circRNA轉(zhuǎn)錄組學成環(huán)機制：circRNA環(huán)化方式分為內(nèi)含子環(huán)化和外顯子環(huán)化。目前主流的成環(huán)機制可歸類為：依賴于剪切體的索尾插接環(huán)化,。在mRNA前體上,，通過連續(xù)的組裝小核核糖體蛋白從而催化外顯子下游的5′供體的位點連接到上游的3′受體的位點，索尾插接形成環(huán)化,，然后通過剪切形成circRNA,。順式作用元件促進circRNA形成。部分circRNA外顯子兩側(cè)的內(nèi)含子中含有反向互補序列,，首先在剪切位點上并排形成RNA雙鏈體,，再通過可變剪切形成帶內(nèi)含子和不帶內(nèi)含子兩種不同的circRNA?；蛘咄怙@子內(nèi)部以及兩側(cè)的內(nèi)含子可以競爭進行RNA配對,，然后通過可變剪切形成不同類型的circRNA。轉(zhuǎn)錄組學可應(yīng)用于基因點突變及多態(tài)性檢測,。哈爾濱宏轉(zhuǎn)錄學組領(lǐng)域

轉(zhuǎn)錄組學：轉(zhuǎn)錄組學是研究特定的細胞,、組織或個體在特定時間和狀態(tài)下所轉(zhuǎn)錄出所有RNA的學科，轉(zhuǎn)錄組測序是指利用高通量測序方法,，研究特定的細胞,、組織或個體在特定時間和狀態(tài)下所轉(zhuǎn)錄出的所有mRNA，用于揭示不同功能狀態(tài)下的基因表達,、結(jié)構(gòu)的差異,，闡明分子機制。應(yīng)用領(lǐng)域：醫(yī)學研究：疾病標志物篩查,、疾病的診斷和分型,、疾病復發(fā)診斷、病因與病理機制探究,、臨床療效評價,、藥物毒理學評價。生命科學研究：非生物環(huán)境關(guān)系研究,、植物與微生物,、在表型鑒定中的應(yīng)用、代謝途徑及功能基因組研究,、藥用植物研究中的應(yīng)用。湖北mRNA-seq轉(zhuǎn)錄組學方法轉(zhuǎn)錄組學可以直接測定每個轉(zhuǎn)錄本單核苷酸分辨率的準確度,。

普通轉(zhuǎn)錄組學測序適用于哪些情況,？普通轉(zhuǎn)錄組測序主要適用于兩大類：一是不同的生長階段或者發(fā)育過程,；二是不同的環(huán)境、藥物,、病原菌等逆境脅迫處理,。轉(zhuǎn)錄組學測序必須做生物學重復么？需要幾個重復,？生物學重復是生物實驗所必須的,，轉(zhuǎn)錄組測序也不例外，至少3次生物學重復,。準備生物重復樣品時,，通過對實驗的預先設(shè)計和控制，盡可能將與實驗處理無關(guān)的背景條件控制在同一水平,，減少批次效應(yīng)對結(jié)果的影響,。轉(zhuǎn)錄組學測序可以同時測到mRNA、lncRNA,、micRNA以及circRNA么,？我們通常所講的轉(zhuǎn)錄組測序只能測到mRNA。但是全轉(zhuǎn)錄組測序通過構(gòu)建兩個測序文庫（一是小RNA測序文庫,、二是lncRNA測序文庫）是可以測到以上4種RNA的,。

轉(zhuǎn)錄組分析是目前應(yīng)用比較廣的高通量測序分析技術(shù)之一。常見設(shè)計是不同樣品之間比較,，尋找差異基因,、標志基因、協(xié)同變化基因,、差異剪接和新轉(zhuǎn)錄本,，并進行結(jié)果可視化、功能注釋和網(wǎng)絡(luò)分析等,。轉(zhuǎn)錄組的測序分析也相對成熟,，從RNA提取、構(gòu)建文庫,、上機測序再到結(jié)果解析既可以自己完成,，又可以在專業(yè)公司進行。概括來看轉(zhuǎn)錄組的分析流程比較簡單,，序列比對-轉(zhuǎn)錄本拼接(可選)-表達定量-差異基因-功能富集-定制分析,。整個環(huán)節(jié)清晰流暢，可以作為剛開始接觸高通量測序?qū)W習比較合適的技術(shù)之一,。轉(zhuǎn)錄組具有組織特異性的特點,。

轉(zhuǎn)錄組學應(yīng)用于胃腸瘤轉(zhuǎn)移機制研究：circRNA是一種非編碼RNA，可以多種方式參與生物學功能,，如細胞增殖,、細胞周期,、侵襲和轉(zhuǎn)移等。近年來研究發(fā)現(xiàn),，環(huán)狀RNA可以通過海綿吸附微小RNA和RNA結(jié)合蛋白參與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控,，從而影響瘤耐藥過程中的DNA修復、凋亡,、增殖,、細胞轉(zhuǎn)運，以及介導瘤耐藥的細胞內(nèi)酶,，進而在瘤耐藥中發(fā)揮重要調(diào)節(jié)作用,。有研究證實通過干擾環(huán)狀RNA的表達，可以提高瘤對藥物的敏感性,，提示環(huán)狀RNA可能為抗瘤藥物耐藥性的研究提供新的靶點,。普通轉(zhuǎn)錄組測序主要適用于不同的環(huán)境、藥物,、病原菌等逆境脅迫處理,。哈爾濱宏轉(zhuǎn)錄學組領(lǐng)域

什么是轉(zhuǎn)錄組學測序？哈爾濱宏轉(zhuǎn)錄學組領(lǐng)域

轉(zhuǎn)錄組學技術(shù)：轉(zhuǎn)錄組學（transcriptomics）,，是一門在整體水平上研究細胞中基因轉(zhuǎn)錄的情況及轉(zhuǎn)錄調(diào)控規(guī)律的學科,。簡而言之，轉(zhuǎn)錄組學是從RNA水平研究基因表達的情況,。轉(zhuǎn)錄組即一個活細胞所能轉(zhuǎn)錄出來的所有RNA的總和,，是研究細胞表型和功能的一個重要手段。優(yōu)勢：高通量,、更精確的數(shù)字信號,；在單核苷酸水平對任意物種的整體轉(zhuǎn)錄活動進行檢測；分析轉(zhuǎn)錄本的結(jié)構(gòu)和表達水平的同時,，還能發(fā)現(xiàn)未知轉(zhuǎn)錄本和稀有轉(zhuǎn)錄本,；準確地識別可變剪切和融合基因。應(yīng)用方向：植物生長機制的發(fā)現(xiàn)及干預,；炎癥發(fā)生機制的發(fā)現(xiàn)及干預,；表達差異的研究；基因點突變及多態(tài)性檢測,。哈爾濱宏轉(zhuǎn)錄學組領(lǐng)域

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