烈冰生信團隊傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺,,針對龐大的單細胞測序數(shù)據(jù),能夠?qū)崿F(xiàn)細胞類型鑒定的快,、精,、準:一鍵導入gene list構(gòu)建個性化基因列表,;輕松一點即可展示Marker基因的Feature plot,;任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細胞類型;一鍵獲得t-SNE圖,、Heatmap和Violin圖:輕松獲得并下載基因表達的t-SNE圖,、Heatmap、Violin圖,,還可以通過調(diào)節(jié)寬,、高和系數(shù)比例來調(diào)節(jié)美觀,。平臺上線300+task自主分析工具、50+pipeline工作流模板,,幫助烈冰生信分析團隊和自主分析用戶實現(xiàn)分析工具和模板的快速調(diào)用和一站式全流程自動化分析,,節(jié)省工作時間并提升整體工作效率。此外,,烈冰開展了單細胞轉(zhuǎn)錄組,、單細胞多組學以及空間轉(zhuǎn)錄組等多種產(chǎn)品在內(nèi)的全套科研解決方案,歡迎垂詢,。成都單細胞服務(wù)機構(gòu)
針對單細胞測序的細胞數(shù)量判斷環(huán)節(jié):主要是對細胞數(shù)量,、基因表達量、測序質(zhì)量進行整體描述,。過濾標準:由于細胞破碎后游離RNA會釋放到環(huán)境或孔中,,并且測序中也會存在一些死細胞,導致數(shù)據(jù)存在background值,。因此,,我們需要設(shè)定一定的標準來過濾掉假細胞或死細胞。以10× Genomics為例,,細胞數(shù)量判斷主要通過分析UMI Counts-Barcode曲線斜率拐點,,當存在多個斜率拐點的時候,結(jié)合預(yù)期UMI=500時的細胞數(shù)量進行過濾,。當斜率拐點低于UMI=500的時候,,選擇UMI=500作為細胞的判斷的標準;否則,,選擇和預(yù)期細胞數(shù)量接近的拐點作為細胞判斷的位置,。這樣我們能夠有效獲得真實的并且在基因數(shù)量上可以分析的數(shù)據(jù)。長春BD VDJ單細胞測序服務(wù)搭配BD FACSMelody流式分選儀,,全線搭建BD Rahpsody單細胞測序平臺,。
據(jù)不完全統(tǒng)計,截至2022年6月,,烈冰生物助力發(fā)表單細胞文章近40篇,,從平臺應(yīng)用比例來看,應(yīng)用10X Genomics和BD Rhapsody兩大平臺發(fā)文比例各占50%左右,,研究類型涵蓋疾病發(fā)展,,靶點探索,免疫研究,,神經(jīng)發(fā)育,,干細胞分化,植物發(fā)育,退行病變,,糖尿病,,COVID-19等等研究;從發(fā)表期刊水平來看,,烈冰生物聯(lián)合發(fā)表的單細胞文章,,CNS一區(qū)期刊占比在30%以上,其中包括immunity三篇,,Nature子刊3篇(Nature cell biology,Nature Plants,,Nature communication),風濕類領(lǐng)域ARD期刊1篇,CUT 1篇,,Advanced Science多篇,,IF大于10分以上文章占比高達68.5%,烈冰專屬單細胞測序服務(wù)團隊,,將與您攜手譜寫下一篇“高分”新文章,。
烈冰生物搭建近10臺BD Rhapsody平臺,目前為全國范圍內(nèi)的高校,、醫(yī)院和研究所等單位的科研學者提供服務(wù),,BD Rhapsody平臺采用U型微孔板,1個板即對應(yīng)1個樣本(不混樣的情況下),,每個通道一般捕獲細胞數(shù)在1000-10000個之間,,而上限可捕獲40000細胞時也能獲得較低的雙細胞率,此外,,單個細胞捕獲效率高達80%,,可準確鑒別稀有細胞類型,有利于稀有樣本或小細胞量類型樣本研究,;細胞可適性高,,對細胞大小(直徑超過40um細胞需要制備成細胞核)及類型無限制,。細胞捕獲周期較短,,能夠?qū)崿F(xiàn)自動分離,且實驗端捕獲細胞過程全程可視化進行,,保障每一例珍貴樣本實驗的成功進行,,1天內(nèi)可完成從細胞懸液到cDNA文庫構(gòu)建的所有的測序準備工作。單細胞測序是高通量測序下的又一重大技術(shù)突破,。
單細胞測序技術(shù)(Single Cell Sequencing)從一種新興的研究角度,,借助已有的高通量測序手段,幫助研究者在樣本中細胞的異質(zhì)性,、免疫微環(huán)境,、發(fā)育學,、免疫學以及其他領(lǐng)域中進行單細胞層面的數(shù)據(jù)解析,,解決了Bulk Population Sequencing所無法解決的問題,。這樣一個新的研究領(lǐng)域必然也需要足夠可靠的實驗手段來支撐。BD Rhapsody單細胞分選系統(tǒng)為此提供了完善的硬件設(shè)備,,保證了從單細胞懸液質(zhì)量評估到單細胞分選標記過程中每一個實驗步驟的準確質(zhì)控,。NovelBio單細胞實驗團隊借助BD Rhapsody單細胞分選系統(tǒng),在實驗實施層面對單細胞測序結(jié)果的可靠性提供了強有力的保證,。繼單細胞懸液制備之后,,又在另一道關(guān)鍵關(guān)卡提供了可靠的支持,幫助研究者在單細胞測序領(lǐng)域收獲更多的成果,。單細胞測序技術(shù)提供了單個細胞水平下的科學研究視角,。江蘇BD單細胞多組學測序
助力探索生命時空多維度的動態(tài)變化的生物學信息;助力醫(yī)療健康時代,!成都單細胞服務(wù)機構(gòu)
什么時候要用到去死細胞的操作呢,?跟進烈冰生物多年單細胞測序服務(wù)經(jīng)驗來看,當細胞懸液進行質(zhì)量和活性檢測后,,考慮對細胞活性在50%-70%的懸液進行去除死細胞的操作,。而太低活性的懸液(小于30%),懸液中細胞大量死亡,,可能已經(jīng)丟失了原組織內(nèi)的細胞比例和狀態(tài),,失真嚴重,建議重新收集樣本進行新的實驗,,保證數(shù)據(jù)的高質(zhì)量和實驗結(jié)果的準確性,。但需要注意到,去除死細胞的操作會損失一定的細胞數(shù)量,,因此希望您在提供樣本時,,盡可能提供足量的細胞,以備實驗過程中可能存在的細胞死亡的問題,,BD Rhapsody單細胞捕獲平臺對樣本起始細胞量的要求較低,,一般提供10萬個細胞以上均可滿足需求,特殊樣本可詳細咨詢烈冰生物,。成都單細胞服務(wù)機構(gòu)
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司位于江月路999號奇亞特中心22幢,,是一家專業(yè)的生物科技、醫(yī)藥科技,、信息科技,、計算機科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)服務(wù),、技術(shù)轉(zhuǎn)讓,、技術(shù)咨詢,市場營銷策劃,市場信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會調(diào)查,、社會調(diào)研,、民意調(diào)查、民意測驗),,從事貨物及技術(shù)的進出口業(yè)務(wù),,計算機、軟件及耗材(除??兀?,軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準的項目,經(jīng)相關(guān)部門批準后方可開展經(jīng)營活動】公司,。致力于創(chuàng)造***的產(chǎn)品與服務(wù),,以誠信、敬業(yè),、進取為宗旨,,以建NovelBio,烈冰生物,NovelBrain,PanoCell,烈冰智造產(chǎn)品為目標,努力打造成為同行業(yè)中具有影響力的企業(yè),。公司以用心服務(wù)為重點價值,,希望通過我們的專業(yè)水平和不懈努力,將生物科技,、醫(yī)藥科技,、信息科技、計算機科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā),、技術(shù)服務(wù),、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢,,市場營銷策劃,,市場信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會調(diào)查、社會調(diào)研,、民意調(diào)查,、民意測驗),從事貨物及技術(shù)的進出口業(yè)務(wù),,計算機,、軟件及耗材(除專控),,軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準的項目,,經(jīng)相關(guān)部門批準后方可開展經(jīng)營活動】等業(yè)務(wù)進行到底。上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司主營業(yè)務(wù)涵蓋單細胞測序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,,空間轉(zhuǎn)錄組測序,,單細胞多組學測序,堅持“質(zhì)量保證,、良好服務(wù),、顧客滿意”的質(zhì)量方針,贏得廣大客戶的支持和信賴,。