運用生物技術：TMT標記定量蛋白質(zhì)組學、PRM蛋白靶向驗證由鹿明生物提供技術支持：2021年12月,，上海交通大學張荻課題組在Frontiers in Plant Science發(fā)表題為 TMT-Based Quantitative Proteomic Analysis Reveals the Physiological Regulatory Networks of Embryo Dehydration Protection in Lotus(Nelumbo nucifera)的研究成果,，通過TMT標記蛋白質(zhì)組學和平行反應監(jiān)測蛋白靶向驗證(PRM)技術研究方法,，構建了蓮花胚胎脫水保護的生理調(diào)控網(wǎng)絡,。為揭示荷花種子長壽的脫水保護機制提供了新的見解,。蛋白質(zhì)組學-鹿明生物丨歐易生物,。內(nèi)蒙古非靶向蛋白組學

隨著美國臨床蛋白質(zhì)組**分析項目（CPTAC）和中國人類蛋白質(zhì)組計劃(CNHPP)等大型蛋白質(zhì)組學研究計劃的推進,，發(fā)表了一系列**的大規(guī)模人群多組學分析文章[2,3],。這些高分文章通過基因組學、轉(zhuǎn)錄組學,、蛋白質(zhì)組學,、磷酸化蛋白質(zhì)組學、代謝組學,、微生物組學等技術,，在上百例的病例樣本中***表征了某種**的分子特征。對比這些文章,，可以發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)組學數(shù)據(jù)在多組學數(shù)據(jù)分析中逐漸成為**結果，且蛋白質(zhì)組學數(shù)據(jù)分析有些共同特點,，即：1）基于蛋白質(zhì)組進行**分子分型2）分析不同亞型患者的臨床特征3）免疫,、代謝,、突變,、微生物等**領域研究熱點在不同亞型中的差別分析4）篩選亞型特征分子作為預后標志物或潛在的藥靶進行驗證或機制研究該文是樊嘉院士/周虎研究員/高大明研究員/**教授團隊繼2019年Cell發(fā)表的肝細胞*多組學研究后,，同樣基于蛋白質(zhì)組為**的多組學聯(lián)合分析策略,，進一步闡釋了蛋白質(zhì)組學驅(qū)動精細醫(yī)學的優(yōu)勢,，為**的發(fā)***展機制、分子分型,、預后監(jiān)測和個性化***策略提供新思路,。廣東蛋白組學 武漢靶向蛋白質(zhì)組學,，信號通路蛋白靶點高通量分析,。

采用RNA-Seq轉(zhuǎn)錄組學分析和DIA蛋白質(zhì)組學分析，研究了AC和AL對db/db小鼠的影響,。轉(zhuǎn)錄組分析共鑒定出16812種不同的蛋白質(zhì)編碼轉(zhuǎn)錄本,。其中，2837個（約16.9%）在正常組和對照組之間有***差異,，表明db/db小鼠在轉(zhuǎn)錄水平上與野生型小鼠***不同。與對照組相比,，共有3749個基因因攝入AC而發(fā)生***改變（2201個下調(diào),，1548個上調(diào)）,，560個基因（430個下調(diào)，130個上調(diào)）因攝入AL而發(fā)生***改變（圖3B）,。DIA蛋白質(zhì)組學分析鑒定出2729種蛋白質(zhì),。正常組和對照組之間共發(fā)現(xiàn)1059個（約占總鑒定蛋白質(zhì)的38.8%）DEPs,，AC處理有230個蛋白質(zhì)發(fā)生***變化（109個上調(diào),，121個下調(diào)）,，AL處理有211個蛋白質(zhì)發(fā)生***變化（116個上調(diào),，95個下調(diào)）。

iTRAQ標記定量蛋白組學研究方法：2021年4月，南京林業(yè)大學喻方圓教授（一作：吳岐奎）課題組在JournaloftheScienceofFoodandAgriculture期刊發(fā)表了題為“ProteomicanalysisofmetabolicmechanismsassociatedwithfattyacidbiosynthesisduringStyraxtonkinensiskerneldevelopment”的研究成果,，通過轉(zhuǎn)錄組學+iTRAQ標記定量蛋白組學研究方法,，分析東京野茉莉種子發(fā)育過程中脂肪酸生物合成相關基因的表達趨勢，確定油脂積累的主要影響因子并構建其調(diào)控網(wǎng)絡,。為野茉莉?qū)僦参锓N子油用研究和后續(xù)功能分析研究提供了一定的研究基礎,。蛋白組學研究組織,血液,植物,尿液,動物,細胞樣品,酵母,微生物.,。

DIA蛋白組學：SAPHO綜合征是一種侵犯皮膚和骨骼的炎癥性疾病，其發(fā)病率低,，表現(xiàn)形式多樣,，診斷困難。2022年1月,，由北京中醫(yī)藥大學課題組在J Proteomics.期刊發(fā)表的題為“Complement system deregulation in SAPHO syndrome revealed by proteomic profiling”的研究成果，通過DIA蛋白組學研究方法,，***揭示了SAPHO患者的血清蛋白質(zhì)組譜,，為疾病診斷提供了潛在的生物標志物,。同時作者發(fā)現(xiàn)補體系統(tǒng)抑制劑如CFH和C4BP在SAPHO綜合征中表達上調(diào),，這可能在SAPHO綜合征的發(fā)病機制中發(fā)揮重要作用,。一站式服務,蛋白組學研究不同生物體在不同時刻/狀態(tài)下蛋白質(zhì)表達的變化。福建蛋白組學差異

蛋白質(zhì)組學技術簡介及應用場景。內(nèi)蒙古非靶向蛋白組學

采用TMT標記定量蛋白質(zhì)組學技術對三個脫水特殊階段（21,、27和40DAP）的新鮮蓮種胎進行了蛋白質(zhì)組學分析,，共鑒定了5,477個蛋白質(zhì)。對測試樣本進行了PCA分析,，結果顯示,，不同組間樣品具有很好的區(qū)分，每組的三個重復樣本被聚集在一起,。PCA的前兩個成分占總方差的70％以上（圖2A）,。三個試驗組之間共有815個差異表達蛋白。其中,，198個（32%）和198個（26%）蛋白質(zhì)豐度增加,，而420個（68%）和558個（74%）蛋白質(zhì)豐度在27DAP和40DAP組分別下降（圖2B）。只有30個蛋白質(zhì)的豐度在27DAP和40DAP組之間具有***變化（圖2C）,。內(nèi)蒙古非靶向蛋白組學

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