相對于Smart-Seq技術(shù)在細(xì)胞數(shù)量上的問題,,BD平臺普遍提供的細(xì)胞數(shù)量都在1000-10000不等的測序細(xì)胞量,特殊研究需求的項(xiàng)目,,可提供上限40000個(gè)細(xì)胞的捕獲量(單個(gè)樣本),。這個(gè)量級的測序細(xì)胞量已經(jīng)可以說能夠完全覆蓋絕大部分組織的Single Cell群體類型。因此,,對于基于基因表達(dá)進(jìn)行準(zhǔn)確細(xì)胞分型上,,無論是從細(xì)胞數(shù)量上來說還是表達(dá)檢測可靠性來說,都會(huì)更實(shí)用,。此外針對特殊項(xiàng)目研究,,如需要捕獲和分析脆弱的細(xì)胞,如粒細(xì)胞,、中性粒細(xì)胞,、CAR-T細(xì)胞、干細(xì)胞,、移植瘤細(xì)胞,、骨髓瘤細(xì)胞等,烈冰生BD平臺也有更好的捕獲效能,,滿足您的實(shí)際需求,。深度的單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)解讀助力醫(yī)療健康大時(shí)代。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序
烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),,深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,,深入挖掘其背后的生物學(xué)意義;從操作便捷,、結(jié)果可視化,、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究,,加速科研進(jìn)程,!此外,烈冰生信團(tuán)隊(duì)根據(jù)豐富的實(shí)戰(zhàn)經(jīng)驗(yàn)為用戶量身打造了一款單細(xì)胞測序結(jié)果解讀的神兵利器——單細(xì)胞瀏覽器(Single Cell Browser),,不但可以將海量復(fù)雜的結(jié)果文件可視化,,還是可以實(shí)現(xiàn)三維立體化展示的軟件,。專業(yè)的生信代碼交給專業(yè)的烈冰,,專業(yè)的生物學(xué)意義交給專業(yè)的您,詳情請咨詢烈冰生物。南京single cell 單細(xì)胞測序烈冰一站式單細(xì)胞測序服務(wù):立足科學(xué)研究,,解碼生命本質(zhì),。
關(guān)于BD Rhapsody單細(xì)胞平臺的樣本類型和樣本制備 :在上機(jī)前需要注意細(xì)胞消化后的細(xì)胞團(tuán)塊,獲得分離良好的細(xì)胞懸液,、且細(xì)胞活力高(>70%),;此外,了解您所研究細(xì)胞的大小范圍也很重要,。細(xì)胞大小通常與細(xì)胞表達(dá)的轉(zhuǎn)錄本數(shù)量有關(guān),。各種尺寸不同的細(xì)胞(一般直徑不大于50μm)均可與我們基因表達(dá)解決方案中使用的BD Rhapsody平臺兼容。一般來說,,細(xì)胞制備方案將根據(jù)組織來源和細(xì)胞類型而變化,。每種組織類型都是獨(dú)特的,因此,,必須在開始任何單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)之前優(yōu)化樣本制備,,烈冰多年樣本解離消化經(jīng)驗(yàn),累積10+物種,、50+組織的消化protocol,,若您的樣本為組織,且尚未成功將組織樣本消化成單細(xì)胞懸液,,烈冰將盡可能提供技術(shù)及實(shí)驗(yàn)上的幫助,。
烈冰生信團(tuán)隊(duì)傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺,針對龐大的單細(xì)胞測序數(shù)據(jù),,能夠?qū)崿F(xiàn)細(xì)胞類型鑒定的快,、精、準(zhǔn):一鍵導(dǎo)入gene list構(gòu)建個(gè)性化基因列表,;輕松一點(diǎn)即可展示Marker基因的Feature plot,;任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細(xì)胞類型;一鍵獲得t-SNE圖,、Heatmap和Violin圖:輕松獲得并下載基因表達(dá)的t-SNE圖,、Heatmap、Violin圖,,還可以通過調(diào)節(jié)寬,、高和系數(shù)比例來調(diào)節(jié)美觀。平臺上線300+task自主分析工具,、50+pipeline工作流模板,,幫助烈冰生信分析團(tuán)隊(duì)和自主分析用戶實(shí)現(xiàn)分析工具和模板的快速調(diào)用和一站式全流程自動(dòng)化分析,節(jié)省工作時(shí)間并提升整體工作效率,。此外,,烈冰開展了單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組,、單細(xì)胞多組學(xué)以及空間轉(zhuǎn)錄組等多種產(chǎn)品在內(nèi)的全套科研解決方案,歡迎垂詢,。
單細(xì)胞測序?qū)嶒?yàn)再樣本細(xì)胞上機(jī)分選簽,,需要對細(xì)胞數(shù)量、細(xì)胞活性進(jìn)準(zhǔn)判斷,,這對Single Cell分選標(biāo)記,、建庫、下機(jī)數(shù)據(jù)的質(zhì)量都具有著決定性的作用,。如若細(xì)胞計(jì)數(shù)偏高,,將會(huì)影響建庫的成功率;計(jì)數(shù)偏低,,則會(huì)提高雙細(xì)胞的比例,;而細(xì)胞活率過低,就會(huì)使測序數(shù)據(jù)的利用率大打折扣,,因此把好單細(xì)胞懸液質(zhì)量這一關(guān)尤為重要,。而在鋪板過程中,由于不同操作人員手法具有不可避免的差異,,不同的液體流速將直接影響單細(xì)胞的入孔效果,。因此烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞分選平臺配套了專門定制的電動(dòng)移液器,其具有Prime Treat,、Cell Load,、Bead Load、Wash,、Lysis,、Retrieval多種操作模式,來對應(yīng)各種不同的操作,。通過已經(jīng)設(shè)定的程序來控制液體的流速,,大幅度降低人為操作習(xí)慣帶來的差異,保證實(shí)驗(yàn)操作的一致性,。烈冰生物作為BD 中國聯(lián)合成立單細(xì)胞測序?qū)嶒?yàn)室,,為推動(dòng)單細(xì)胞測序技術(shù)發(fā)展貢獻(xiàn)中國力量。重慶single cell 單細(xì)胞服務(wù)機(jī)構(gòu)
烈冰測序服務(wù)已助力300余篇國際期刊研究文章發(fā)表,。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序
現(xiàn)有的單細(xì)胞測序技術(shù)陣營在幾個(gè)主要領(lǐng)域存在差別,。一個(gè)是基于微流控通道的細(xì)胞與Beads的在通道內(nèi)的動(dòng)態(tài)結(jié)合,通過油相水相不相容的特點(diǎn)將結(jié)合了的細(xì)胞和Beads進(jìn)行分隔,,在這個(gè)空間,,單個(gè)細(xì)胞的內(nèi)容物釋放,轉(zhuǎn)錄本或其他生物分析物被標(biāo)記或添加索引,,以便下游識別,。BD Rhapsody單細(xì)胞測序平臺采用靜態(tài)微孔技術(shù)(Cyto-Seq具有類似的技術(shù)原理),。通過微孔板的物理分隔,將一個(gè)個(gè)單個(gè)細(xì)胞和帶有標(biāo)簽的磁珠,,一對一的“框”在微反應(yīng)的物理平臺中。這樣,,每一個(gè)細(xì)胞都會(huì)結(jié)合一個(gè)磁珠,,那么在每一個(gè)磁珠中上長滿了不同的Cell Barcode和UMI Barcode連接形成的序列,再加上一端PolyT的抓手,,這個(gè)抓手就會(huì)使用oligo dT抓住mRNA構(gòu)建文庫,。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司是一家生物科技、醫(yī)藥科技,、信息科技,、計(jì)算機(jī)科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)服務(wù),、技術(shù)轉(zhuǎn)讓,、技術(shù)咨詢,市場營銷策劃,,市場信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會(huì)調(diào)查,、社會(huì)調(diào)研、民意調(diào)查,、民意測驗(yàn)),,從事貨物及技術(shù)的進(jìn)出口業(yè)務(wù),計(jì)算機(jī),、軟件及耗材(除??兀浖_發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,,經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營活動(dòng)】的公司,,致力于發(fā)展為創(chuàng)新務(wù)實(shí)、誠實(shí)可信的企業(yè),。公司自創(chuàng)立以來,,投身于單細(xì)胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,,空間轉(zhuǎn)錄組測序,,單細(xì)胞多組學(xué)測序,是醫(yī)藥健康的主力軍,。烈冰生物致力于把技術(shù)上的創(chuàng)新展現(xiàn)成對用戶產(chǎn)品上的貼心,,為用戶帶來良好體驗(yàn)。烈冰生物始終關(guān)注自身,,在風(fēng)云變化的時(shí)代,,對自身的建設(shè)毫不懈怠,,高度的專注與執(zhí)著使烈冰生物在行業(yè)的從容而自信。