iTRAQ蛋白質(zhì)組學研究實用案例：2021年8月,，浙江大學藥學院何俏軍、羅沛華團隊在Autophagy期刊發(fā)表了題為“Autophagic degradation of CCN2 (cellular communication network factor 2) causes cardiotoxicity of sunitinib”的研究成果,，通過動物模型、功能實驗,、iTRAQ蛋白質(zhì)組學等研究方法,，發(fā)現(xiàn)了舒尼替尼誘導的自噬導致心肌細胞凋亡和心臟功能障礙，探究了舒尼替尼誘導的適應(yīng)不良自噬通過TOLLIP介導的內(nèi)體相關(guān)通路選擇性降解心肌細胞存活介質(zhì)CCN2的機理,，揭示了調(diào)節(jié)心肌細胞死亡的自噬降解新靶標蛋白,。為提高基于舒尼替尼的*****安全性提供了方法及理論依據(jù),。中文標題：CCN2的自噬降解導致舒尼替尼的心臟毒性研究對象：小鼠發(fā)表期刊：Autophagy影響因子：16.016發(fā)表時間：2021年8月合作單位：浙江大學藥學院運用生物技術(shù)：iTRAQ蛋白質(zhì)組學(由鹿明生物提供技術(shù)支持)蛋白組學研究必看的經(jīng)典綜述,。山東dia定量蛋白組學
采用TMT標記定量蛋白質(zhì)組學技術(shù)對三個脫水特殊階段（21、27和40DAP）的新鮮蓮種胎進行了蛋白質(zhì)組學分析,，共鑒定了5,477個蛋白質(zhì),。對測試樣本進行了PCA分析，結(jié)果顯示,，不同組間樣品具有很好的區(qū)分,，每組的三個重復(fù)樣本被聚集在一起。PCA的前兩個成分占總方差的70％以上（圖2A）,。三個試驗組之間共有815個差異表達蛋白,。其中，198個（32%）和198個（26%）蛋白質(zhì)豐度增加,，而420個（68%）和558個（74%）蛋白質(zhì)豐度在27DAP和40DAP組分別下降（圖2B）,。只有30個蛋白質(zhì)的豐度在27DAP和40DAP組之間具有***變化（圖2C）。安徽外泌體蛋白組學檢測蛋白組學常見研究模式 | 蛋白質(zhì)組專題_鹿明生物,。
iTRAQ標記定量蛋白組學研究方法：2021年4月,，南京林業(yè)大學喻方圓教授（一作：吳岐奎）課題組在JournaloftheScienceofFoodandAgriculture期刊發(fā)表了題為“ProteomicanalysisofmetabolicmechanismsassociatedwithfattyacidbiosynthesisduringStyraxtonkinensiskerneldevelopment”的研究成果，通過轉(zhuǎn)錄組學+iTRAQ標記定量蛋白組學研究方法,，分析東京野茉莉種子發(fā)育過程中脂肪酸生物合成相關(guān)基因的表達趨勢,，確定油脂積累的主要影響因子并構(gòu)建其調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。為野茉莉?qū)僦参锓N子油用研究和后續(xù)功能分析研究提供了一定的研究基礎(chǔ),。
作者使用通過單細胞蛋白組學產(chǎn)生的數(shù)據(jù)來觀察在腎小球細胞或近端腎小管中***豐富的蛋白質(zhì)細胞,。208個Glom富集區(qū)蛋白富含囊泡中間運輸和細胞成分組織調(diào)節(jié)作為其**重要的生物學過程，細胞骨架蛋白結(jié)合和肌動蛋白結(jié)合是**重要的分子功能,，肌動蛋白細胞骨架是**豐富的細胞成分,。富含247個PT的蛋白質(zhì)主要集中在小分子代謝過程和藥物代謝過程中。在**重要的分子功能中,，這些蛋白質(zhì)的氧化還原酶活性和催化活性豐富,。*在GLOM切片中發(fā)現(xiàn)的67種蛋白質(zhì)中,，有41種已被報導存在于腎臟中，在這41種蛋白質(zhì)中,，18種(43.9%)與單細胞蛋白組學結(jié)果一致,，23種(56.1%)在GLOM中與小管相比沒有增加。修飾蛋白質(zhì)組試劑及服務(wù),，蛋白質(zhì)組學解決方案,。
蛋白質(zhì)磷酸化修飾是指在磷酸化激酶的作用下將ATP的磷酸基轉(zhuǎn)移到蛋白質(zhì)特定氨基酸上的過程，是生物體內(nèi)**為常見,、**為重要的翻譯后修飾之一,。生物體內(nèi)蛋白質(zhì)的磷酸化修飾是一個瞬時且可逆的過程，通過磷酸化修飾可以改變蛋白質(zhì)空間構(gòu)象,，從而影響蛋白質(zhì)的定位,、活性及其與其他蛋白的相互作用上海鹿明生物科技有限公司多年來，一直專注于生命科學和生命技術(shù)領(lǐng)域,，是國內(nèi)早期開展以蛋白組學和代謝組學為基礎(chǔ)的多層組學整合實驗與分析的團隊,。影響因子：13.511發(fā)表時間：2022-01-06發(fā)表單位：***醫(yī)學研究院生物工程研究所運用生物技術(shù)：磷酸化蛋白質(zhì)組學（歐易鹿明提供）、LC-MS靶向代謝組學蛋白組學方案為組學研究涉及的樣本獲取,前處理,數(shù)據(jù)采集到分析的各個環(huán)節(jié)提供自動化,。江蘇蛋白組學 武漢
蛋白質(zhì)組與代謝組聯(lián)合分析,。山東dia定量蛋白組學
轉(zhuǎn)錄組學和蛋白質(zhì)組學分析作者通過轉(zhuǎn)錄組學和蛋白質(zhì)組學分析暴露于DON的C2C12細胞的差異基因（DEG）。轉(zhuǎn)錄組學鑒定了2387個DEG,，其中72%被下調(diào),。蛋白質(zhì)組學鑒定出402個DEG，其中74%被下調(diào),。GO和KEGG通路富集分析表明,，轉(zhuǎn)錄組學DEGs參與了“男性主要性征的發(fā)育”、“骨骼肌肌球蛋白粗絲組裝”和“骨骼肌收縮的調(diào)節(jié)”等生物學過程,。**富集的通路是“ECM-受體相互作用”,、“人**瘤病毒***”和“蛋白質(zhì)消化吸收”。蛋白質(zhì)組學分析中,，富集到了“肌肉收縮”,、“中間絲解聚”和“脂質(zhì)轉(zhuǎn)運”等生物學過程。細胞成分中富集到“細胞骨架”,、“細胞外基質(zhì)”和“整合素”,。KEGG通路富集到“新霉素、卡那霉素和慶大霉素生物合成”,、“系統(tǒng)性紅斑狼瘡”,、“ECM-受體相互作用”和“蛋白質(zhì)消化和吸收”。前兩條通路與上調(diào)的DEG相關(guān),，而后兩條通路與下調(diào)的DEG相關(guān),，這與轉(zhuǎn)錄組學結(jié)果一致,。山東dia定量蛋白組學
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