基因和基因產(chǎn)物并不是單獨運作的,而是參與了相互關(guān)聯(lián)的復雜通路,、網(wǎng)絡和分子系統(tǒng),,這些合在一起實現(xiàn)了細胞、組織和生物體的運作,。定義這些系統(tǒng)并確定它們的特征和相互作用,,對于了解生物系統(tǒng)如何運作至關(guān)重要?!睘榱送苿涌茖W發(fā)現(xiàn),科學家們需要各種能夠幫助多方位了解其樣本的潛在生物復雜性的研究工具,。對于越來越多的研究人員來說,,單細胞RNA測序和單細胞多組學——即在單細胞分辨率下對基因表達及其他基于DNA、RNA或蛋白質(zhì)的分析物進行定量分析的基因組方法——在幫助解決他們面臨的生物學問題上已證實是行之有效的,。單細胞測序是高通量測序下的又一重大技術(shù)突破,。高通量測序單細胞測序數(shù)據(jù)分析可視化
針對單細胞測序數(shù)據(jù)分析時的reads數(shù)、基因表達量及細胞數(shù)量判定過程中:以捕獲5000個細胞,、100G的測序量為標準,,每個細胞的reads數(shù)大約在50k左右,;每個細胞的基因中位數(shù)取決于樣本的細胞類型,例如成熟的B,,T,,粒細胞數(shù)量較多的組織中,由于該類型細胞表達的基因數(shù)普遍較少,,導致基因中位數(shù)下降,。而某些疾病組織、或者體外培養(yǎng)的如干細胞等,,他們的基因表達數(shù)較高,,甚至可以超過1W,這就導致該類樣本基因中位數(shù)非常高,。因此,,我們對細胞數(shù)量以及基因中位數(shù)確認時,需要考察實際組織的細胞組成,。10X Genomics單細胞測序服務公司烈冰斥巨資引進Novaseq6000,,開啟更大通量測序新紀元。
基于10X Geomics 動態(tài)微流控技術(shù),,利用Tn5轉(zhuǎn)座酶酶切開放染色質(zhì),,形成短片段,單細胞ATAC測序在表觀基因組學水平上,,揭示單細胞染色質(zhì)的可及性問題,,區(qū)分細胞異質(zhì)性,獲得開放染色質(zhì)的位置,、轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合位點,、核小體的調(diào)控區(qū)域和染色質(zhì)狀態(tài)等信息,是單細胞表觀遺傳學的重要突破:分析每個細胞數(shù)千個獨特的染色質(zhì)開放區(qū)域,,識別細胞類型和細胞狀態(tài),;識別重要的轉(zhuǎn)錄因子,進行譜系和發(fā)育追蹤,;探究驅(qū)動細胞類型和狀態(tài)之間基因表達差異的非編碼序列,;探究細胞類型特異性和基因調(diào)控網(wǎng)絡特征等。是當前重要的多組學研究基因表達和表觀遺傳學的手段,。
烈冰科技作為國內(nèi)率先同時擁有10X Genomics和BD Rhapsody雙分選平臺的測序服務商及云計算服務供應商,,經(jīng)過多年實戰(zhàn),擁有豐富的單細胞懸液制備和分選經(jīng)驗,,實測BD Rhapsody對能夠高效捕獲粒細胞,。針對不同的分選平臺、建庫方法,實戰(zhàn)總結(jié)搭建出不同的數(shù)據(jù)預處理工作流程,;烈冰科技NovelBrain?生物大數(shù)據(jù)平臺能有效支撐生命科學研究,、醫(yī)療健康等領(lǐng)域?qū)Υ髷?shù)據(jù)分析的需求。高通量測序?qū)嶒炂脚_,,包括NovaSeq 6000,、10X Chromium X、BD FACSMelody,、PANNORAMIC數(shù)字切片掃描儀等,,配合一支來自海內(nèi)外名校、多學科交叉型的高素質(zhì)綜合團隊,,為您的科學研究保駕護航,。截至2021年10月,烈冰助力發(fā)表單細胞測序文章近20篇,。
單細胞多組學帶來的突破 單細胞測序方法不但改進了實驗過程,,還幫助科學家在健康和疾病研究的關(guān)鍵領(lǐng)域取得新進展。那些過去從轉(zhuǎn)錄平均值或單項參數(shù)讀取中無法獲得的新發(fā)現(xiàn)正在改變我們對傳染病,、神經(jīng)退行性疾病等疾病的認識,。從鑒定新的細胞類型和狀態(tài),到揭開疾病用藥應答和耐藥的潛在機制,,單細胞測序正在推動突破性的研究,,有望改變生物學和醫(yī)療。無論是無法解釋的疾病,,還是人體或自然界中尚未探索的系統(tǒng),,曾經(jīng)模糊的東西正變得越來越清晰。隨著我們邁向科學的未來,,我們手頭的工具就像伽利略的望遠鏡一樣能夠提高焦距和放大倍數(shù),,而定義科學未來的知識新深度是十年前的人們所無法想象的。十二年測序經(jīng)驗,,烈冰生物單細胞多組學領(lǐng)域的佼佼者,。上海10X Chromium X單細胞測序技術(shù)支持
測序可準確地分析基因表達差異、基因結(jié)構(gòu)變異,、篩選分子標記(SNPs或SSR)等生命科學重要問題,。高通量測序單細胞測序數(shù)據(jù)分析可視化
為什么需要單細胞分辨率? 生物學就像宇宙一樣,。它非常復雜,,有許多獨特的單體,也就是細胞,。這些細胞相互作用并扮演不同的角色,在更大的體系中構(gòu)建并驅(qū)動多個過程。就像伽利略探索宇宙的努力一樣,,發(fā)現(xiàn)和定義這些細胞也需要高分辨率的工具,,才能解開促成生物學復雜性的基因表達異質(zhì)性。單細胞測序能夠在以一個細胞為功能單位中開展生物學研究,,闡明具體細節(jié),,構(gòu)建出一幅更大、更精細的圖譜,,說明導致產(chǎn)生某種外在表型的不同類型的分子和細胞之間是如何相互作用的:患者為什么會復發(fā),?是什么讓這種疫苗能夠有效防止傳染等等諸多問題。高通量測序單細胞測序數(shù)據(jù)分析可視化
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司致力于醫(yī)藥健康,,是一家服務型的公司,。公司自成立以來,以質(zhì)量為發(fā)展,,讓匠心彌散在每個細節(jié),,公司旗下單細胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,,空間轉(zhuǎn)錄組測序,,單細胞多組學測序深受客戶的喜愛。公司將不斷增強企業(yè)重點競爭力,,努力學習行業(yè)知識,,遵守行業(yè)規(guī)范,植根于醫(yī)藥健康行業(yè)的發(fā)展,。烈冰生物秉承“客戶為尊,、服務為榮、創(chuàng)意為先,、技術(shù)為實”的經(jīng)營理念,,全力打造公司的重點競爭力。