從單細(xì)胞測序描述性分析轉(zhuǎn)向復(fù)雜樣本中不同細(xì)胞類型的功能解析,,越來越需要一種多組學(xué)的細(xì)胞生物學(xué)視角,。通過單細(xì)胞多組學(xué)——即對不同組學(xué)的數(shù)據(jù)集進(jìn)行分析和整合——科學(xué)家能夠從同一個單細(xì)胞來源中檢測多種細(xì)胞特征,。這些特征包括全轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá),、細(xì)胞表面蛋白表達(dá),、免疫組庫序列(包括T細(xì)胞和B細(xì)胞受體)以及用于了解表觀基因組調(diào)控的開放染色質(zhì)區(qū)域,。隨著單個實(shí)驗(yàn)可提供更多信息豐富的數(shù)據(jù),,研究人員的獲益更多,,包括保留珍貴樣本,、提高生產(chǎn)力、減少因批次效應(yīng)引起的錯誤,,并節(jié)省更多的高科技資源(從資助基金到人員時間),。烈冰BD Rahpsody單細(xì)胞測序平臺,助力您的深入科學(xué)探究,。廈門scRNA單細(xì)胞服務(wù)機(jī)構(gòu)
單細(xì)胞測序技術(shù)(Single Cell Sequencing)從一種新興的研究角度,,借助已有的高通量測序手段,幫助研究者在樣本中細(xì)胞的異質(zhì)性,、免疫微環(huán)境,、發(fā)育學(xué)、免疫學(xué)以及其他領(lǐng)域中進(jìn)行單細(xì)胞層面的數(shù)據(jù)解析,,解決了Bulk Population Sequencing所無法解決的問題,。這樣一個新的研究領(lǐng)域必然也需要足夠可靠的實(shí)驗(yàn)手段來支撐。BD Rhapsody單細(xì)胞分選系統(tǒng)為此提供了完善的硬件設(shè)備,,保證了從單細(xì)胞懸液質(zhì)量評估到單細(xì)胞分選標(biāo)記過程中每一個實(shí)驗(yàn)步驟的準(zhǔn)確質(zhì)控,。NovelBio單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)團(tuán)隊(duì)借助BD Rhapsody單細(xì)胞分選系統(tǒng),,在實(shí)驗(yàn)實(shí)施層面對單細(xì)胞測序結(jié)果的可靠性提供了強(qiáng)有力的保證。繼單細(xì)胞懸液制備之后,,又在另一道關(guān)鍵關(guān)卡提供了可靠的支持,,幫助研究者在單細(xì)胞測序領(lǐng)域收獲更多的成果。南京BD單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺ATCG堿基的排列組合構(gòu)成了測序的龐大世界,。
單細(xì)胞測序結(jié)果動輒上百G數(shù)據(jù)量,,龐大的數(shù)據(jù)對于分析平臺和分析能力有著很高的要求,首先針對下機(jī)數(shù)據(jù)的質(zhì)控環(huán)節(jié):單細(xì)胞測序產(chǎn)生數(shù)億的結(jié)果序列,,不可避免的會出現(xiàn)低質(zhì)量的測序結(jié)果,,存在各種情況的序列污染。因此序列過濾及質(zhì)量評估就會變得極為重要,。序列質(zhì)量主要通過測序質(zhì)量值Q20/Q30的占比來表征,,即堿基測序結(jié)果的錯誤率在1% / 0.1%以下的比例,。理想的測序結(jié)果reads的堿基質(zhì)量均高于30,。保證數(shù)據(jù)獲得后的處理結(jié)果的準(zhǔn)確性,為后續(xù)細(xì)胞類型鑒定和功能分析打下堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ),。
關(guān)于BD Rhapsody單細(xì)胞平臺的樣本類型和樣本制備 :在上機(jī)前需要注意細(xì)胞消化后的細(xì)胞團(tuán)塊,,獲得分離良好的細(xì)胞懸液、且細(xì)胞活力高(>70%),;此外,,了解您所研究細(xì)胞的大小范圍也很重要。細(xì)胞大小通常與細(xì)胞表達(dá)的轉(zhuǎn)錄本數(shù)量有關(guān),。各種尺寸不同的細(xì)胞(一般直徑不大于50μm)均可與我們基因表達(dá)解決方案中使用的BD Rhapsody平臺兼容,。一般來說,細(xì)胞制備方案將根據(jù)組織來源和細(xì)胞類型而變化,。每種組織類型都是獨(dú)特的,,因此,必須在開始任何單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)之前優(yōu)化樣本制備,,烈冰多年樣本解離消化經(jīng)驗(yàn),,累積10+物種、50+組織的消化protocol,,若您的樣本為組織,,且尚未成功將組織樣本消化成單細(xì)胞懸液,烈冰將盡可能提供技術(shù)及實(shí)驗(yàn)上的幫助,。高通量測序技術(shù)是對傳統(tǒng)測序一次突破性的改變,,一次對幾十萬到幾百萬條核酸序列進(jìn)行測定。
烈冰生信團(tuán)隊(duì)傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺,,針對龐大的單細(xì)胞測序數(shù)據(jù),,能夠?qū)崿F(xiàn)細(xì)胞類型鑒定的快,、精、準(zhǔn):一鍵導(dǎo)入gene list構(gòu)建個性化基因列表,;輕松一點(diǎn)即可展示Marker基因的Feature plot,;任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細(xì)胞類型;一鍵獲得t-SNE圖,、Heatmap和Violin圖:輕松獲得并下載基因表達(dá)的t-SNE圖,、Heatmap、Violin圖,,還可以通過調(diào)節(jié)寬,、高和系數(shù)比例來調(diào)節(jié)美觀。平臺上線300+task自主分析工具,、50+pipeline工作流模板,,幫助烈冰生信分析團(tuán)隊(duì)和自主分析用戶實(shí)現(xiàn)分析工具和模板的快速調(diào)用和一站式全流程自動化分析,節(jié)省工作時間并提升整體工作效率,?;凇办o態(tài)蜂巢”技術(shù),實(shí)現(xiàn)落孔細(xì)胞的物力分割和磁珠的一對一匹配,。無錫BD單細(xì)胞測序公司
單細(xì)胞測序技術(shù)提供了單個細(xì)胞水平下的科學(xué)研究視角,。廈門scRNA單細(xì)胞服務(wù)機(jī)構(gòu)
針對單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析時的reads數(shù)、基因表達(dá)量及細(xì)胞數(shù)量判定過程中:以捕獲5000個細(xì)胞,、100G的測序量為標(biāo)準(zhǔn),,每個細(xì)胞的reads數(shù)大約在50k左右;每個細(xì)胞的基因中位數(shù)取決于樣本的細(xì)胞類型,,例如成熟的B,,T,粒細(xì)胞數(shù)量較多的組織中,,由于該類型細(xì)胞表達(dá)的基因數(shù)普遍較少,,導(dǎo)致基因中位數(shù)下降。而某些疾病組織,、或者體外培養(yǎng)的如干細(xì)胞等,,他們的基因表達(dá)數(shù)較高,甚至可以超過1W,,這就導(dǎo)致該類樣本基因中位數(shù)非常高,。因此,我們對細(xì)胞數(shù)量以及基因中位數(shù)確認(rèn)時,,需要考察實(shí)際組織的細(xì)胞組成,。廈門scRNA單細(xì)胞服務(wù)機(jī)構(gòu)
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司辦公設(shè)施齊全,辦公環(huán)境優(yōu)越,為員工打造良好的辦公環(huán)境,。專業(yè)的團(tuán)隊(duì)大多數(shù)員工都有多年工作經(jīng)驗(yàn),,熟悉行業(yè)專業(yè)知識技能,致力于發(fā)展NovelBio,烈冰生物,NovelBrain,PanoCell,烈冰智造的品牌,。公司以用心服務(wù)為重點(diǎn)價值,,希望通過我們的專業(yè)水平和不懈努力,將生物科技,、醫(yī)藥科技,、信息科技、計(jì)算機(jī)科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā),、技術(shù)服務(wù),、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢,,市場營銷策劃,,市場信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會調(diào)查、社會調(diào)研,、民意調(diào)查,、民意測驗(yàn)),從事貨物及技術(shù)的進(jìn)出口業(yè)務(wù),,計(jì)算機(jī),、軟件及耗材(除專控),,軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營活動】等業(yè)務(wù)進(jìn)行到底,。誠實(shí),、守信是對企業(yè)的經(jīng)營要求,也是我們做人的基本準(zhǔn)則,。公司致力于打造***的單細(xì)胞測序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,空間轉(zhuǎn)錄組測序,,單細(xì)胞多組學(xué)測序,。