烈冰生信團(tuán)隊(duì)傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺(tái)，針對(duì)龐大的單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù),，能夠?qū)崿F(xiàn)細(xì)胞類型鑒定的快,、精、準(zhǔn)：一鍵導(dǎo)入gene list構(gòu)建個(gè)性化基因列表,；輕松一點(diǎn)即可展示Marker基因的Feature plot,；任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細(xì)胞類型；一鍵獲得t-SNE圖,、Heatmap和Violin圖：輕松獲得并下載基因表達(dá)的t-SNE圖,、Heatmap、Violin圖,，還可以通過(guò)調(diào)節(jié)寬,、高和系數(shù)比例來(lái)調(diào)節(jié)美觀,。平臺(tái)上線300+task自主分析工具、50+pipeline工作流模板,，幫助烈冰生信分析團(tuán)隊(duì)和自主分析用戶實(shí)現(xiàn)分析工具和模板的快速調(diào)用和一站式全流程自動(dòng)化分析,，節(jié)省工作時(shí)間并提升整體工作效率。高通量測(cè)序技術(shù)是對(duì)傳統(tǒng)測(cè)序一次顛覆性的改變,，一次對(duì)幾十萬(wàn)到幾百萬(wàn)條核酸序列進(jìn)行測(cè)定,。湖州單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析培訓(xùn)班

高通量測(cè)序技術(shù)（High-throughput sequencing）又稱“下一代”測(cè)序技術(shù)（“Next-generation” sequencing），以能一次并行對(duì)幾十萬(wàn)到幾百萬(wàn)條DNA分子進(jìn)行序列測(cè)定和一般讀長(zhǎng)較短等為標(biāo)志,。高通量測(cè)序技術(shù)是對(duì)傳統(tǒng)測(cè)序一次顛覆性的改變,，一次對(duì)幾十萬(wàn)到幾百萬(wàn)條DNA分子進(jìn)行序列測(cè)定，因此在有些文獻(xiàn)中稱其為下一代測(cè)序技術(shù)(next generation sequencing)足見其劃時(shí)代的改變,，同時(shí)高通量測(cè)序使得對(duì)一個(gè)物種的轉(zhuǎn)錄組和基因組進(jìn)行細(xì)致全貌的 分析成為可能,，所以又被稱為深度測(cè)序(deep sequencing)。而烈冰科技具有專業(yè)生物背景和十二年科研服務(wù)經(jīng)驗(yàn),，已助力Nature,，immunity等在內(nèi)的300+篇CNS文章發(fā)表。長(zhǎng)沙10X Chromium X單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)支持烈冰斥巨資引進(jìn)Novaseq6000,，開啟更大通量測(cè)序新紀(jì)元,。

作為單細(xì)胞測(cè)序的一個(gè)重要里程碑，10x genomic公司于2016年2月推出10x Chromium Single Cell Gene Expression Solution,，此平臺(tái)整合了儀器,、試劑盒和信息學(xué)軟件，能精確對(duì)接illumina測(cè)序儀,，因此可實(shí)現(xiàn)大量大細(xì)胞的快速高效標(biāo)記,、測(cè)序和分析，獲得單細(xì)胞水平的基因表達(dá)譜和差異情況,，并通過(guò)對(duì)復(fù)雜細(xì)胞群體進(jìn)行深入細(xì)致分析,，繪制大規(guī)模單細(xì)胞表達(dá)圖譜。 以量化細(xì)胞內(nèi)的群體異質(zhì)性,，并逐個(gè)鑒定細(xì)胞類型,、細(xì)胞狀態(tài)和動(dòng)態(tài)細(xì)胞躍遷。除了有望鑒定新的細(xì)胞亞型和稀有細(xì)胞群體,，單細(xì)胞技術(shù)還能更好地了解轉(zhuǎn)錄動(dòng)態(tài)和基因調(diào)控關(guān)系,。

10X Genomics 是一種基于 drop 的微流控技術(shù)，液體在配套芯片中的微管道中流動(dòng),，因此細(xì)胞直徑會(huì)受到芯片中微管道直徑的限制,，微流體通道的直徑約為 50 ~ 60 um,，因此捕獲細(xì)胞的直徑不能超過(guò) 40um,。當(dāng)細(xì)胞直徑過(guò)大時(shí),，容易出現(xiàn)管道堵塞，造成GEM生成失敗,，對(duì)于神經(jīng)科學(xué)研究和心血管疾病研究的老師而言,，準(zhǔn)備采用單細(xì)胞技術(shù)用于課題研究的時(shí)候，往往會(huì)遇到一個(gè)尷尬的問(wèn)題,，就是目標(biāo)細(xì)胞,，例如神經(jīng)元細(xì)胞、成熟心肌細(xì)胞由于體積過(guò)大,，不適用于 10X 單細(xì)胞技術(shù),。其中神經(jīng)元細(xì)胞的直徑很大，直接超過(guò)了芯片中管道的直徑,，雖然心肌細(xì)胞直徑低于 50um,，但是成熟心肌細(xì)胞的長(zhǎng)度很長(zhǎng)，有可能堵塞通道造成實(shí)驗(yàn)失敗,，這也是為什么現(xiàn)在很多已發(fā)表的心臟單細(xì)胞文章,，主要研究方向是心臟發(fā)育的原因了，主要還是因?yàn)槲窗l(fā)育成熟的心肌細(xì)胞比較小,，不會(huì)出現(xiàn)堵塞管道的風(fēng)險(xiǎn),。因此可以考慮組織解離后過(guò) 40um 濾網(wǎng)，過(guò)濾掉大細(xì)胞,，避免出現(xiàn)管道堵塞,、實(shí)驗(yàn)失敗的風(fēng)險(xiǎn)。此種方案的缺點(diǎn)是大細(xì)胞被過(guò)濾掉,，丟失相關(guān)細(xì)胞數(shù)據(jù),；另外組織解離獲得高質(zhì)量細(xì)胞懸液以后，繼續(xù)做細(xì)胞裂解抽細(xì)胞核,，開展細(xì)胞核測(cè)序,。具體可訪問(wèn)烈冰官網(wǎng)給我們留言，烈小冰將安排專業(yè)技術(shù)為您詳細(xì)解答,。單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái),，烈冰提供高性價(jià)比服務(wù)方案。

RNA測(cè)序（RNA-seq）或芯片分析等大量樣本的轉(zhuǎn)錄組學(xué)方法作為一類強(qiáng)大的工具,，可提供混合樣本的基因表達(dá)平均數(shù)據(jù),，幫助科學(xué)家開始揭示這種異質(zhì)性。隨后,，技術(shù)創(chuàng)新的飛躍在單細(xì)胞技術(shù)上達(dá)到新高度——使得科學(xué)家能夠定義細(xì)胞類型特異的基因表達(dá),，從過(guò)去的平均數(shù)據(jù)中分辨出真正驅(qū)動(dòng)其表達(dá)模式的細(xì)胞異質(zhì)性。這讓研究人員能夠更詳細(xì)地表征組織異質(zhì)性，鑒定稀有細(xì)胞類型,，并逐個(gè)細(xì)胞地仔細(xì)分析其分子機(jī)制,。當(dāng)獲得了對(duì)其研究的生物系統(tǒng)更為真實(shí)的圖譜后，研究人員就有了更為堅(jiān)實(shí)可靠的知識(shí)基礎(chǔ),，并能在這個(gè)基礎(chǔ)上規(guī)劃下一步實(shí)驗(yàn),，以獲取更深入的可行動(dòng)見解。烈冰科技成立10余年,，為科研學(xué)者提供專注的測(cè)序數(shù)據(jù)分析服務(wù),。烈冰科技單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析可視化

烈冰生物為您提供多平臺(tái)一站式全流程單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)。湖州單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析培訓(xùn)班

針對(duì)單細(xì)胞測(cè)序的細(xì)胞數(shù)量判斷環(huán)節(jié)：主要是對(duì)細(xì)胞數(shù)量,、基因表達(dá)量,、測(cè)序質(zhì)量進(jìn)行整體描述。過(guò)濾標(biāo)準(zhǔn)：由于細(xì)胞破碎后游離RNA會(huì)釋放到環(huán)境或孔中,，并且測(cè)序中也會(huì)存在一些死細(xì)胞,，導(dǎo)致數(shù)據(jù)存在background值。因此,，我們需要設(shè)定一定的標(biāo)準(zhǔn)來(lái)過(guò)濾掉假細(xì)胞或死細(xì)胞,。以10× Genomics為例，細(xì)胞數(shù)量判斷主要通過(guò)分析UMI Counts-Barcode曲線斜率拐點(diǎn),，當(dāng)存在多個(gè)斜率拐點(diǎn)的時(shí)候,，結(jié)合預(yù)期UMI=500時(shí)的細(xì)胞數(shù)量進(jìn)行過(guò)濾。當(dāng)斜率拐點(diǎn)低于UMI=500的時(shí)候,，選擇UMI=500作為細(xì)胞的判斷的標(biāo)準(zhǔn),；否則，選擇和預(yù)期細(xì)胞數(shù)量接近的拐點(diǎn)作為細(xì)胞判斷的位置,。這樣我們能夠有效獲得真實(shí)的并且在基因數(shù)量上可以分析的數(shù)據(jù),。湖州單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析培訓(xùn)班

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司發(fā)展規(guī)模團(tuán)隊(duì)不斷壯大，現(xiàn)有一支專業(yè)技術(shù)團(tuán)隊(duì),，各種專業(yè)設(shè)備齊全,。NovelBio,烈冰生物,NovelBrain,PanoCell,烈冰智造是上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司的主營(yíng)品牌，是專業(yè)的生物科技,、醫(yī)藥科技,、信息科技、計(jì)算機(jī)科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā),、技術(shù)服務(wù),、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢,，市場(chǎng)營(yíng)銷策劃,，市場(chǎng)信息咨詢與調(diào)查（不得從事社會(huì)調(diào)查,、社會(huì)調(diào)研、民意調(diào)查,、民意測(cè)驗(yàn)）,，從事貨物及技術(shù)的進(jìn)出口業(yè)務(wù)，計(jì)算機(jī),、軟件及耗材（除?？兀?，軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,，經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營(yíng)活動(dòng)】公司，擁有自己**的技術(shù)體系,。公司不僅*提供專業(yè)的生物科技,、醫(yī)藥科技、信息科技,、計(jì)算機(jī)科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā),、技術(shù)服務(wù)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓,、技術(shù)咨詢,，市場(chǎng)營(yíng)銷策劃，市場(chǎng)信息咨詢與調(diào)查（不得從事社會(huì)調(diào)查,、社會(huì)調(diào)研,、民意調(diào)查、民意測(cè)驗(yàn)）,，從事貨物及技術(shù)的進(jìn)出口業(yè)務(wù),，計(jì)算機(jī)、軟件及耗材（除?？兀?，軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目，經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營(yíng)活動(dòng)】,，同時(shí)還建立了完善的售后服務(wù)體系,，為客戶提供良好的產(chǎn)品和服務(wù)。上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司主營(yíng)業(yè)務(wù)涵蓋單細(xì)胞測(cè)序,，生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),，空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序,，堅(jiān)持“質(zhì)量保證,、良好服務(wù)、顧客滿意”的質(zhì)量方針,，贏得廣大客戶的支持和信賴,。