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無錫scRNA單細胞測序服務

來源: 發(fā)布時間:2022-07-09

所謂的高通量測序技術,,又名大規(guī)模平行測序,,是將 DNA(或者 cDNA)隨機片段化、加接頭,,制備測序文庫,,通過對文庫中數以萬計的克隆(colony)進行延伸反應,檢測對應的信號,,獲取序列信息,。與傳統(tǒng)測序法(Sanger法等)相比,高通量測序技術在處理大規(guī)模樣品時具有明顯的優(yōu)勢,,又快(兩天)又多(數百萬克?。蔀槟壳敖M學研究的主要技術,。單細胞測序是一個系統(tǒng)的工程,,開展項目前您可能會先評估它提供的見解是否與您的研究問題相匹配,如果匹配,,實驗過程如何規(guī)劃,,實驗平臺如何選擇,樣本如何制備,,數據如何分析等等,,而在這一切開始之前,我們的服務就已經開始了,,從銷售到實驗到專業(yè)技術支持,,我們開通全線對接渠道,幫助您快速定位項目訴求,,提供從實驗設計到文章發(fā)表的全流程,,我們始終是您貼心的科學合作伙伴。豐富的測序和數據分析經驗,,烈冰配套全程個性化,、定制化地數據分析服務。無錫scRNA單細胞測序服務

相對于Smart-Seq技術在細胞數量上的問題,,BD平臺普遍提供的細胞數量都在1000-10000不等的測序細胞量,,特殊研究需求的項目,可提供上限40000個細胞的捕獲量(單個樣本),。這個量級的測序細胞量已經可以說能夠完全覆蓋絕大部分組織的Single Cell群體類型,。因此,對于基于基因表達進行準確細胞分型上,,無論是從細胞數量上來說還是表達檢測可靠性來說,,都會更實用。此外針對特殊項目研究,,如需要捕獲和分析脆弱的細胞,,如粒細胞、中性粒細胞,、CAR-T細胞,、干細胞、移植瘤細胞,、骨髓瘤細胞等,,烈冰生BD平臺也有更好的捕獲效能,滿足您的實際需求。合肥單細胞服務機構BD 單細胞捕獲平臺搭配BD Scanner,,全流程實時質控,,項目質量盡在掌握。

科研的魅力之處,,在于無窮盡的探尋生命的本底,,通過單細胞測序,我們對組織的分子基礎的研究也從初級到深層,,并在單細胞層面逐漸達成一致,,那么不禁要問一句,組織的空間位置到底重不重要,?空間異質性是功能的關鍵特征,,細胞的位置信息更能反應細胞命運調控機制和細胞譜系發(fā)生過程。因此時間和空間即像組織的AB面,,而不可否認的是,,此時空間坐標的記錄,像一個還未長大的娃娃,,雖未觸及分子基礎研究的深層,,但仍在努力攀登探尋生命本底的下一個高峰。

針對單細胞測序的細胞數量判斷環(huán)節(jié):主要是對細胞數量,、基因表達量,、測序質量進行整體描述。過濾標準:由于細胞破碎后游離RNA會釋放到環(huán)境或孔中,,并且測序中也會存在一些死細胞,,導致數據存在background值。因此,,我們需要設定一定的標準來過濾掉假細胞或死細胞,。以10× Genomics為例,細胞數量判斷主要通過分析UMI Counts-Barcode曲線斜率拐點,,當存在多個斜率拐點的時候,,結合預期UMI=500時的細胞數量進行過濾。當斜率拐點低于UMI=500的時候,,選擇UMI=500作為細胞的判斷的標準,;否則,選擇和預期細胞數量接近的拐點作為細胞判斷的位置,。這樣我們能夠有效獲得真實的并且在基因數量上可以分析的數據,。十二年測序經驗,烈冰生物單細胞多組學領域的佼佼者,。

現有的單細胞測序技術陣營在幾個主要領域存在差別,。一個是基于微流控通道的細胞與Beads的在通道內的動態(tài)結合,,通過油相水相不相容的特點將結合了的細胞和Beads進行分隔,在這個空間,,單個細胞的內容物釋放,,轉錄本或其他生物分析物被標記或添加索引,以便下游識別,。BD Rhapsody單細胞測序平臺采用靜態(tài)微孔技術(Cyto-Seq具有類似的技術原理),。通過微孔板的物理分隔,,將一個個單個細胞和帶有標簽的磁珠,,一對一的“框”在微反應的物理平臺中。這樣,,每一個細胞都會結合一個磁珠,,那么在每一個磁珠中上長滿了不同的Cell Barcode和UMI Barcode連接形成的序列,再加上一端PolyT的抓手,,這個抓手就會使用oligo dT抓住mRNA構建文庫,。深度的單細胞測序數據解讀助力醫(yī)療健康大時代。BD Rhapsody單細胞

烈冰BD Rahpsody單細胞測序平臺,,助力您的深入科學探究,。無錫scRNA單細胞測序服務

烈冰生信團隊傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數據分析平臺,針對龐大的單細胞測序數據,,能夠實現細胞類型鑒定的快,、精、準:一鍵導入gene list構建個性化基因列表,;輕松一點即可展示Marker基因的Feature plot,;任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細胞類型;一鍵獲得t-SNE圖,、Heatmap和Violin圖:輕松獲得并下載基因表達的t-SNE圖,、Heatmap、Violin圖,,還可以通過調節(jié)寬,、高和系數比例來調節(jié)美觀。平臺上線300+task自主分析工具,、50+pipeline工作流模板,,幫助烈冰生信分析團隊和自主分析用戶實現分析工具和模板的快速調用和一站式全流程自動化分析,節(jié)省工作時間并提升整體工作效率,。無錫scRNA單細胞測序服務

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