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杭州蛋白免疫沉淀磁珠原理

來源： 發(fā)布時(shí)間：2024-07-31

免疫沉淀是利用抗體特異性反應(yīng)純化富集目的蛋白的一種方法?？贵w與細(xì)胞裂解液或表達(dá)上清中相應(yīng)的蛋白結(jié)合后，再與蛋白A/G（ProteinA/G）或二抗偶聯(lián)的珠子（agarose或Sepharose）孵育,，通過離心得到珠子-蛋白A/G或二抗-抗體-目的蛋白復(fù)合物,，沉淀經(jīng)過洗滌后，重懸于電泳上樣緩沖液,，煮沸5-10min,，在高溫及還原劑的作用下，抗原與抗體解離,，離心收集上清,，上清中包括抗體、目的蛋白和少量的雜蛋白,。免疫沉淀是一種生物學(xué)技術(shù),，它利用抗體的特異性結(jié)合特性來富集和分離混合物中的特定蛋白質(zhì)。這種技術(shù)是研究蛋白質(zhì)表達(dá),、蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用,、蛋白質(zhì)修飾和蛋白質(zhì)功能的強(qiáng)大工具。免疫沉淀技術(shù)RIP的優(yōu)缺點(diǎn)是什么,？杭州蛋白免疫沉淀磁珠原理

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免疫沉淀ChIP實(shí)驗(yàn)中磁珠還是瓊脂糖珠的選擇取決于客戶實(shí)驗(yàn)情況,。
瓊脂糖珠海綿狀的結(jié)構(gòu)  (直徑 50-150 μm)  可以結(jié)合抗體  (繼而結(jié)合靶蛋白) ，它能夠直接高效,、快速結(jié)合抗體,，而不需借助特殊的專業(yè)設(shè)備。瓊脂糖珠呈多孔結(jié)構(gòu),，這使得它們擁有更大的表面積可與蛋白質(zhì)相互接觸,，具有更高的結(jié)合載量,。
與瓊脂糖珠不同,，磁珠是固體，抗體的結(jié)合限于磁珠的表面,。磁珠 (直徑 1-4 μm) 明顯小于瓊脂糖珠 ,，盡管磁珠沒有多孔中心增加結(jié)合能力，但每體積的磁珠數(shù)量比瓊脂糖珠多,，使磁珠擁有足夠的抗體結(jié)合表面積滿足高容量的抗體結(jié)合,。
簡而言之，瓊脂糖珠的結(jié)合能力較強(qiáng),，而磁珠在得率,，可重復(fù)性以及自動(dòng)化方面有明顯的優(yōu)勢(shì)。
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Co-IP（免疫共沉淀）技術(shù)主要用于研究蛋白質(zhì)之間的相互作用,，其應(yīng)用場(chǎng)景如下：
1. 蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)的鑒定：Co-IP可用于構(gòu)建蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)，發(fā)現(xiàn)目標(biāo)蛋白的結(jié)合伙伴,。
2. 信號(hào)傳導(dǎo)途徑的研究：通過Co-IP技術(shù),，科學(xué)家們發(fā)現(xiàn)了許多關(guān)鍵的細(xì)胞信號(hào)通路,，如MAPK和PI3K/Akt通路等，為深入理解這些通路的功能和調(diào)控機(jī)制提供了重要線索,。
3. 藥物靶點(diǎn)篩選：利用Co-IP技術(shù),，研究人員可以篩選潛在的藥物靶點(diǎn)。
疾病機(jī)制研究：通過分析疾病相關(guān)蛋白質(zhì)的相互作用,，Co-IP有助于揭示疾病的分子機(jī)制,。
4. 抗體藥物開發(fā)：Co-IP可用于研究抗體藥物與其靶標(biāo)蛋白的結(jié)合特性，評(píng)估抗體藥物的親和力和特異性,。
5. 轉(zhuǎn)錄因子研究：Co-IP技術(shù)可以用于研究轉(zhuǎn)錄因子與蛋白質(zhì)的相互作用，進(jìn)而揭示基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò),。

RNA免疫沉淀技術(shù)（RIP）是一種研究RNA與蛋白質(zhì)相互作用的重要方法,，其應(yīng)用領(lǐng)域主要包括：
1. 轉(zhuǎn)錄后調(diào)控研究：RIP技術(shù)可以幫助研究者了解RNA在轉(zhuǎn)錄后水平如何被調(diào)控。
2. 表觀遺傳調(diào)控：RIP技術(shù)用于研究RNA結(jié)合蛋白（RBPs）在表觀遺傳調(diào)控中的作用,。
3. 非編碼RNA功能研究：RIP技術(shù)可以用來研究長非編碼RNA（lncRNA）,、miRNA和其他小RNA的種類，以及它們?nèi)绾闻c蛋白質(zhì)相互作用來調(diào)控基因表達(dá),。
4. RNA病毒研究：RIP技術(shù)也可用于研究RNA病毒與其宿主細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)的相互作用,，進(jìn)而了解病毒復(fù)制和致病機(jī)制。
5. RNA修飾和甲基化研究：RIP技術(shù)結(jié)合其他技術(shù)如m5C-RIP-seq,，可用于研究RNA甲基化修飾及其在病理過程中的作用,。
6. RNA定位和穩(wěn)定性：通過RIP技術(shù)，研究者可以探索特定RNA在細(xì)胞內(nèi)的定位以及它們?nèi)绾伪环€(wěn)定或降解,。
7. RNA-蛋白質(zhì)復(fù)合物的鑒定：RIP技術(shù)可以用來鑒定與特定RNA結(jié)合的蛋白質(zhì),，從而揭示RNA-蛋白質(zhì)復(fù)合物的組成。
8. 疾病相關(guān)RNA研究：RIP技術(shù)在疾病相關(guān)RNA的研究中也有應(yīng)用,。
免疫沉淀技術(shù)IP實(shí)驗(yàn)步驟,。

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免疫沉淀純化所得抗原純度低一般有多種原因：
1. 非特異性蛋白污染
如果洗脫所得抗原純度較低，則有幾種方法可以進(jìn)行優(yōu)化,。在結(jié)合或洗滌緩沖液中加入去污劑或其他可以降低非特異性結(jié)合的組分,。使用普通微珠預(yù)純化樣本還可以降低非目標(biāo)分子的共純化。此外,，還可以使用無關(guān)蛋白 (如BSA) 封閉微珠 ,。
2. 抗體污染
使用蛋白A、G或A/G的經(jīng)典免疫沉淀實(shí)驗(yàn)中會(huì)出現(xiàn)抗體與抗原共洗脫的情況,。如果共洗脫會(huì)影響下游分析,，則需要使用抗體通過共價(jià)連接固定至微珠的方法進(jìn)行實(shí)驗(yàn)，如Pierce 直接 IP 或交聯(lián) IP 的形式,。
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免疫沉淀技術(shù)RIP的實(shí)驗(yàn)方法,。杭州蛋白免疫沉淀磁珠原理

免疫沉淀RIP實(shí)驗(yàn)中磁珠還是瓊脂糖珠的選擇取決于客戶實(shí)驗(yàn)情況。
瓊脂糖珠海綿狀的結(jié)構(gòu)  (直徑 50-150 μm)  可以結(jié)合抗體  (繼而結(jié)合靶蛋白) ,，它能夠直接高效,、快速結(jié)合抗體，而不需借助特殊的專業(yè)設(shè)備,。瓊脂糖珠呈多孔結(jié)構(gòu),，這使得它們擁有更大的表面積可與蛋白質(zhì)相互接觸，具有更高的結(jié)合載量,。
與瓊脂糖珠不同,，磁珠是固體，抗體的結(jié)合限于磁珠的表面,。磁珠 (直徑 1-4 μm) 明顯小于瓊脂糖珠 ,，盡管磁珠沒有多孔中心增加結(jié)合能力，但每體積的磁珠數(shù)量比瓊脂糖珠多,，使磁珠擁有足夠的抗體結(jié)合表面積滿足高容量的抗體結(jié)合,。
簡而言之，瓊脂糖珠的結(jié)合能力較強(qiáng),，而磁珠在得率,，可重復(fù)性以及自動(dòng)化方面有明顯的優(yōu)勢(shì)。
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標(biāo)簽： 免疫沉淀 支原體