定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究：2022年2月,，上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院食用菌研究所鮑大鵬研究員課題組在《FrontiersinMicrobiology》期刊發(fā)表的題為“OxidativeStressandAutophagyAreImportantProcessesinPostRipenessandBrownFilmFormationinMyceliumofLentinulaedodes”的研究成果，通過iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué),、GC-MS非靶向代謝組學(xué)等技術(shù)對(duì)香菇菌絲進(jìn)行定量蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)分析,，發(fā)現(xiàn)氧化應(yīng)激和自噬是香菇菌絲后熟轉(zhuǎn)色重要過程，并對(duì)其在蛋白質(zhì)組和代謝組水平上的分子機(jī)制有了新的認(rèn)識(shí),。涉及的歐易/鹿明生物服務(wù)產(chǎn)品：iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué),、GC-MS非靶向代謝組學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)的特點(diǎn)蛋白質(zhì)組和蛋白質(zhì)組學(xué)的概念。廣東蛋白組學(xué)怎么做

為了驗(yàn)證iTRAQ標(biāo)記蛋白組學(xué)分析測(cè)定的蛋白積累變化,，選擇兩種蛋白進(jìn)行westernblot分析,。如圖4A所示，iTRAQ分析中兩種蛋白(RPD3和VMA3)的積累每次均與westernblot數(shù)據(jù)一致,。RPD3,、TOR1、VMA3和VAC8在基因水平上的相對(duì)表達(dá)量與蛋白水平相似,，在BF的菌絲中也表達(dá)上調(diào)(圖4B-D),。VAC8在2－1、3－1,、4－1組的基因水平上高度上調(diào),。這些結(jié)果表明，這些上調(diào)的表達(dá)蛋白可能是香菇BF形成的重要蛋白,。本研究利用標(biāo)記定量(iTRAQ)蛋白質(zhì)組學(xué),、基于氣相色譜-質(zhì)譜的代謝組學(xué)GC-MS非靶向代謝組學(xué)和透射電鏡分析細(xì)胞結(jié)構(gòu)，研究了香菇菌絲后熟轉(zhuǎn)色形成的機(jī)制,，并且***證明氧化應(yīng)激和自噬過程是至關(guān)重要,，為后續(xù)進(jìn)一步的研究提供了新的見解。山東蛋白組學(xué)應(yīng)用一站式服務(wù),蛋白組學(xué)研究不同生物體在不同時(shí)刻/狀態(tài)下蛋白質(zhì)表達(dá)的變化,。

蛋白質(zhì)組學(xué)(由鹿明生物提供技術(shù)支持),；2021年8月，中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究所趙春華和韓欽課題組在Aging and disease期刊發(fā)表了題為“MSC-derived Exosomes can Enhance the Angiogenesis of Human Brain MECs and show Therapeutic Potential in a Mouse Model of Parkinson's Disease”的研究成果,，通過蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法,，發(fā)現(xiàn)了間充質(zhì)干細(xì)胞衍生的外泌體可以通過增加ICAM1的表達(dá)來促人腦MECs血管生成,，并減輕MPP+對(duì)細(xì)胞的損傷，***間充質(zhì)干細(xì)胞衍生外泌體***帕金森的可能性,。

DIA蛋白組學(xué)：SAPHO綜合征是一種侵犯皮膚和骨骼的炎癥性疾病,，其發(fā)病率低，表現(xiàn)形式多樣,，診斷困難,。2022年1月，由北京中醫(yī)藥大學(xué)課題組在J Proteomics.期刊發(fā)表的題為“Complement system deregulation in SAPHO syndrome revealed by proteomic profiling”的研究成果,，通過DIA蛋白組學(xué)研究方法,，***揭示了SAPHO患者的血清蛋白質(zhì)組譜，為疾病診斷提供了潛在的生物標(biāo)志物,。同時(shí)作者發(fā)現(xiàn)補(bǔ)體系統(tǒng)抑制劑如CFH和C4BP在SAPHO綜合征中表達(dá)上調(diào),，這可能在SAPHO綜合征的發(fā)病機(jī)制中發(fā)揮重要作用。蛋白質(zhì)組學(xué)基本策略 研究基礎(chǔ) 研究?jī)?nèi)容 研究意義背景,。

為了驗(yàn)證TMT蛋白組學(xué)數(shù)據(jù),，作者選擇了18個(gè)與蓮種胚脫水保護(hù)功能密切相關(guān)的候選DEPs進(jìn)行PRM蛋白靶向驗(yàn)證。PRM鑒定了18個(gè)候選DEPs,。這些蛋白質(zhì)的表達(dá)模式在PRM和TMT的定量結(jié)果之間顯示出類似的趨勢(shì),。然而，PRM檢測(cè)到的蛋白豐度的倍數(shù)變化值要大于TMT數(shù)據(jù),。這一結(jié)果在很大程度上支持了TMT數(shù)據(jù)的可靠性,。基于TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)的生物信息學(xué)分析,，對(duì)脅迫生理指標(biāo)進(jìn)行了測(cè)定,，以驗(yàn)證蓮種胚脫水的保護(hù)機(jī)制。在快速脫水階段,，REC和MDA含量的變化與RWC相反,，它們的水平迅速增加（圖6A，B）,。ABA含量在快速脫水和脫水成熟階段前略有增加（圖6C）,。上單細(xì)胞蛋白組學(xué)之質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù) 。上海血清蛋白組學(xué)

歐易鹿明生物蛋白質(zhì)研究技術(shù),。廣東蛋白組學(xué)怎么做

本研究采用串聯(lián)質(zhì)量標(biāo)簽（TMT）標(biāo)記的蛋白質(zhì)組學(xué)和平行反應(yīng)監(jiān)測(cè)（PRM）技術(shù),，對(duì)蓮子脫水過程中的生理調(diào)控網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行了深入研究表明，碳水化合物代謝（包括糖酵解/糖異成,、半乳糖代謝、淀粉和蔗糖代謝,、磷酸戊糖途徑和細(xì)胞壁組織）,、ER中的蛋白質(zhì)加工,、DNA修復(fù)和抗氧化事件對(duì)蓮種胎脫水有積極的反應(yīng)。在蓮種胚脫水過程中,，非酶促抗氧化劑和戊糖磷酸和維生素E作為主要的抗氧化劑,，在脫水過程中維持荷花胚胎的REDOX平衡。這些結(jié)果為揭示荷花胚胎脫水保護(hù)機(jī)制的生理學(xué)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)提供了酶途徑在抗氧化保護(hù)中起著主要作用,。應(yīng)激生理學(xué)檢測(cè)表明,，H2O2是誘發(fā)氧化應(yīng)激損傷的主要活性氧（ROS）成分，谷胱甘肽新的見解,。廣東蛋白組學(xué)怎么做

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