通過蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜鑒定,、PRM靶向鑒定、iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)等研究方法,，發(fā)現(xiàn)了N-豆蔻?；诟闻K**發(fā)生中發(fā)揮重要作用，揭示了NMT1的N-豆蔻?；种瓶?*發(fā)生的NDP,，并通過干擾泛素化來刺激促**發(fā)生的NUP機(jī)制。為靶向N-豆蔻酰化和NMT1可能有助于***肝*提供了理論依據(jù),。中文標(biāo)題：NMT1依賴于POTEE發(fā)生N-豆蔻?；⑼ㄟ^差異調(diào)節(jié)靶標(biāo)的泛素化來刺激肝臟**的發(fā)生研究對象：細(xì)胞、小鼠,、人**組織發(fā)表期刊：FrontiersinOncology影響因子：6.244發(fā)表時間：2021年5月合作單位：上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬上海兒童醫(yī)學(xué)中心運(yùn)用生物技術(shù)：iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué),、PRM靶向驗(yàn)證、質(zhì)譜鑒定,、qRT-PCR,、IHC、WB,、IP文章中iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)由歐易/鹿明生物提供技術(shù)支持蛋白組+代謝組+脂質(zhì)組-數(shù)據(jù)分析系統(tǒng),。山東蛋白組學(xué)特異細(xì)胞分析

為了更好地了解DON對C2C12細(xì)胞分化的影響，作者進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的整合分析,。共鑒定了149個共同的***差異基因（co-DEG）,，其中91%被共下調(diào)（圖3A）。15%的co-DEG屬于真核細(xì)胞骨架,，其中大部分屬于肌動蛋白絲,，少數(shù)是中間絲和微管的成分。對co-DEG進(jìn)行GO分析,，生物學(xué)過程富集了“骨骼肌肌球蛋白粗絲組裝”和“快肌纖維收縮的正向調(diào)節(jié)”條目,。細(xì)胞組分中富集的**個條目是“纖維蛋白原復(fù)合物”、“細(xì)胞外空間”,、“細(xì)胞外基質(zhì)”,、“細(xì)胞外區(qū)域”和“蛋白質(zhì)細(xì)胞外基質(zhì)”，這些都是細(xì)胞外成分（圖3B）,。結(jié)果表明,，DON主要影響肌肉成分的組成和功能以及多種細(xì)胞外成分的表達(dá)。通路富集分析富集到了“ECM-受體相互作用”,、“蛋白質(zhì)消化和吸收”,、“人**瘤病毒***”和“粘著斑”等通路。山東蛋白組學(xué)特異細(xì)胞分析蛋白組學(xué)檢測一個樣多少錢,。

運(yùn)用生物技術(shù)：TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué),、PRM蛋白靶向驗(yàn)證由鹿明生物提供技術(shù)支持：2021年12月，上海交通大學(xué)張荻課題組在Frontiers in Plant Science發(fā)表題為 TMT-Based Quantitative Proteomic Analysis Reveals the Physiological Regulatory Networks of Embryo Dehydration Protection in Lotus(Nelumbo nucifera)的研究成果,，通過TMT標(biāo)記蛋白質(zhì)組學(xué)和平行反應(yīng)監(jiān)測蛋白靶向驗(yàn)證(PRM)技術(shù)研究方法,，構(gòu)建了蓮花胚胎脫水保護(hù)的生理調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。為揭示荷花種子長壽的脫水保護(hù)機(jī)制提供了新的見解,。

TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究案例：2021年12月威爾康奈爾醫(yī)學(xué)中心和紀(jì)念斯隆凱特琳**中心的Linda T. Vahdat 和 Vivek Mittal教授課題組在Nature Communications期刊發(fā)表的題為 “Copper depletion modulates mitochondrial oxidative phosphorylation to impair triple negative breast cancer metastasis”的研究成果,，通過蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)研究方法,，發(fā)現(xiàn)了高度轉(zhuǎn)移性 SOX2/OCT4+ 細(xì)胞的離散亞群表現(xiàn)出細(xì)胞內(nèi)銅水平升高特征，探究了TM 介導(dǎo)的復(fù)合物 IV 失活確定為 SOX2/OCT4+ 細(xì)胞群中的主要代謝缺陷,，AMPK/mTORC1 能量傳感器為重要的下游途徑,。描繪了銅-代謝-轉(zhuǎn)移軸，為高風(fēng)險三陰性乳腺*患者的下一代治療方法提供了理論依據(jù),。中文標(biāo)題：銅耗竭調(diào)節(jié)線粒體氧化磷酸化以損害三陰性乳腺*轉(zhuǎn)移研究對象：高風(fēng)險三陰性乳腺*(TNBC)發(fā)表期刊：NatureCommunications影響因子：14.919發(fā)表時間：2021年12月合作單位：紀(jì)念斯隆凱特琳**中心，Sandra和EdwardMeyer**中心運(yùn)用關(guān)鍵生物技術(shù)：TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)和靶向代謝組學(xué)蛋白組學(xué),，研究方法,，高通量定性定量研究,有。

作者運(yùn)用iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)對種子發(fā)育過程中蛋白質(zhì)表達(dá)的定量比較,，同時進(jìn)行GO和KEGG通路富集分析,。結(jié)果表明所有鑒定的蛋白被分為29類，主要涉及翻譯和碳水化合物代謝,。并且作者繪制了p值小于0.01的前20條KEGG通路的氣泡圖,。在三對比較中，普遍富集的途徑包括脂肪酸降解,、苯丙素生物合成和脂肪酸代謝,。其中，參與α-亞麻酸代謝的DAPs在S3 vs. S1組和S4 vs. S1組中都非?；钴S,。為了評估轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組之間的一致性，以及了解轉(zhuǎn)錄后的mRNA在蛋白質(zhì)水平上是如何表現(xiàn)的,，作者進(jìn)行了RNA-seq和iTRAQ分析的聯(lián)合分析,。證明DEGs和DAPs參與類黃酮的生物合成和脂肪酸代謝。蛋白組學(xué)翻譯后修飾篩選,檢測,鑒定,定性,定量,。安徽蛋白組學(xué)技術(shù)

蛋白質(zhì)組學(xué)基本策略 研究基礎(chǔ) 研究內(nèi)容 研究意義背景,。山東蛋白組學(xué)特異細(xì)胞分析

本研究通過生理和蛋白質(zhì)組學(xué)分析在冬油菜中鑒定了大量的冷脅迫響應(yīng)蛋白。探討了冬油菜耐凍性增強(qiáng)的機(jī)理和低溫脅迫對冬油菜形態(tài)和生理生化變化的影響,。文章以耐凍型Longyou 7和冷敏感型Lenox為材料,，通過iTRAQ標(biāo)記蛋白組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析，揭示了谷胱甘肽轉(zhuǎn)移酶活性,、碳水化合物結(jié)合和谷胱甘肽結(jié)合,、代謝過程及IAA反應(yīng)與冷應(yīng)激反應(yīng)密切相關(guān)，鑒定出了Longyou 7和Lenox之間的DAPs,，這些DAPs參與氨基酸,、碳水化合物、脂質(zhì)和能量代謝,，對提高冬油菜的耐凍性發(fā)揮了重要作用,。山東蛋白組學(xué)特異細(xì)胞分析

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