空間轉(zhuǎn)錄組的應(yīng)用有哪些,？一,、構(gòu)建空間轉(zhuǎn)錄組圖譜：借助于空間分辨的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)，建立圖譜可能是在分子水平上研究生物體結(jié)構(gòu)的重要步驟。目前的多項研究通過單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組技術(shù)結(jié)合空間轉(zhuǎn)錄技術(shù),，得到多個***的時空轉(zhuǎn)錄組圖譜（相關(guān)研究后續(xù)會在如下專輯更新）,。二,、描繪胚胎發(fā)育和空間藍(lán)圖：胚胎發(fā)育是一個復(fù)雜的過程,，其中動態(tài)變化在生物分子水平上迅速發(fā)生。對這種微觀變化的時間和空間方面的分析都具有挑戰(zhàn)性,。預(yù)期使用空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)可以表征胚胎發(fā)育的空間表達(dá)藍(lán)圖,。HE 染色適用于空間轉(zhuǎn)錄組的組織學(xué)呈現(xiàn)方法。江蘇空間轉(zhuǎn)錄組多少錢

歐易生物自引進(jìn)10x Visium空間轉(zhuǎn)錄組以來已經(jīng)完成了上百例樣本測序,，在樣本包埋,、切片、實驗和數(shù)據(jù)分析上積累了大量寶貴的經(jīng)驗,。本次培訓(xùn)班旨在跟廣大科研工作者介紹空間轉(zhuǎn)錄組的研究熱點和方案設(shè)計,，分享歐易生物在樣本處理、實驗和數(shù)據(jù)挖掘上的成功經(jīng)驗,，助力各位科研工作者取得新的突破,。招生對象：A、對空間轉(zhuǎn)錄組感興趣,，期望了解空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)，或近期準(zhǔn)備開展空間轉(zhuǎn)錄組測序項目B,、項目已經(jīng)開展,，需要深入挖掘數(shù)據(jù)的科研工作者。江西歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組做什么空間轉(zhuǎn)錄組組織學(xué)板塊包括樣品的包埋,、切片,、固定、染色及成像,，記錄切片的形態(tài)學(xué)信息,。

10x Genomics 公司提供的 Visium 空間基因表達(dá)解決方案是目前***一個高通量空間轉(zhuǎn)錄組的商業(yè)化解決方案,。該解決方案巧妙的將單細(xì)胞測序技術(shù)原理和組織切片染色結(jié)合在一起，從而研究空間分辨率下整個轉(zhuǎn)錄組 mRNA 的表達(dá)情況,，同時在同一組織切片中獲得組織學(xué)相關(guān)信息,。空間轉(zhuǎn)錄組相關(guān)的顯微解剖技術(shù)通常分為兩類：機(jī)械和光學(xué),。前者包括 Tomo-seq 等,，通過沿感興趣軸，利用冷凍切片機(jī)進(jìn)行組織切片,，然后在每個切片上均進(jìn)行 RNA 測序,。10x 提供的載玻片分為兩種：用于摸索組織比較好透化時間的組織優(yōu)化玻片和用于正式實驗的基因表達(dá)玻片。

10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)的準(zhǔn)確性高嗎,？下圖是一個將10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)應(yīng)用于小鼠海馬體研究的案例,。A圖為腦組織切片的HE染色結(jié)果，從10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果中,，可以清晰看到Tmsb4x（B圖）和Selenow（C圖）在海馬體區(qū)域高表達(dá),，和已知的研究結(jié)果一致性較高。開展10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組需要做哪些準(zhǔn)備,？空間轉(zhuǎn)錄組是一項十分前沿的技術(shù),，涉及到很多細(xì)節(jié)方面的準(zhǔn)備工作，例如組織類型的選擇,、前期預(yù)實驗的設(shè)計,、病理區(qū)域的確認(rèn)等一系列內(nèi)容。而且實驗中存在很多不確定性因素,，處理不慎容易導(dǎo)致整個項目失敗,。通過培訓(xùn)系統(tǒng)掌握空間轉(zhuǎn)錄組測序原理和方案設(shè)計思路，助力科學(xué)研究,。

1. 空間轉(zhuǎn)錄組實驗步驟A,。切片制備和優(yōu)化：取新鮮組織、冷凍,、切片,，并進(jìn)行HE染色成像，優(yōu)化確定切片是否覆蓋靶向區(qū)域,?？臻g轉(zhuǎn)錄組實驗步驟B。切片固定和透化：將組織切片放置在含有與RNA結(jié)合捕獲探針的載玻片上,，并進(jìn)行固定和透化,，使細(xì)胞中的 mRNA 得到釋放，并結(jié)合到相應(yīng)的捕獲探針上,，從而獲取基因表達(dá)信息,?？臻g轉(zhuǎn)錄組實驗步驟c。逆轉(zhuǎn)和文庫構(gòu)建：以捕獲的 RNA 為模板,，進(jìn)行 cDNA 合成,，和測序文庫制備?？臻g轉(zhuǎn)錄組實驗步驟d,。高通量上機(jī)測序：對制備好的測序文庫，進(jìn)行二代高通量短讀長測序,?？臻g轉(zhuǎn)錄組實驗步驟e。數(shù)據(jù)可視化分析：結(jié)合HE結(jié)果,，確定哪些基因有表達(dá),，表達(dá)量高低，以及這些基因的空間位置信息,?？臻g轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果為未來人類心臟發(fā)育的研究提供重要的借鑒意義。海南空間轉(zhuǎn)錄組價格

10X Visium空間轉(zhuǎn)錄組的實驗主要分為兩部分：組織學(xué)板塊和組學(xué)板塊,。江蘇空間轉(zhuǎn)錄組多少錢

10x  Genomics空間轉(zhuǎn)錄組用于文庫構(gòu)建的每張載玻片上有四個捕獲區(qū)域,，每個捕獲區(qū)域的大小為6.5x6.5mm，包含5000個被條形碼標(biāo)記的點（barcoded spots）,，每個點的直徑為55 μm,，點和點之間中心的距離為100 μm，并且每個點都有一個barcode序列,。組織切片的細(xì)胞中會釋放出mRNA,，遷移到每個spot的mRNA會被標(biāo)記上相應(yīng)的barcode序列，然后進(jìn)行文庫構(gòu)建并進(jìn)行測序,。根據(jù)數(shù)據(jù)的條形碼信息對數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,，以確定哪些數(shù)據(jù)來自哪個位置，從而實現(xiàn)空間基因表達(dá)的可視化,。歐易生物具有上百例空間轉(zhuǎn)錄組項目執(zhí)行經(jīng)驗,，致力通過高效的服務(wù)，助力各位科研工作者取得新的突破,。江蘇空間轉(zhuǎn)錄組多少錢

上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司坐落在聯(lián)航路1188號25幢,，是一家專業(yè)的檢驗檢測服務(wù)。（依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項目,，經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營活動,，具體經(jīng)營項目以相關(guān)部門批準(zhǔn)文件或許可證件為準(zhǔn)）一般項目：生物醫(yī)藥產(chǎn)品,、生化產(chǎn)品的研發(fā),，醫(yī)藥中間體,、化工原料及產(chǎn)品（除危險品化學(xué)品、監(jiān)控化學(xué)品,、易制毒化學(xué)品）的研發(fā),、銷售，儀器儀表的銷售,，并提供相關(guān)技術(shù)咨詢,、技術(shù)服務(wù)，會務(wù)服務(wù),，企業(yè)管理咨詢,。公司。目前我公司在職員工以90后為主,，是一個有活力有能力有創(chuàng)新精神的團(tuán)隊,。公司業(yè)務(wù)范圍主要包括：科研服務(wù)，科研檢測,，學(xué)術(shù)研究,，技術(shù)咨詢等。公司奉行顧客至上,、質(zhì)量為本的經(jīng)營宗旨,，深受客戶好評。公司憑著雄厚的技術(shù)力量,、飽滿的工作態(tài)度,、扎實的工作作風(fēng)、良好的職業(yè)道德,，樹立了良好的科研服務(wù),，科研檢測，學(xué)術(shù)研究,，技術(shù)咨詢形象,，贏得了社會各界的信任和認(rèn)可。