從作物的根際土壤,、根表、植株及葉片上分離篩選出的枯草芽孢桿菌菌株對(duì)不同作物的眾多真類(lèi)菌和細(xì)菌病害具有拮抗作用,。如糧食作物中的水稻紋枯病,、稻瘟病,小麥紋枯病,,豆類(lèi)根腐病等,;蔬菜病害中的番茄葉病、枯萎病,,黃瓜枯萎病菌,、霜霉病,茄子灰霉病和辣椒疫病等,??莶菅挎邨U菌還可以控制采后水果的多種病害,如蘋(píng)果霉心病,,柑橘青霉病,,油桃褐腐病,草莓灰霉病和香蕉枯萎病,、冠腐病,、炭疽病,蘋(píng)果及梨青霉病,、黑斑病,、潰瘍病,金花梨果腐病等,。此外,,枯草芽孢桿菌對(duì)楊樹(shù)潰瘍病、腐爛病,、樹(shù)黑斑病及炭疽病,,茶輪斑病,炭疽病,、黑脛病,、赤星病菌,、根腐病,棉花立枯病,、枯萎病等也有較好的防治作用,。金黃色葡萄球是抑菌物質(zhì)中毒和一般營(yíng)養(yǎng)不良時(shí)成為次級(jí)的微生物區(qū)系的主要細(xì)菌。震顫厄氏菌菌株
大腸桿菌屬的系統(tǒng)發(fā)育:大量屬于該物種的菌株已得到分離和鑒定,。除了血清型(videsupra),,它們還可以根據(jù)它們的系統(tǒng)發(fā)育(即推斷的進(jìn)化史)進(jìn)行分類(lèi)。如下所示,,其中該物種分為六組,。特別是全基因組序列的使用產(chǎn)生了高度支持的系統(tǒng)發(fā)育?;谶@些數(shù)據(jù),大腸桿菌的5個(gè)亞種被區(qū)分開(kāi)來(lái),。系統(tǒng)發(fā)育距離(“關(guān)聯(lián)性”)和病理學(xué)之間的聯(lián)系很小,,例如O157:H7血清型菌株形成一個(gè)分支(“一個(gè)獨(dú)特的群”)—下面的E群——都是腸出血性菌株(EHEC),但并不是所有的EHEC菌株都是密切相關(guān)的,。事實(shí)上,,四種不同的志賀氏菌嵌套在大腸桿菌菌株(見(jiàn)上),然而E.albertii和E.fergusonii不屬于這個(gè)群體,。事實(shí)上,,在包括類(lèi)型菌株在內(nèi)的系統(tǒng)基因組研究中,所有志賀菌都被放在大腸桿菌的一個(gè)亞種內(nèi),,因此很難進(jìn)行相應(yīng)的重新分類(lèi),。所有常用的研究菌株大腸桿菌屬于a組,主要來(lái)源于Clifton的K-12菌株(λ?f?,。O16)并且在較小程度上來(lái)自d'Herelle的大腸桿菌菌株(B菌株)(O7),。斯瓦特貝赫山克里布所菌枯草芽孢桿菌定殖、繁殖速度更快,。
銅綠假單胞菌低溫保存法主要為簡(jiǎn)單保存法,,將瓊脂斜面孢子培養(yǎng)物、菌絲懸浮液以及由麩皮,、大米,、小米等谷物原料制成的孢子培養(yǎng)物置于4攝氏度冰箱保存,保存時(shí)間不超過(guò)1~2個(gè)月,,若將谷物原料制備的孢子瓶抽真空并在棉塞上浸蠟,,以隔絕外界空氣和水汽,保持時(shí)間可達(dá)3~4個(gè)月,。液氮較低溫保存法,,將生長(zhǎng)穩(wěn)定期的細(xì)胞懸浮在10%甘油或其他低冰點(diǎn)液體中,,密封于安瓿管內(nèi),然后控制冷卻速度,,使安瓿管溫度逐步下降至-35攝氏度時(shí),,即可置于-150~-196攝氏度的液氮罐中保存。大多數(shù)微生物如病毒,、噬菌體,、多種細(xì)菌、放線菌,、酵母和原蟲(chóng),、特別是一些用冷凍干燥法有困難的微生物,都可用此法長(zhǎng)期保存,。
有些銅綠假單胞桿菌的保藏方法,,如濾紙保藏法、液氮保藏法和冷凍干燥保藏法等均需使用保護(hù)劑來(lái)制備細(xì)胞懸液,,以防止因冷凍或水分不斷升華對(duì)細(xì)胞的損害,。保護(hù)性溶質(zhì)可通過(guò)氫和離子鍵對(duì)水和細(xì)胞所產(chǎn)生的親和力來(lái)穩(wěn)定細(xì)胞成分的構(gòu)型。保護(hù)劑有牛乳,、血清,、糖類(lèi)、甘油,、二甲亞砜等,。銅綠假單胞桿菌的多聚酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)基本原理類(lèi)似于DNA的天然復(fù)制過(guò)程,其特異性依賴(lài)于與靶序列兩端互補(bǔ)的寡核苷酸引物,。PCR由變性,、退火、延伸三個(gè)基本反應(yīng)步驟構(gòu)成模板DNA經(jīng)加熱至93攝氏度左右一定時(shí)間后,,使模板DNA雙鏈或經(jīng)PCR擴(kuò)增形成的雙鏈DNA解離,,使之成為單鏈,以便它與引物結(jié)合,,為下輪反應(yīng)作準(zhǔn)備,。不同的大腸桿菌有不同的培養(yǎng)原理。
SHBCCD24508高加索酸奶乳桿菌SHBCCD24509瑞士乳桿菌SHBCCD24510乳桿菌屬SHBCCD24511類(lèi)干酪乳桿菌SHBCCD24512類(lèi)干酪乳桿菌SHBCCD24513瑞士乳桿菌SHBCCD24514乳桿菌屬SHBCCD24515乳桿菌屬SHBCCD24516鏈球菌屬SHBCCD24517發(fā)酵乳桿菌SHBCCD24518類(lèi)干酪乳桿菌SHBCCD24519發(fā)酵乳桿菌SHBCCD24520德氏乳桿菌SHBCCD24521鏈球菌屬SHBCCD24522戊糖乳桿菌SHBCCD24523片球菌屬SHBCCD24524戊糖乳桿菌SHBCCD24525消化乳桿菌SHBCCD24526瑞士乳桿菌SHBCCD24527產(chǎn)馬乳酒乳桿菌SHBCCD24528產(chǎn)馬乳酒乳桿菌SHBCCD24529乳桿菌屬SHBCCD24530德氏乳桿菌SHBCCD24531發(fā)酵乳桿菌SHBCCD24532乳球菌屬SHBCCD24533乳球菌屬SHBCCD24534鏈球菌屬SHBCCD24535戊糖乳桿菌SHBCCD24536乳桿菌屬SHBCCD24537類(lèi)干酪乳桿菌SHBCCD24538醋化醋桿菌奧爾蘭亞種SHBCCD24539巴氏醋桿菌羅旺亞種SHBCCD24540巴氏醋桿菌巴氏亞種SHBCCD24541巴氏醋桿菌巴氏亞種SHBCCD24542巴氏醋桿菌巴氏亞種SHBCCD24543巴氏醋桿菌巴氏亞種SHBCCD24544巴氏醋桿菌巴氏亞種SHBCCD24545巴氏醋桿菌羅旺亞種SHBCCD24546巴氏醋桿菌羅旺亞種SHBCCD24547巴氏醋桿菌巴氏亞種SHBCCD24548巴氏醋桿菌羅旺亞種SHBCCD24549巴氏醋桿菌羅旺亞種 銅綠假單胞菌普遍存在于假單胞菌屬的其他細(xì)菌以及肺炎桿菌,、大腸桿菌,、霍亂弧菌等g-細(xì)菌中。產(chǎn)黑色鏈霉菌菌株
大腸桿菌的發(fā)生與流行傳染是呈世界性分布的,。震顫厄氏菌菌株
大腸桿菌包括大量的細(xì)菌群體,,它們表現(xiàn)出高度的遺傳和表型多樣性。對(duì)大量分離的大腸桿菌和相關(guān)細(xì)菌進(jìn)行基因組測(cè)序表明,,需要對(duì)其進(jìn)行分類(lèi)重組,。然而,,這并沒(méi)有做到,主要是因?yàn)樗卺t(yī)學(xué)上的重要性以及大腸桿菌仍然是至多樣化的細(xì)菌物種之一:在一個(gè)典型的大腸桿菌基因組中,,只有20%的基因在所有菌株之間共享,。事實(shí)上,從進(jìn)化的角度來(lái)看,,志賀氏桿菌屬的成員(痢疾志賀菌,,福氏志賀菌,鮑氏志賀菌和宋內(nèi)志賀菌)應(yīng)該被歸類(lèi)為大腸桿菌菌株,,這一現(xiàn)象被稱(chēng)為偽裝的分類(lèi)群,。同樣,大腸桿菌的其他菌株(如重組DNA工作中常用的K-12菌株)也有足夠的不同,,因此需要重新分類(lèi),。震顫厄氏菌菌株
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