zhuǎn)錄本,，并進(jìn)行結(jié)果可視化,、功能注釋和網(wǎng)絡(luò)分析等。轉(zhuǎn)錄組的測序分析也相對成熟,，從RNA提取,、構(gòu)建文庫、上機(jī)測序再到結(jié)果解析既可以自己完成,，又可以在專業(yè)公司進(jìn)行,。概括來看轉(zhuǎn)錄組的分析流程比較簡單，序列比對-轉(zhuǎn)錄本拼接(可選)-表達(dá)定量-差異基因-功能富集-定制分析,。整個環(huán)節(jié)清晰流暢,，可以作為剛開始接觸高通量測序?qū)W習(xí)比較合適的技術(shù)之一。轉(zhuǎn)錄組學(xué)測序的研究對象為特定細(xì)胞在某一功能狀態(tài)下所能轉(zhuǎn)錄出來的所有RNA的總和,。

RNA-Seq轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)優(yōu)勢：相比基因芯片和標(biāo)記的堿基序列的測序方法,，RNA-seq具有一定的優(yōu)越性,。與基因芯片相比，RNA-Seq不只可以在更高的分辨率下用來測量基因的表達(dá)水平情況,，還可以揭示未知的轉(zhuǎn)錄組和拼接亞型,，并為選擇性拼接亞型提供定量分析。相對于傳統(tǒng)的芯片雜交平臺,，轉(zhuǎn)錄組測序無需預(yù)先針對已知序列設(shè)計探針,，即可對任意物種的整體轉(zhuǎn)錄活動進(jìn)行檢測，提供更精確的數(shù)字化信號,、更高的檢測通量以及更普遍的檢測范圍,，是目前深入研究復(fù)雜性轉(zhuǎn)錄組的強(qiáng)大工具。鑒于這些優(yōu)勢,，RNA-Seq很快就被應(yīng)用到關(guān)于瘤病相關(guān)研究的多個方面,。轉(zhuǎn)錄組學(xué)可應(yīng)用于炎癥發(fā)生機(jī)制的發(fā)現(xiàn)及干預(yù)。廣東高通量轉(zhuǎn)錄組學(xué)質(zhì)譜鑒定

轉(zhuǎn)錄組學(xué)測序可以同時測到mRNA,、lncRNA,、micRNA以及circRNA么？廣東高通量轉(zhuǎn)錄組學(xué)質(zhì)譜鑒定

RNA-Seq轉(zhuǎn)錄組學(xué)的應(yīng)用：RNA-Seq即對轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行測序和分析,。一般來說在研究所會委托公司測序得到數(shù)據(jù)自己進(jìn)行后續(xù)的生信分析（質(zhì)控,，mapping，差異基因表達(dá)分析,，SNV分析等）,。RNA-Seq有著巨大的應(yīng)用前景。在不同背景下比較mRNA水平同一物種,，不同組織：研究基因在不同部分的表達(dá)情況,。同一物種，同一組織：研究基因在不同處理下,，不同條件下的表達(dá)變化,。同一組織，不同物種：研究基因的進(jìn)化關(guān)系,。時間序列實(shí)驗(yàn)：基因在不同時期的表達(dá)情況與發(fā)育的關(guān)系?；蚍诸悾赫业郊?xì)胞特異,，疾病相關(guān)，處理相關(guān)的基因表達(dá)模式,，用于診斷疾病和預(yù)測等,。基因網(wǎng)絡(luò)和通路：基因在細(xì)胞活動中的功能,，基因間的相互作用,。廣東高通量轉(zhuǎn)錄組學(xué)質(zhì)譜鑒定

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