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單細(xì)胞測(cè)序多組學(xué)測(cè)序

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-06-20

單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是在單細(xì)胞水平上高通量測(cè)序分析基因表達(dá)譜的技術(shù),,突破傳統(tǒng)高通量測(cè)序的局限性,,組織解離后,單個(gè)樣本一次上機(jī)能捕獲500-20000個(gè)細(xì)胞,, 基于每個(gè)細(xì)胞分別建庫(kù)測(cè)序,,獲得單個(gè)細(xì)胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)狀態(tài),并鑒定細(xì)胞的類型,,可以在不同樣本間從細(xì)胞類型的組成和豐度角度進(jìn)行比較,,反映細(xì)胞間的異質(zhì)性。而2021年橫空出世的10X Genomics Chromium X平臺(tái)實(shí)現(xiàn)了單塊chip上的百萬級(jí)別通量的細(xì)胞捕獲,,系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)16個(gè)通道同時(shí)運(yùn)行,,每個(gè)通道可捕獲2000-20000個(gè)細(xì)胞(不混樣),并支持原Chromium Controller體統(tǒng)外的多種細(xì)胞捕獲百萬級(jí)別通量實(shí)驗(yàn),,可準(zhǔn)確鑒別稀有細(xì)胞類型和適配大規(guī)模單細(xì)胞研究,。單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái),烈冰提供高性價(jià)比服務(wù)方案,。單細(xì)胞測(cè)序多組學(xué)測(cè)序

10X Genomics和Drop-Seq具有類似的技術(shù)原理,。從橫向孔道中逐一輸入凝膠微珠,一列縱向孔道輸入細(xì)胞,,凝膠微珠與細(xì)胞碰撞后會(huì)吸附在凝膠微珠上,,并通過微流控技術(shù),將之輸入到第二縱向孔道,,即油相孔道中,。這時(shí)候,就形成了一個(gè)個(gè)油滴并輸出并收集在EP管中,。每一個(gè)油滴中會(huì)落入一個(gè)細(xì)胞以及一個(gè)凝膠微珠,,那么在每一個(gè)凝膠微珠中上長(zhǎng)滿了不同的Cell Barcode和UMI Barcode連接形成的序列,,再加上一端PolyT的抓手,構(gòu)成我們的捕獲凝膠微珠,。而這個(gè)凝膠微珠抓手就會(huì)使用oligo dT抓住mRNA構(gòu)建文庫(kù),。福州單細(xì)胞測(cè)序附加流式分選細(xì)胞表面Marker,對(duì)于較低分辨率的標(biāo)志物也能有效鑒定,,助力高要求測(cè)序項(xiàng)目,。

烈冰科技作為國(guó)內(nèi)率先同時(shí)擁有10X Genomics和BD Rhapsody雙分選平臺(tái)的測(cè)序服務(wù)商及云計(jì)算服務(wù)供應(yīng)商,經(jīng)過多年實(shí)戰(zhàn),,擁有豐富的單細(xì)胞懸液制備和分選經(jīng)驗(yàn),,實(shí)測(cè)BD Rhapsody對(duì)能夠高效捕獲粒細(xì)胞。針對(duì)不同的分選平臺(tái),、建庫(kù)方法,,實(shí)戰(zhàn)總結(jié)搭建出不同的數(shù)據(jù)預(yù)處理工作流程;烈冰科技NovelBrain?生物大數(shù)據(jù)平臺(tái)能有效支撐生命科學(xué)研究,、醫(yī)療健康等領(lǐng)域?qū)Υ髷?shù)據(jù)分析的需求,。高通量測(cè)序?qū)嶒?yàn)平臺(tái),包括NovaSeq 6000,、10X Chromium X,、BD FACSMelody、PANNORAMIC數(shù)字切片掃描儀等,,配合一支來自海內(nèi)外名校,、多學(xué)科交叉型的高素質(zhì)綜合團(tuán)隊(duì),為您的科學(xué)研究保駕護(hù)航,。

Single Cell Sequencing技術(shù),,即利用優(yōu)化后的高通量測(cè)序技術(shù)(NGS,Next Generation Sequencing)分析每一個(gè)單個(gè)細(xì)胞的序列信息,,從而更高分辨率地揭示細(xì)胞間的細(xì)胞差異以及其在微環(huán)境中的功能情況,。那么問題來了,如何獲得單個(gè)細(xì)胞,?如果無法獲得單個(gè)細(xì)胞這一切都是不成立的,;如何獲得大批量的單個(gè)細(xì)胞?單個(gè)組織細(xì)胞群體通常在百萬級(jí)別以上,,如果被檢測(cè)的測(cè)序細(xì)胞數(shù)量過小精確度不足,;如何低成本地獲得大批量單個(gè)細(xì)胞?單細(xì)胞測(cè)序成本非常高,,尤其是需要測(cè)2000~3000個(gè)以上的細(xì)胞的時(shí)候,如果單個(gè)細(xì)胞的分選成本也很高,,技術(shù)根本無法普及,。所以,,正因?yàn)檫@些問題的存在使得高通量測(cè)序在單個(gè)細(xì)胞測(cè)序應(yīng)用中的普及度一直不足,直到幾個(gè)突破性技術(shù)的誕生,。烈冰開展了單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組,、單細(xì)胞多組學(xué)以及空間轉(zhuǎn)錄組等多種產(chǎn)品在內(nèi)的全套科研解決方案。

從單細(xì)胞測(cè)序描述性分析轉(zhuǎn)向復(fù)雜樣本中不同細(xì)胞類型的功能解析,,越來越需要一種多組學(xué)的細(xì)胞生物學(xué)視角,。通過單細(xì)胞多組學(xué)——即對(duì)不同組學(xué)的數(shù)據(jù)集進(jìn)行分析和整合——科學(xué)家能夠從同一個(gè)單細(xì)胞來源中檢測(cè)多種細(xì)胞特征。這些特征包括全轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá),、細(xì)胞表面蛋白表達(dá),、免疫組庫(kù)序列(包括T細(xì)胞和B細(xì)胞受體)以及用于了解表觀基因組調(diào)控的開放染色質(zhì)區(qū)域。隨著單個(gè)實(shí)驗(yàn)可提供更多信息豐富的數(shù)據(jù),,研究人員的獲益更多,,包括保留珍貴樣本、提高生產(chǎn)力,、減少因批次效應(yīng)引起的錯(cuò)誤,,并節(jié)省更多的高科技資源(從資助基金到人員時(shí)間)。烈冰專精單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序領(lǐng)域,。吉林高通量測(cè)序單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析可視化

烈冰一站式單細(xì)胞測(cè)序服務(wù):立足科學(xué)研究,,解碼生命本質(zhì)。單細(xì)胞測(cè)序多組學(xué)測(cè)序

10× Genomics官方建議,,當(dāng)單細(xì)胞懸液活性低于70%時(shí)應(yīng)做去除死細(xì)胞操作,,并推薦使用MACS? Dead Cell Removal Kit(Miltenyi Biotec)。需要注意到,,去除死細(xì)胞的操作會(huì)損失一定的細(xì)胞數(shù)量,,10× Genomics和Miltenyi Biotec都沒有給出單細(xì)胞懸液含有多少細(xì)胞數(shù)量才建議做去除死細(xì)胞的操作?;诹冶嗄陠渭?xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)經(jīng)驗(yàn),,建議當(dāng)細(xì)胞懸液進(jìn)行質(zhì)量和活性檢測(cè)后,考慮對(duì)細(xì)胞活性在50%-70%的懸液進(jìn)行去除死細(xì)胞的操作,。而太低活性的懸液(小于30%),,懸液中細(xì)胞大量死亡,可能已經(jīng)丟失了原組織內(nèi)的細(xì)胞比例和狀態(tài),,失真嚴(yán)重,,建議重新收集樣本進(jìn)行新的實(shí)驗(yàn),保證數(shù)據(jù)的高質(zhì)量和實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性,。單細(xì)胞測(cè)序多組學(xué)測(cè)序

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司發(fā)展規(guī)模團(tuán)隊(duì)不斷壯大,,現(xiàn)有一支專業(yè)技術(shù)團(tuán)隊(duì),各種專業(yè)設(shè)備齊全,。在烈冰生物近多年發(fā)展歷史,,公司旗下現(xiàn)有品牌NovelBio,烈冰生物,NovelBrain,PanoCell,烈冰智造等,。公司不僅*提供專業(yè)的生物科技、醫(yī)藥科技,、信息科技,、計(jì)算機(jī)科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)服務(wù),、技術(shù)轉(zhuǎn)讓,、技術(shù)咨詢,市場(chǎng)營(yíng)銷策劃,,市場(chǎng)信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會(huì)調(diào)查,、社會(huì)調(diào)研、民意調(diào)查,、民意測(cè)驗(yàn)),,從事貨物及技術(shù)的進(jìn)出口業(yè)務(wù),計(jì)算機(jī),、軟件及耗材(除??兀浖_發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,,經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營(yíng)活動(dòng)】,,同時(shí)還建立了完善的售后服務(wù)體系,為客戶提供良好的產(chǎn)品和服務(wù),。誠(chéng)實(shí),、守信是對(duì)企業(yè)的經(jīng)營(yíng)要求,也是我們做人的基本準(zhǔn)則,。公司致力于打造***的單細(xì)胞測(cè)序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序,。