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佛山Quantagene q225qPCR儀材質(zhì)

來源: 發(fā)布時間:2023-06-07

qpcr的檢測原理:qPCR主要是使用插入染料或熒光探針(例如TaqMan),利用實時積累的熒光信號監(jiān)測整個擴增過程,,然后通過標(biāo)準(zhǔn)曲線來對未知模板進(jìn)行定量分析,。qPCR 主要是依賴于標(biāo)準(zhǔn)品制備標(biāo)準(zhǔn)曲線,,進(jìn)而去確定未知樣品的濃度,因此是一種相對定量的方法,。隨著PCR的循環(huán)進(jìn)行,,染料熒光強度增加,從而檢測到定量反應(yīng)的DNA,。SYBR Green是一種DNA插入染料,,范圍廣用于qPCR。雖然SYBR Green方法比探針方法便宜,,但是特異性沒有熒光探針方法好,。q225pcr無需參比染料、無需定期校準(zhǔn),,更加簡化的操作流程與減輕的維護負(fù)擔(dān)只為更好地專注于實驗,。佛山Quantagene q225qPCR儀材質(zhì)

內(nèi)標(biāo)在傳統(tǒng)定量中的作用:由于傳統(tǒng)定量方法都是終點檢測,即PCR到達(dá)平臺期后進(jìn)行檢測,,而PCR經(jīng)過對數(shù)期擴增到達(dá)平臺期時,,檢測重現(xiàn)性極差。同一個模板在96孔PCR儀上做96次重復(fù)實驗,,所得結(jié)果有很大差異,,因此無法直接從終點產(chǎn)物量推算出起始模板量。加入內(nèi)標(biāo)后,,可部分消除終產(chǎn)物定量所造成的不準(zhǔn)確性,。但即使如此,傳統(tǒng)的定量方法也都只能算作半定量,、粗略定量的方法,。3.內(nèi)標(biāo)對定量PCR的影響:若在待測樣品中加入已知起始拷貝數(shù)的內(nèi)標(biāo),則PCR反應(yīng)變?yōu)殡p重PCR,,雙重PCR反應(yīng)中存在兩種模板之間的干擾和競爭,,尤其當(dāng)兩種模板的起始拷貝數(shù)相差比較大時,這種競爭會表現(xiàn)得更為***,。但由于待測樣品的起始拷貝數(shù)是未知的,,所以無法加入合適數(shù)量的已知模板作為內(nèi)標(biāo)。也正是這個原因,,傳統(tǒng)定量方法雖然加入內(nèi)標(biāo),,但仍然只是一種半定量的方法。珠海熒光定量qPCR儀采購Taqman探針法因特異性高,,被廣泛應(yīng)用于等位基因鑒別,、SNP分型、病原體和病毒檢測,、多重定量等,。

所有儀器的操作都基本一致,。設(shè)置的時候包括反應(yīng)板設(shè)置(plate setup)和程序設(shè)置(program setup)。我們以 ABI StepOne為例,,詳細(xì)看一下反應(yīng)設(shè)置:A. 首先是實驗?zāi)康倪x擇:定量還是其他,。我們命名為“BioTeke”,進(jìn)行“定量”實驗,。B. 實驗方法的選擇:我們選用的比較Ct的SYBR Green方法,, Fast程序,以cDNA為模板進(jìn)行,。C. 目的基因的設(shè)置:有幾個目的基因和目的基因的名稱,。D. 樣品的設(shè)置:包括哪個是實驗組,哪個是對照組,。以及負(fù)對照的設(shè)置和生物重復(fù)的設(shè)置,。E. 對照組和內(nèi)參基因的設(shè)置:這個是為后面的定量做準(zhǔn)備F. 反應(yīng)程序的設(shè)置:PCR反應(yīng)程序的設(shè)置要根據(jù)不同公司的MasterMix。比如BioTeke的95℃ 2分鐘就可以DNA聚合酶(ABI的需要10 分鐘),。循環(huán)反應(yīng)是95℃15秒,,60℃15秒的40個循環(huán)。溶解曲線程序采用儀器默認(rèn)設(shè)置就可以,?;蛘呤莾x器說明書上建議的程序。G. 反應(yīng)體系的設(shè)置:A-G這五個步驟簡單設(shè)置好,,可以保存,,修改反應(yīng)程序或者立刻進(jìn)行反應(yīng)。


實時熒光定量PCR(QPCR):一般用于檢測樣品中目的基因的表達(dá)量,。比如:在實驗過程中,,構(gòu)建了目的基因的過表達(dá)載體,轉(zhuǎn)染進(jìn)細(xì)胞后,,實驗中需要在轉(zhuǎn)錄水平和蛋白水平檢測目的基因的表達(dá),,轉(zhuǎn)錄水平就需要用到QPCR,蛋白水平就是WB,。也可用于檢測基因組DNA中目的基因的拷貝數(shù),。主要步驟:從細(xì)胞/血液/組織中提取RNA,檢測RNA純度-去除基因組DNA-逆轉(zhuǎn)錄成cDNA-配置QPCR預(yù)混液-QPCR96孔板排版加樣,,3個復(fù)孔-上機QPCR儀器檢測-據(jù)CT值分析實驗結(jié)果,。根據(jù)熒光類型主要分為熒光嵌合法(又稱為染料法)和熒光探針法。 qPCR熒光標(biāo)記法分為SYBR Green I染料法為主的熒光染料嵌合法,,以Taqman探針法為主的熒光探針法.

qPCR和dPCR:研究人員已經(jīng)通過兩種方式克服了定量PCR分析的挑戰(zhàn):實時定量PCR(qPCR)和數(shù)字PCR(dPCR)。qPCR主要使用插入染料或熒光探針(例如TaqMan),。通過監(jiān)測PCR期間的熒光強度,,可以比較多個樣品的DNA水平,。數(shù)字PCR(dPCR)的基本工作原理很簡單。先將樣品分為多個PCR反應(yīng),,每個反應(yīng)多包含一個模板,。然后通過對陽性和陰性反應(yīng)進(jìn)行計數(shù)來確定初始樣品中模板分子的數(shù)量。盡管qPCR和dPCR都能夠定量樣品中的核酸,,但它們有一個重要的區(qū)別,。qPCR只能實現(xiàn)相對定量(例如,樣品A的目標(biāo)序列是樣品B的目標(biāo)序列的兩倍),,除非使用此標(biāo)準(zhǔn)生成標(biāo)準(zhǔn)曲線,。數(shù)字PCR本身是定量的,不需要標(biāo)準(zhǔn)曲線,。另一方面,,qPCR技術(shù)更加成熟和眾所周知,市場上有大量商業(yè)產(chǎn)品可供選擇,。dPCR仍然是小的新鮮肉,。它不如qPCR使用且價格昂貴。與dPCR相比,,qPCR更適合于高通量分析,,并且動態(tài)范圍廣。經(jīng)熒光定量PCR儀器檢測后,,對核酸進(jìn)行定性和定量分析,。佛山Quantagene q225qPCR儀材質(zhì)

使用 PCR 擴增 DNA 是當(dāng)今實驗室的一項基礎(chǔ)技術(shù),創(chuàng)新不斷將其應(yīng)用范圍從研究實驗室擴展到臨床,。佛山Quantagene q225qPCR儀材質(zhì)

TaqMan qPCR:該測定不使用嵌入染料,,而是使用帶有 5' 熒光報告染料和 3' 淬滅染料的 TaqMan 探針。 這些探針是目標(biāo)特異性的,,并且在退火步驟中與引物之一下游的目標(biāo) DNA 序列結(jié)合,。 當(dāng) Taq 聚合酶在延伸階段遇到 TaqMan 探針時,它會置換并切割 5' 報告染料,。 一旦報告染料與淬滅染料分離,,其在每個 qPCR 循環(huán)結(jié)束時的可測量熒光信號就會顯著增加。 第二條 DNA 鏈?zhǔn)瞧叫泻铣傻?,但由于沒有探針附著在它上面,,因此無法通過熒光測量來監(jiān)測這一過程。與 SYBR Green 檢測相比,,使用 TaqMan 探針的成本更高,,但也具有兩個顯著優(yōu)勢:TaqMan 檢測測量目標(biāo)序列的擴增進(jìn)程,因為探針是目標(biāo)特異性的,。您可以通過向主混合物中添加不同的引物和具有不同報告染料的 TaqMan 探針來監(jiān)測單個反應(yīng)中各種 qPCR 產(chǎn)物的數(shù)量,。 這種多重方法允許您在每個熱循環(huán)結(jié)束時檢測多個熒光信號,。佛山Quantagene q225qPCR儀材質(zhì)

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