iTRAQ標(biāo)記蛋白組學(xué)研究方法：2021年12月歐易/鹿明生物合作客戶甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)孫萬倉教授課題組在Scientific Reports期刊發(fā)表的題為 “iTRAQ-Based Quantitative Proteome Analysis Insights into Cold Stress of Winter Turnip Rapa (Brassica rapa L.) Grown in the Field ”的研究成果,，通過iTRAQ標(biāo)記蛋白組學(xué)+轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究方法，探究了莖尖分生組織的形態(tài)對冬油菜低溫耐受性中的作用,。中文標(biāo)題：iTRAQ標(biāo)記蛋白質(zhì)組學(xué)分析揭示了低溫脅迫對田間生長冬油菜的影響研究對象：白菜型冬油菜發(fā)表期刊：ScientificReports影響因子：4.17歐易生物鹿明生物蛋白組學(xué)聯(lián)合分析,。上海外泌體蛋白組學(xué)檢測

作者使用通過單細胞蛋白組學(xué)產(chǎn)生的數(shù)據(jù)來觀察在腎小球細胞或近端腎小管中***豐富的蛋白質(zhì)細胞。208個Glom富集區(qū)蛋白富含囊泡中間運輸和細胞成分組織調(diào)節(jié)作為其**重要的生物學(xué)過程,，細胞骨架蛋白結(jié)合和肌動蛋白結(jié)合是**重要的分子功能,，肌動蛋白細胞骨架是**豐富的細胞成分。富含247個PT的蛋白質(zhì)主要集中在小分子代謝過程和藥物代謝過程中,。在**重要的分子功能中,，這些蛋白質(zhì)的氧化還原酶活性和催化活性豐富。*在GLOM切片中發(fā)現(xiàn)的67種蛋白質(zhì)中,，有41種已被報導(dǎo)存在于腎臟中,，在這41種蛋白質(zhì)中，18種(43.9%)與單細胞蛋白組學(xué)結(jié)果一致,，23種(56.1%)在GLOM中與小管相比沒有增加,。北京蛋白組學(xué) 價格歐易鹿明生物基于質(zhì)譜技術(shù),生物信息學(xué)方法,提供蛋白質(zhì)組學(xué),。

在本研究中，利用iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)方法對東京野茉莉種子發(fā)育的4個時間點采樣進行蛋白質(zhì)組學(xué)分析,。獲得了2338個蛋白和1473個DEPs,。Mfuzz聚類分析顯示，在種子發(fā)育過程中,，轉(zhuǎn)錄本和蛋白質(zhì)組之間存在相當(dāng)大的時序一致性,。在四個發(fā)育時期中，花后70天（種子發(fā)育活躍期）是視為東京野茉莉種仁發(fā)育的關(guān)鍵時期：在該階段與脂肪酸生物合成相關(guān)的功能基因和酶蛋白均達到表達峰值,，同時種仁內(nèi)部大部分營養(yǎng)物質(zhì)開始迅速積累,。通過轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)和蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)綜合分析油脂合成的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，乙酰CoA羧化酶和**酸脫氫酶兩個酶體系處于中心位置,，在脂肪酸的合成過程中具有主導(dǎo)作用,。

2021年10月，中國科學(xué)院上海營養(yǎng)與健康研究所武愛波研究員課題組在《Ecotoxicology and Environmental Safety》（IF:6.291）發(fā)表了題為“Mycotoxin deoxynivalenol affects myoblast differentiation via downregulating cytoskeleton and ECM-integrin-FAK-RAC-PAK signaling pathway"的研究成果,，通過轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法,，探究了脫氧雪腐鐮刀菌烯醇（簡稱：DON，俗稱嘔吐***）對成肌細胞分化的影響,，發(fā)現(xiàn)了DON處理使得細胞骨架蛋白和細胞外基質(zhì)蛋白表達下調(diào),，并抑制ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信號通路的機理，為食品和飼料污染的防治提供了理論依據(jù),。其中轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白組學(xué)由歐易/鹿明生物提供技術(shù)支持,。定量蛋白質(zhì)組學(xué) 蛋白質(zhì)進行質(zhì)譜檢測未知蛋白進行全檢測。

綜上所述,，本研究應(yīng)用RNA-seq轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)合iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù),，探討油茶種子不同成熟期儲量積累的動態(tài)變化。此外,，作者還探討了黃酮類化合物和脂肪酸的生物合成和代謝可能的調(diào)控機制,。許多功能轉(zhuǎn)錄本(16530)和蛋白質(zhì)物種(1228)的模式發(fā)生了***變化，其中317個DAPs被轉(zhuǎn)錄組結(jié)果覆蓋,。結(jié)合結(jié)構(gòu)基因(蛋白)或轉(zhuǎn)錄因子的表達譜及相應(yīng)化合物的含量,，對重要代謝產(chǎn)物的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)進行了探討。結(jié)果表明,，黃酮類化合物的合成能力在種子成熟過程中逐漸減弱,，而脂肪酸的合成能力則先升高后下降。蛋白質(zhì)組學(xué) 找歐易生物-生物標(biāo)志物,、機制研究一站式服務(wù),。北京乳蛋白組學(xué)

蛋白組學(xué)方案為組學(xué)研究涉及的樣本獲取,前處理,數(shù)據(jù)采集到分析的各個環(huán)節(jié)提供自動化。上海外泌體蛋白組學(xué)檢測

為了驗證TMT蛋白組學(xué)數(shù)據(jù)，作者選擇了18個與蓮種胚脫水保護功能密切相關(guān)的候選DEPs進行PRM蛋白靶向驗證,。PRM鑒定了18個候選DEPs,。這些蛋白質(zhì)的表達模式在PRM和TMT的定量結(jié)果之間顯示出類似的趨勢。然而,，PRM檢測到的蛋白豐度的倍數(shù)變化值要大于TMT數(shù)據(jù),。這一結(jié)果在很大程度上支持了TMT數(shù)據(jù)的可靠性?；赥MT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)的生物信息學(xué)分析,，對脅迫生理指標(biāo)進行了測定,，以驗證蓮種胚脫水的保護機制,。在快速脫水階段，REC和MDA含量的變化與RWC相反,，它們的水平迅速增加（圖6A,，B）。ABA含量在快速脫水和脫水成熟階段前略有增加（圖6C）,。上上海外泌體蛋白組學(xué)檢測

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