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杭州修飾蛋白組學(xué)質(zhì)譜鑒定

來源: 發(fā)布時間:2021-12-28

蛋白質(zhì)組學(xué)在醫(yī)學(xué)的研究應(yīng)用:蛋白質(zhì)組學(xué)(Proteomics)是研究細胞,、組織或生物體中蛋白質(zhì)組成,、定位,、變化及其相互作用規(guī)律的科學(xué),。labelfree-非標定量法分析技術(shù)方法:非標定量法[Labelfree]是近年來重要的質(zhì)譜定量方法,通過比較質(zhì)譜分析次數(shù)或質(zhì)譜峰強度,,分析不同來源樣品蛋白的數(shù)量變化,。蛋白質(zhì)非標記定量技術(shù)(LabelFree)是通過液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)對蛋白質(zhì)酶解肽段進行質(zhì)譜分析,無需使用昂貴的穩(wěn)定同位素標簽做內(nèi)部標準,,只需分析大規(guī)模鑒定蛋白質(zhì)時所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù),,比較不同樣品中相應(yīng)肽段的信號強度,從而對肽段對應(yīng)的蛋白質(zhì)進行相對定量,。蛋白質(zhì)組學(xué)研究的首要任務(wù)是建立獲取和分析蛋白質(zhì)的常規(guī)、可靠,、有效的技術(shù),。杭州修飾蛋白組學(xué)質(zhì)譜鑒定

蛋白質(zhì)組學(xué)在醫(yī)療和健康方面有什么應(yīng)用?具體而言,,蛋白質(zhì)組學(xué)在此類應(yīng)用中,,更多地用于提供高通量蛋白質(zhì)定性定量信息。作為檢測手段的蛋白質(zhì)組學(xué):事實上,,在當(dāng)前的生物醫(yī)學(xué)研究和臨床診斷中,,蛋白質(zhì)組學(xué)相關(guān)技術(shù)有非常多的應(yīng)用。因為蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)的本質(zhì)(從分析化學(xué)角度來看),,就是對蛋白質(zhì)的定性定量分析,。生物醫(yī)學(xué)和臨床診斷中,需要大量表征一種或多種蛋白質(zhì)的含量,、氨基酸序列,、翻譯后修飾等信息。蛋白質(zhì)組學(xué)相關(guān)技術(shù)目前在一小部分]應(yīng)用中具有獨特優(yōu)勢。有很多蛋白質(zhì)組學(xué)的研究者在工業(yè)界和醫(yī)院進行相關(guān)研究和日常工作,。很容易發(fā)現(xiàn),,當(dāng)前蛋白質(zhì)組學(xué)的臨床應(yīng)用更多地集中在第二類。第1類的應(yīng)用更接近于生物醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)研究,,目前還沒有和大部分人的現(xiàn)實生活產(chǎn)生關(guān)系,。杭州修飾蛋白組學(xué)質(zhì)譜鑒定蛋白質(zhì)組學(xué)的研究方法將出現(xiàn)多種技術(shù)并存。

蛋白質(zhì)組學(xué)發(fā)展趨勢:1,、基礎(chǔ)研究方面:近兩年來蛋白質(zhì)組研究技術(shù)已被應(yīng)用到各種生命科學(xué)領(lǐng)域,,如細胞生物學(xué)、神經(jīng)生物學(xué)等,。在研究對象上,,覆蓋了原核微生物、真核微生物,、植物和動物等范圍,,涉及到各種重要的生物學(xué)現(xiàn)象,如信號轉(zhuǎn)導(dǎo),、細胞分化,、蛋白質(zhì)折疊等等。在未來的發(fā)展中,,蛋白質(zhì)組學(xué)的研究領(lǐng)域?qū)⒏悠毡椤?,、應(yīng)用研究方面:蛋白質(zhì)組學(xué)將成為尋找疾病分子標記和藥物靶標比較有效的方法之一。在對早老性癡呆等人類重大疾病的臨床診斷和治理方面蛋白質(zhì)組技術(shù)也有十分誘人的前景,,目前國際上許多大型藥物公司正投入大量的人力和物力進行蛋白質(zhì)組學(xué)方面的應(yīng)用性研究,。

蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù):飛行時間質(zhì)譜:MALDI的基本原理是將分析物分散在基質(zhì)分子(尼古丁酸及其同系物)中并形成晶體,當(dāng)用激光(337nm的氮激光)照射晶體時,,基質(zhì)分子吸收激光能量,,樣品解吸附,基質(zhì)-樣品之間發(fā)生電荷轉(zhuǎn)移使樣品分子電離,。它從固相標本中產(chǎn)生離子,,并在飛行管中測定其分子量,MALDI-TOF-MS一般用于肽質(zhì)量指紋圖譜,,非??焖伲看畏治鲋恍?~5min),靈敏(達到fmol水平),,可以精確測量肽段質(zhì)量,,但是如果在分析前不修飾肽段,MALDI-TOF-MS不能給出肽片段的序列,。蛋白質(zhì)組學(xué)包括蛋白與蛋白相互作用等,。

蛋白質(zhì)組學(xué)發(fā)展趨勢:技術(shù)發(fā)展方面:蛋白質(zhì)組學(xué)的研究方法將出現(xiàn)多種技術(shù)并存,,各有優(yōu)勢和的特點,而難以象基因組研究一樣形成比較一致的方法,。除了發(fā)展新方法外,,更強調(diào)各種方法間的整合和互補,以適應(yīng)不同蛋白質(zhì)的不同特征,。另外,,蛋白質(zhì)組學(xué)與其它學(xué)科的交叉也將日益明顯和重要,這種交叉是新技術(shù)新方法的活水之源,,特別是,,蛋白質(zhì)組學(xué)與其它大規(guī)模科學(xué)如基因組學(xué),,生物信息學(xué)等領(lǐng)域的交叉,,構(gòu)成組學(xué)(omics)生物技術(shù)研究方法,所呈現(xiàn)出的系統(tǒng)生物學(xué)(SystemBiology)研究模式,,將成為未來生命科學(xué)比較令人激動的新前沿,。定量蛋白質(zhì)組學(xué)通過對蛋白質(zhì)的定量分析,以了解基因在不同的生理,、病理和逆境條件下的表達情況,。杭州修飾蛋白組學(xué)質(zhì)譜鑒定

蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)有等電聚焦。杭州修飾蛋白組學(xué)質(zhì)譜鑒定

常規(guī)蛋白質(zhì)組學(xué):Labelfree多肽組學(xué):顧名思義,,就是不使用任何標記方法,,直接對肽段進行質(zhì)譜鑒定和定性定量分析。實驗流程簡單,,只需要對蛋白進行常規(guī)酶解和除鹽步驟即可上機,。定量方式分為兩種:峰面積(Peakintensity)和峰計數(shù)(Spectralcount),常用的是峰面積,。不過,,由于質(zhì)譜采集時只選取topN的母離子進行二級碎裂和MS2檢測,所以會丟失一些豐度較低的肽段信息,,缺失值比較多。TMT/iTRAQ標記定量蛋白組學(xué):TMT全稱是TandemMassTag,,是經(jīng)典化學(xué)標記試劑,,普遍用于差異表達蛋白質(zhì)組分析研究中。該技術(shù)采用6重,、10重或16重同位素標簽,,與肽段的氨基發(fā)生共價結(jié)合反應(yīng),可實現(xiàn)同時對6個/10個/16個不同樣品中蛋白質(zhì)的定性和定量分析,。(目前16標鹿明生物可提供技術(shù)服務(wù)),。杭州修飾蛋白組學(xué)質(zhì)譜鑒定

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