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遼寧空間代謝組學與空間轉錄組

來源: 發(fā)布時間:2023-04-04

空間代謝組學研究作者對P493-6B細胞淋巴瘤系(BCL)進行了全基因組表達譜、核突變和ChIP分析,,發(fā)現(xiàn)MYC誘導增加了包括ACLY,、ACACA、FASN和SCD1及其相關蛋白在內(nèi)的脂肪酸(FA)合成基因的mRNA表達,,在MYC誘導的肝細胞*(HCC),、急性白血病(T-ALL)和腎細胞*(RCC)的三種體內(nèi)轉基因小鼠模型中也有類似表達,。還發(fā)現(xiàn)MYC與這些FA合成基因的啟動子結合并啟動mRNA轉錄,,如甲羥戊酸和膽固醇途徑基因的啟動子。為了了解MYC和SREBP1之間的相互作用,,作者首先,,對這兩種蛋白進行ChIP和re-ChIP分析,證明MYC和SREBP1都可以發(fā)現(xiàn)與FA合成基因啟動子中的相同DNA分子結合(圖1),。SREBP1的敲低也降低了FA合成基因的表達,,但不降低MYC基因的表達。其次,,ChIP的MYC與啟動子結合,,不僅調(diào)節(jié)FA合成基因的表達,還調(diào)節(jié)糖酵解和谷氨酰胺分解基因的表達,。因此,,MYC似乎會依次調(diào)節(jié)參與脂質(zhì)合成的基因:首先誘導葡萄糖和谷氨酰胺,然后誘導FA合成相關基因,。通過RNA測序(RNA-seq)發(fā)現(xiàn),,增加MYC水平會引起糖酵解,、谷氨酰胺分解和FA合成??臻g代謝組三個維度的分析,。遼寧空間代謝組學與空間轉錄組

空間代謝組學:中文標題:MYC*基因與固醇調(diào)節(jié)元件結合蛋白協(xié)同調(diào)節(jié)**生長所必需的脂肪生成研究對象:小鼠發(fā)表期刊:CellMetabolism影響因子:27.287合作單位:斯坦福大學運用生物技術:空間代謝組學、CHIP,、RNA-seq,、NMR和IHC等MYC是一種原*基因,在細胞增殖,、凋亡,、分化等多種細胞生物學過程中發(fā)揮作用,其易位,、擴增或表達異常常與多種**的發(fā)***展有關,。近年來關于MYC在脂質(zhì)代謝中的研究很多,據(jù)了解MYC與脂肪酸合成相關酶密切相關,;致*基因MYC刺激細胞生長需要脂質(zhì)來組裝新的細胞膜,,但是否*由MYC調(diào)節(jié)還是與其他因素協(xié)同調(diào)節(jié)尚不清楚。因此本文主要是揭示MYC誘導的**中脂質(zhì)生成的機制,。重慶空間代謝組學與空間轉錄組歐易生物空間代謝組學適合整體方案,助力科研,,。

以上結果表明,AFADESI-MSI方法可以直接檢測極性代謝產(chǎn)物,,并具有高特異性,,能呈現(xiàn)其在大腦微區(qū)分布的圖像。3.在大鼠腦中繪制微區(qū)代謝網(wǎng)絡圖要了解大腦的結構區(qū)域發(fā)生的復雜代謝過程,,不僅應準確表征代謝物,,還要研究其相關性。從大鼠腦微區(qū)中提取代謝譜進行代謝網(wǎng)絡重建,。從15個微區(qū)提取的MSI數(shù)據(jù)進行峰挑選和峰對齊(圖1F),,包括松果體、中腦導水管,、腦橋,、梨狀皮質(zhì)、延髓,、丘腦,、紋狀體、海馬,、胼胝體,、嗅球、大腦皮層,、小腦皮層,、穹窿,、小腦延髓和丘腦。

空間代謝組學:食道腺*是全球第八大崔常見的惡性**發(fā)病率正在持續(xù)上升,,但存活率仍然很低,,目前急需新的工具來提高早期診斷和精確***。脂質(zhì)代謝紊亂與**的發(fā)***展密切相關,,大多數(shù)脂質(zhì)以甘油磷脂(GPLs)的形式儲存在雙分子膜中,,基于甘油磷脂具有較穩(wěn)定的物理化學性質(zhì),因此將其作為疾病診斷的生物標志物具有重要意義,。質(zhì)譜成像(MSI)可在幾分鐘內(nèi)對冷凍切片組織的**磷脂體量化并進行客觀診斷,。然而,MSI是否能客觀識別原發(fā)性食管腺*目前尚不清楚,,這是一個重大的挑戰(zhàn),,因為該微環(huán)境復雜,組織類型的表型相似,??臻g代謝組學 技術咨詢中心。

空間代謝組學:質(zhì)譜成像技術近二十年來,,隨著質(zhì)譜離子化技術的不斷發(fā)展,,質(zhì)譜成像技術因其能夠直觀、快速,、簡便地呈現(xiàn)出分子在細胞或組織中的結構、空間與時間分布等信息,,越來越受到大家的關注,。并且質(zhì)譜成像技術也被***的用在**疾病研究、藥物前期發(fā)現(xiàn)等各領域的高質(zhì)量文章中,,為生物標志物的高靈敏度探測和藥物代謝精確成像研究奠定了基礎,,下面進入到質(zhì)譜“畫”時代~是什么?有多少,?在哪里,?回答以上“靈魂”3問,首先需要了解他們之間的關系,。質(zhì)譜是通過采集化合物的質(zhì)荷比,,獲得定性和定量的信息,進而去探究物質(zhì)本身包含的化合物“是什么,?”和“有多少,?”這兩個根本性問題?!犊臻g代謝組科研應用手冊》是一本集聚空間代謝組學的由來,、發(fā)展,、原理及應用的科研專業(yè)讀物。貴州空間代謝組學翻譯

質(zhì)譜成像空間代謝組學方法及其應用研究進展,。遼寧空間代謝組學與空間轉錄組

空間代謝組學研究:一區(qū) | IF:14.553多發(fā)性硬化癥的相關空間代謝組學研究,。本文為倫敦帝國理工學院Zoltan Takats教授課題組在ACS central science期刊發(fā)表的題為“Correlated Heterospectral Lipidomics for Biomolecular Profiling of Remyelination in Multiple Sclerosis"的研究成果,通過拉曼+空間代謝組學+IHC研究方法,,發(fā)現(xiàn)了新形成的髓鞘與正常髓鞘具有不同的脂質(zhì)成分,,探究了多發(fā)性硬化中再髓鞘化形成的機理,描繪了用于關聯(lián)生物分子結構和髓鞘成分的分子成像圖譜,,為評估再髓鞘化***提供新策略,。遼寧空間代謝組學與空間轉錄組

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