GC-MS非靶向代謝組，標題：銀納米顆粒改變種植和未種植黃瓜土壤中的微生物群落組成和代謝物譜期刊：EnvironmentalScience&Technology影響因子：9.028發(fā)表時間：2020年2月合作單位：南京大學環(huán)境學院運用生物技術：16SrRNA基因測序,、GC-MS非靶向代謝組（由鹿明生物提供技術支持）,。銀納米顆粒（AgNPs）是使用*****的工程納米材料之一，泄露可能導致顆粒在土壤中積累,，并對環(huán)境造成未知風險,。有報告指出AgNPs可能通過影響根系分泌物間接對微生物群落功能和基因組多樣性產生***影響，但對其機理了解甚少,。土壤代謝物可作為土壤微生物群落變化的表型特征,，但當前有關NPs暴露對土壤微生物群落影響的研究不包括對土壤代謝產物的分析,。16S rRNA基因序列可以提供改變的土壤微生物群相關信息，鑒于它們的已知功能,，人們可以對土壤生物化學的變化提出合理假設,。本文作者利用16S rRNA基因測序和非靶向代謝組學方法，研究了AgNPs對土壤微生物群落的長期影響,。代謝組學行業(yè)解決方案和技術服務流程,。北京靶向定量代謝組學

代謝組學等多組學研究,，2021年12月30日復旦大學附屬中山醫(yī)院樊嘉院士,、中國科學院上海藥物研究所周虎研究員、中國科學院分子細胞科學***創(chuàng)新中心高大明研究員,、復旦大學附屬中山醫(yī)院**教授課題組合作在Cancer Cell上發(fā)表題為“Proteogenomic characterization identifies clinically relevant subgroups of intrahepatic cholangiocarcinoma”的研究論文,，通過基因組學、轉錄組學,、蛋白質組學,、磷酸化蛋白質組學、微生物組學研究方法對262例肝內膽管*（iCCA）患者的配對**和*旁組織進行了分析,，通過繪制肝內膽管*的多維分子圖譜為進一步鑒定iCCA的分子發(fā)病機制,、分子分型、預后等提供了寶貴的資源,。上海gc-ms代謝組學非靶向代謝組學 土壤非靶向代謝組學 脂質組學研究,。

LC-MS靶向代謝組+16S微生物多樣性檢測研究。題目：糞便微生物可以區(qū)分酒精性肝炎引起的酒精攝入量,，但不能區(qū)分疾病的嚴重程度期刊：HepatologyIF=17.425研究思路：*樣本類型：人糞便*檢測平臺：LC-MS靶向代謝組,、16S微生物多樣性檢測為了表征酒精性肝炎有關的糞便微生物生態(tài)學，考察微生物組變化和疾病嚴重程度的關系,，推斷微生物生態(tài)學變化的功能相關性,，本文作者將中度或重度酒精性肝炎患者（MAH和SAH）的糞便微生物組與健康（HC）和重度飲酒對照組（HDC）進行比較，通過16SrRNA基因測序鑒定微生物群分類,，使用LC/MS平臺測量糞便短鏈脂肪酸（SCFA）含量,。重度飲酒患者與健康對照組相比、重度飲酒組與酒精性肝炎相比,，均可以發(fā)現(xiàn)明顯的微生物組特征分布,。但微生物分類不能區(qū)分中度和重度酒精性肝炎。在酒精性肝炎患者中,，糞便中短鏈脂肪酸與產生SCFA的微生物菌群均減少,，可以推斷出，酒精性肝炎患者的糞便微生物組有明顯的變化,，與酒精性肝炎的嚴重程度無關,。

GC-MS非靶向代謝組學等研究方法：2021年10月,，廣東石油化工大學環(huán)境科學與工程學院孫建騰教授課題組在《Chemosphere》期刊發(fā)表的題為“Metabolomic analysis and oxidative stress response reveals the toxicity in Escherichia coli induced by organophosphate flame retardants tris (2-chloroethyl) phosphate and triphenyl phosphate”的研究成果，通過GC-MS非靶向代謝組學等研究方法,，發(fā)現(xiàn)包括糖酵解/糖異生,、磷酸戊糖代謝、嘌呤代謝,、谷胱甘肽代謝,、胺素代謝，丙氨酸和天冬氨酸等代謝途徑被破壞,。大多數(shù)差異表達的代謝物被下調,，表明有機磷阻燃劑對代謝功能和關鍵代謝途徑有抑制作用。本研究揭示了生物中有機磷阻燃劑對環(huán)境產生的風險提供了新的見解,。歐易生物/鹿明生物提供專業(yè)的靶向代謝組學服務,。

本研究通過LC-MS和GC-MS雙平臺代謝組學研究方法，對92例樣品5個時間點的尿液樣品進行分析,，分別找到了33種和155種與PM和生物氣溶膠相關的差異標志物,，結果揭示了年輕健康人在五個不同時間點的尿液代謝譜的動態(tài)變化，采用KEGG通路富集分析和時間序列分析確定了與短期共同暴露于空氣中PM和生物氣溶膠相關的幾種潛在代謝物生物標志物,，發(fā)現(xiàn)短期高濃度暴露于PM可能會導致代謝改變并降低應激***水平,，這可能是與下丘腦-垂體-腎上腺和交感-腎上腺-髓質軸的***有關；而生物氣溶膠劑則通過***系統(tǒng)對病理性成癮有重要作用,。其中尿液中的16-脫氫孕酮可能是PM暴露的潛在生物標志物,；4-羥基苯乙醇可能是生物氣溶膠的潛在生物標志物，可用于分別預測或診斷PM或生物氣溶膠相關疾病,。代謝組學四大公司 代謝組學一般研究方法及步驟代謝組學分析流程,。上海功能代謝組學

代謝組學,代謝組數(shù)據(jù)庫,代謝組分析,利用非靶檢測尋找差異代謝物。北京靶向定量代謝組學

非靶向代謝組學研究：對于代謝物分析,，作者對非靶代謝組學測定,，共檢測到4,346種代謝物。根據(jù)所有檢測到的代謝物的投影中變量重要性（VIP）>1和p<0.05的篩選標準,，在不同的比較組***研究了961種差異累積代謝物（DAM）（表1）,。在A果實(AF)與B果實(BF)的相同成熟階段，發(fā)現(xiàn)S3的DAM比S1和S2更豐富,，這意味著DAM的主要變化發(fā)生在S3,。隨后，利用京都基因和基因組百科全書（KEGG）富集分析進一步了解與兩個東方甜瓜品種相關的生物學機制,。其中,，參與蔗糖和有機酸代謝的代謝物在果實中的積累差異更大，包括“半乳糖代謝”,、“磷酸戊糖途徑”,、“果糖和甘露糖代謝”,、“亞油酸代謝”和“花生四烯酸”。北京靶向定量代謝組學

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