4D蛋白組學(xué)：tims TOF Pro2依賴于雙捕集離子淌度（TIMS）和同步累積連續(xù)碎裂（PASEF）數(shù)據(jù)采集模式兩大創(chuàng)新技術(shù),，可實現(xiàn)快速采集、更高的靈敏度和特異性,。同時,，其配備了***一代雙 TIMS 分析器，離子容量可提高三倍,，比較大限度地提高了離子傳輸效率和靈敏度,，讓蛋白質(zhì)組學(xué)分析再上一個新的臺階，鹿明生物同時配備了Evosep One高通量色譜使其在短梯度下也能實現(xiàn)蛋白深度覆蓋,，結(jié)果更精細(xì)，也成為轉(zhuǎn)化組學(xué)應(yīng)用不可或缺的工具,。更高掃描速度：助力臨床大隊列項目研究,，更高覆蓋深度：助力蛋白組鑒定到更多的蛋白數(shù)量,，超高靈敏度：助力微量樣本蛋白組分析，鑒定更可信：助力蛋白或化合物更高可信度的鑒定,。蛋白組學(xué)研究組織,血液,植物,尿液,動物,細(xì)胞樣品,酵母,微生物.,。北京蛋白組學(xué)測試

蛋白組學(xué)研究案例：2022年1月，歐易/鹿明生物合作客戶北京中醫(yī)藥大學(xué)教育部中醫(yī)養(yǎng)生學(xué)重點實驗室劉銅華教授課題組在Frontiers in Nutrition期刊發(fā)表了題為 “Mechanisms for Improving Hepatic Glucolipid Metabolism by Cinnamic Acid and Cinnamic Aldehyde: An Insight Provided by Multi-Omics ”的研究成果,，通過轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法,，發(fā)現(xiàn)了肉桂酸（AC）和肉桂醛（AL）在改善葡萄糖脂代謝中的特征，探究了其代謝作用機理,。為預(yù)防和***代謝紊亂等疾病提供了理論依據(jù),。浙江蛋白組學(xué)的結(jié)果蛋白組學(xué)專業(yè)客服在線為您答疑 。

作者運用iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)對種子發(fā)育過程中蛋白質(zhì)表達(dá)的定量比較,，同時進(jìn)行GO和KEGG通路富集分析,。結(jié)果表明所有鑒定的蛋白被分為29類，主要涉及翻譯和碳水化合物代謝,。并且作者繪制了p值小于0.01的前20條KEGG通路的氣泡圖,。在三對比較中，普遍富集的途徑包括脂肪酸降解,、苯丙素生物合成和脂肪酸代謝,。其中，參與α-亞麻酸代謝的DAPs在S3 vs. S1組和S4 vs. S1組中都非?；钴S,。為了評估轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組之間的一致性，以及了解轉(zhuǎn)錄后的mRNA在蛋白質(zhì)水平上是如何表現(xiàn)的,，作者進(jìn)行了RNA-seq和iTRAQ分析的聯(lián)合分析,。證明DEGs和DAPs參與類黃酮的生物合成和脂肪酸代謝。

蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)分析鑒定出了幾種參與肝葡萄糖脂代謝的蛋白質(zhì)（ACC,、FASN,、SCD1、CPT1A,、GLUT2,、GK、GS,、G6Pase,、PEPCK）。此外,，AC顯示出抑制脂肪生成酶（ACC,，F(xiàn)ASN和SCD1）表達(dá)的趨勢，同時***上調(diào)了GLUT2,。與對照組相比,，AC***增加了PEPCK的表達(dá),，兩種化學(xué)物質(zhì)對G6Pase均無***影響（圖4A）。PRM蛋白靶向驗證測定結(jié)果與蛋白質(zhì)組變化相一致，這進(jìn)一步證實了蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)中蛋白質(zhì)的表達(dá)（圖4B）。轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)聯(lián)合分析結(jié)果顯示AC和AL***改善了線粒體功能,。GSEA分析顯示，處理組的氧化磷酸化（OXPHOS）通路***上調(diào),，AC組和AL組的富集得分分別為0.826和0.535。一站式服務(wù),研究不同生物體在不同時刻/狀態(tài)下蛋白質(zhì)表達(dá)的變化,。

綜上所述,，本研究應(yīng)用RNA-seq轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)合iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)，探討油茶種子不同成熟期儲量積累的動態(tài)變化,。此外,，作者還探討了黃酮類化合物和脂肪酸的生物合成和代謝可能的調(diào)控機制。許多功能轉(zhuǎn)錄本(16530)和蛋白質(zhì)物種(1228)的模式發(fā)生了***變化,，其中317個DAPs被轉(zhuǎn)錄組結(jié)果覆蓋,。結(jié)合結(jié)構(gòu)基因(蛋白)或轉(zhuǎn)錄因子的表達(dá)譜及相應(yīng)化合物的含量，對重要代謝產(chǎn)物的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行了探討,。結(jié)果表明,，黃酮類化合物的合成能力在種子成熟過程中逐漸減弱，而脂肪酸的合成能力則先升高后下降,。單細(xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué),，極微量樣本檢測。遼寧代謝組學(xué)與蛋白組學(xué)

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蛋白質(zhì)組學(xué),、磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)研究案例：2021年12月30日復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院樊嘉院士、中國科學(xué)院上海藥物研究所周虎研究員,、中國科學(xué)院分子細(xì)胞科學(xué)***創(chuàng)新中心高大明研究員,、復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院**教授課題組合作在Cancer Cell上發(fā)表題為“Proteogenomic characterization identifies clinically relevant subgroups of intrahepatic cholangiocarcinoma”的研究論文，通過基因組學(xué),、轉(zhuǎn)錄組學(xué),、蛋白質(zhì)組學(xué)、磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué),、微生物組學(xué)研究方法對262例肝內(nèi)膽管*（iCCA）患者的配對**和*旁組織進(jìn)行了分析,，通過繪制肝內(nèi)膽管*的多維分子圖譜為進(jìn)一步鑒定iCCA的分子發(fā)病機制、分子分型,、預(yù)后等提供了寶貴的資源,。北京蛋白組學(xué)測試

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