單細(xì)胞測(cè)序是指針對(duì)單個(gè)細(xì)胞進(jìn)行全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析,,可精確地描述每一個(gè)細(xì)胞的狀態(tài),在異質(zhì)性發(fā)育過程中具有特殊的應(yīng)用價(jià)值,。然而,,單細(xì)胞測(cè)序無法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細(xì)胞空間排布信息,對(duì)于揭示發(fā)育過程,、病理微環(huán)境都存在很大的局限性,??臻g轉(zhuǎn)錄組測(cè)序以點(diǎn)陣形式記錄病理切片細(xì)胞的空間信息并進(jìn)行測(cè)序,,可以精確指示點(diǎn)陣內(nèi)的全部基因表達(dá)情況??臻g轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的加入,,無疑讓單細(xì)胞測(cè)序如虎添翼,更精確地勾勒了組織水平的異質(zhì)性,。截至2021年10月,,烈冰助力發(fā)表單細(xì)胞測(cè)序文章近20篇。長沙高通量測(cè)序單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)機(jī)構(gòu)
高通量測(cè)序技術(shù)(High-throughput sequencing)又稱“下一代”測(cè)序技術(shù)(“Next-generation” sequencing),,以能一次并行對(duì)幾十萬到幾百萬條DNA分子進(jìn)行序列測(cè)定和一般讀長較短等為標(biāo)志,。高通量測(cè)序技術(shù)是對(duì)傳統(tǒng)測(cè)序一次顛覆性的改變,一次對(duì)幾十萬到幾百萬條DNA分子進(jìn)行序列測(cè)定,,因此在有些文獻(xiàn)中稱其為下一代測(cè)序技術(shù)(next generation sequencing)足見其劃時(shí)代的改變,,同時(shí)高通量測(cè)序使得對(duì)一個(gè)物種的轉(zhuǎn)錄組和基因組進(jìn)行細(xì)致全貌的 分析成為可能,所以又被稱為深度測(cè)序(deep sequencing),。而烈冰科技具有專業(yè)生物背景和十二年科研服務(wù)經(jīng)驗(yàn),,已助力Nature,immunity等在內(nèi)的300+篇CNS文章發(fā)表,。吉林10X Genomics單細(xì)胞測(cè)序商業(yè)化服務(wù)單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的迅速發(fā)展和應(yīng)用推廣,,為從多維度揭示疾病發(fā)展提供了強(qiáng)有力的工具,。
樣本制備后的保存 為了盡可能地減少轉(zhuǎn)錄組的變化,在對(duì)細(xì)胞進(jìn)行清洗和計(jì)數(shù)后,,單細(xì)胞懸液應(yīng)當(dāng)保存于冰上,,直至用于后續(xù)的上機(jī)和文庫制備步驟。在理想狀況下,,一旦制備好樣本,,應(yīng)當(dāng)在3min鐘內(nèi)將其用于下游步驟。然而,,您還有必要了解各類細(xì)胞的不同性質(zhì),,因?yàn)檫@可能會(huì)影響細(xì)胞應(yīng)在冰上保存的時(shí)間,以及它們?cè)谥苽浜蠖嗑帽銘?yīng)當(dāng)被盡快使用,。例如,,有些細(xì)胞(如PBMC)如果在冰上放置一段時(shí)間,它們就開始形成團(tuán)塊,。這些團(tuán)塊很難解離,,增加了堵塞的風(fēng)險(xiǎn),而且每個(gè)團(tuán)塊被當(dāng)成單細(xì)胞計(jì)數(shù),,又降低了細(xì)胞計(jì)數(shù)的準(zhǔn)確性,。此外,有些細(xì)胞更加粘稠,,形成團(tuán)塊的速度更快,。對(duì)于這些細(xì)胞,必須盡量減少制備和使用之間的時(shí)間差,。
一味的追求高細(xì)胞數(shù)量的捕獲,,小心得不償失,原因在這:單細(xì)胞測(cè)序所有的分析都是基于細(xì)胞聚類進(jìn)行,,而細(xì)胞聚類是在區(qū)分cell和non-cell后,,獲得細(xì)胞基因表達(dá)譜,通過降維(pca),,無監(jiān)督聚類以及可視化(t-SNE)得到的,。進(jìn)行細(xì)胞聚類時(shí)需要考慮到每個(gè)細(xì)胞的基因表達(dá)模式,因此即使是相同的數(shù)據(jù),,在剔除幾個(gè)細(xì)胞的情況下,,前后獲得的聚類圖也會(huì)出現(xiàn)明顯不同。而當(dāng)細(xì)胞捕獲數(shù)過多時(shí),,無論是假陰性和假陽性數(shù)據(jù)還是多細(xì)胞數(shù)據(jù),,都會(huì)對(duì)正常細(xì)胞聚類產(chǎn)生影響,造成聚類結(jié)果失真,。這也是很多文章,,特別是很多高分文章,,為什么單個(gè)樣本捕獲細(xì)胞數(shù)在2000-3000的原因了。烈冰建議單個(gè)樣本捕獲細(xì)胞數(shù)在3000-5000個(gè)時(shí),,數(shù)據(jù)量在100G左右時(shí),,可以滿足分析和文章發(fā)表的多重需求。烈冰單細(xì)胞測(cè)序,,助力您的深入科學(xué)探究,。
單細(xì)胞多組學(xué)帶來的突破 單細(xì)胞測(cè)序方法不但改進(jìn)了實(shí)驗(yàn)過程,還幫助科學(xué)家在健康和疾病研究的關(guān)鍵領(lǐng)域取得新進(jìn)展,。那些過去從轉(zhuǎn)錄平均值或單項(xiàng)參數(shù)讀取中無法獲得的新發(fā)現(xiàn)正在改變我們對(duì)傳染病,、神經(jīng)退行性疾病等疾病的認(rèn)識(shí)。從鑒定新的細(xì)胞類型和狀態(tài),,到揭開疾病用藥應(yīng)答和耐藥的潛在機(jī)制,,單細(xì)胞測(cè)序正在推動(dòng)突破性的研究,有望改變生物學(xué)和醫(yī)療,。無論是無法解釋的疾病,,還是人體或自然界中尚未探索的系統(tǒng),曾經(jīng)模糊的東西正變得越來越清晰,。隨著我們邁向科學(xué)的未來,,我們手頭的工具就像伽利略的望遠(yuǎn)鏡一樣能夠提高焦距和放大倍數(shù),而定義科學(xué)未來的知識(shí)新深度是十年前的人們所無法想象的,。烈冰測(cè)序服務(wù)已助力300余篇國際期刊研究文章發(fā)表,。蘇州10X單細(xì)胞測(cè)序多組學(xué)測(cè)序
烈冰單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序助您探究細(xì)胞類型特異性和基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)特征。長沙高通量測(cè)序單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)機(jī)構(gòu)
烈冰科技于2010年誕生之初便立足于高通量測(cè)序行業(yè),,為科研學(xué)者提供專注的測(cè)序數(shù)據(jù)分析服務(wù),,先后經(jīng)歷基因芯片時(shí)代,、基因測(cè)序,、轉(zhuǎn)錄組測(cè)序時(shí)代...在科技日新月異的洪流中始終獨(dú)占鰲頭。2018年以來,,單細(xì)胞測(cè)序進(jìn)入發(fā)展的快車道,,烈冰作為國內(nèi)首批引進(jìn)單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)雙平臺(tái)的公司,依托自主研發(fā)的NovelBrain?生物大數(shù)據(jù)分析平臺(tái),,為用戶提供一站式全流程的單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)和解決方案,。4年的單細(xì)胞技術(shù)的積累,烈冰已具備大鼠,、小鼠,、斑馬魚、猴,、裸鼴鼠,、水稻,、擬南芥等10+物種,皮膚,、腦,、脂肪、心臟,、花序等50+組織類型,,100+細(xì)胞類型,1000+靶標(biāo)基因,,10000+樣本處理經(jīng)驗(yàn),。長沙高通量測(cè)序單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)機(jī)構(gòu)
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司擁有生物科技、醫(yī)藥科技,、信息科技,、計(jì)算機(jī)科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)服務(wù),、技術(shù)轉(zhuǎn)讓,、技術(shù)咨詢,市場(chǎng)營銷策劃,,市場(chǎng)信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會(huì)調(diào)查,、社會(huì)調(diào)研、民意調(diào)查,、民意測(cè)驗(yàn)),,從事貨物及技術(shù)的進(jìn)出口業(yè)務(wù),計(jì)算機(jī),、軟件及耗材(除??兀浖_發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,,經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營活動(dòng)】等多項(xiàng)業(yè)務(wù),,主營業(yè)務(wù)涵蓋單細(xì)胞測(cè)序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),,空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序。目前我公司在職員工以90后為主,,是一個(gè)有活力有能力有創(chuàng)新精神的團(tuán)隊(duì),。上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司主營業(yè)務(wù)涵蓋單細(xì)胞測(cè)序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),,空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序,堅(jiān)持“質(zhì)量保證,、良好服務(wù),、顧客滿意”的質(zhì)量方針,,贏得廣大客戶的支持和信賴。公司深耕單細(xì)胞測(cè)序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),,空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序,,正積蓄著更大的能量,,向更廣闊的空間、更寬泛的領(lǐng)域拓展,。