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北京BD VDJ單細(xì)胞平臺(tái)

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-07-19

烈冰生物BD Rhapsody平臺(tái),,采用精簡(jiǎn)的工作流程助力您的實(shí)驗(yàn)成功: 1.制備單細(xì)胞懸液:可使用碧迪醫(yī)療單細(xì)胞多樣本分析試劑盒和 /或BD Ab-seq寡核苷酸偶聯(lián)抗體( Ab-Oligos)將細(xì)胞染色 2.微孔板預(yù)充和處理:使用自動(dòng)移液器進(jìn)行液體交換 3.單細(xì)胞捕獲工作流程: (1)細(xì)胞上樣:上樣 575微升細(xì)胞懸液,;系統(tǒng)未采用微流體通道設(shè)計(jì),無(wú)需擔(dān)心通道堵寨,;通過(guò)重力輕輕沉淀細(xì)胞,,可捕獲脆弱細(xì)胞,BD Rhapsody微孔板包含大于220,000個(gè)分區(qū),,可在低雙細(xì)胞率下捕獲多達(dá)40000個(gè)細(xì)胞 (2)細(xì)胞上樣掃描:估算捕獲的活細(xì)胞數(shù)量和細(xì)胞多態(tài)率 (3)磁珠上樣:微孔的正六邊形幾何形狀和尺寸可防止磁珠多重分配在微孔中 (4)磁珠上樣和磁珠洗滌掃描:估算包含活細(xì)胞和磁珠的微孔數(shù)量,;測(cè)定細(xì)胞存留率,評(píng)估是否發(fā)生細(xì)胞損失 (5)細(xì)胞裂解:使用裂解緩沖液,,確保細(xì)胞完全裂解 (6)磁珠回收:輕松,、高效地磁性回收磁珠并采用Scanner掃描磁珠回收情況深度的單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)解讀助力醫(yī)療健康大時(shí)代。北京BD VDJ單細(xì)胞平臺(tái)

由于高通量測(cè)序?qū)嶒?yàn)方法相關(guān)的測(cè)序成本,,使得單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)往往非常昂貴,,烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)珍視您的每一份樣本,在平臺(tái)搭建前,,我們測(cè)試評(píng)估了BD Rhapsody的性能,,與BD官方公布的數(shù)據(jù)結(jié)合來(lái)看,將人293T和小鼠NIH/3T3細(xì)胞的1:1混合物以不同濃度上樣到BD Rhapsody卡式芯片上,。存儲(chǔ)的cDNA分子普遍擴(kuò)增并進(jìn)行低通量測(cè)序(每個(gè)細(xì)胞月8700個(gè)讀數(shù)),。在測(cè)序數(shù)據(jù)中檢測(cè)到1109個(gè)細(xì)胞的上樣條件下,每個(gè)細(xì)胞中,,來(lái)自每個(gè)細(xì)胞的平均99.4%的分子經(jīng)檢測(cè)為人或小鼠,,這表明微孔之間的串?dāng)_非常小,在測(cè)序數(shù)據(jù)中檢測(cè)到1000個(gè)或更少細(xì)胞的上樣密度下,,多重態(tài)發(fā)生率接近零,,并且在15000個(gè)細(xì)胞下小于5%。廣東BD VDJ單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序十二年測(cè)序經(jīng)驗(yàn),,烈冰生物單細(xì)胞多組學(xué)領(lǐng)域的佼佼者,。

現(xiàn)有的單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)陣營(yíng)在幾個(gè)主要領(lǐng)域存在差別。一個(gè)是基于微流控通道的細(xì)胞與Beads的在通道內(nèi)的動(dòng)態(tài)結(jié)合,,通過(guò)油相水相不相容的特點(diǎn)將結(jié)合了的細(xì)胞和Beads進(jìn)行分隔,,在這個(gè)空間,單個(gè)細(xì)胞的內(nèi)容物釋放,,轉(zhuǎn)錄本或其他生物分析物被標(biāo)記或添加索引,以便下游識(shí)別,。BD Rhapsody單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)采用靜態(tài)微孔技術(shù)(Cyto-Seq具有類(lèi)似的技術(shù)原理),。通過(guò)微孔板的物理分隔,將一個(gè)個(gè)單個(gè)細(xì)胞和帶有標(biāo)簽的磁珠,,一對(duì)一的“框”在微反應(yīng)的物理平臺(tái)中,。這樣,,每一個(gè)細(xì)胞都會(huì)結(jié)合一個(gè)磁珠,那么在每一個(gè)磁珠中上長(zhǎng)滿了不同的Cell Barcode和UMI Barcode連接形成的序列,,再加上一端PolyT的抓手,,這個(gè)抓手就會(huì)使用oligo dT抓住mRNA構(gòu)建文庫(kù)。

樣本制備后的保存 為了盡可能地減少轉(zhuǎn)錄組的變化,,在對(duì)細(xì)胞進(jìn)行清洗和計(jì)數(shù)后,,單細(xì)胞懸液應(yīng)當(dāng)保存于冰上,直至用于后續(xù)的上機(jī)和文庫(kù)制備步驟,。在理想狀況下,,一旦制備好樣本,應(yīng)當(dāng)在3min鐘內(nèi)將其用于下游步驟,。然而,,您還有必要了解各類(lèi)細(xì)胞的不同性質(zhì),因?yàn)檫@可能會(huì)影響細(xì)胞應(yīng)在冰上保存的時(shí)間,,以及它們?cè)谥苽浜蠖嗑帽銘?yīng)當(dāng)被盡快使用,。例如,有些細(xì)胞(如PBMC)如果在冰上放置一段時(shí)間,,它們就開(kāi)始形成團(tuán)塊,。這些團(tuán)塊很難解離,增加了堵塞的風(fēng)險(xiǎn),,而且每個(gè)團(tuán)塊被當(dāng)成單細(xì)胞計(jì)數(shù),,又降低了細(xì)胞計(jì)數(shù)的準(zhǔn)確性。此外,,有些細(xì)胞更加粘稠,,形成團(tuán)塊的速度更快。對(duì)于這些細(xì)胞,,必須盡量減少制備和使用之間的時(shí)間差,。單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序可識(shí)別重要的轉(zhuǎn)錄因子,進(jìn)行譜系和發(fā)育追蹤,。

據(jù)不完全統(tǒng)計(jì),,截至2022年6月,烈冰生物助力發(fā)表單細(xì)胞文章近40篇,,從平臺(tái)應(yīng)用比例來(lái)看,,應(yīng)用10X Genomics和BD Rhapsody兩大平臺(tái)發(fā)文比例各占50%左右,研究類(lèi)型涵蓋疾病發(fā)展,,靶點(diǎn)探索,,免疫研究,神經(jīng)發(fā)育,,干細(xì)胞分化,,植物發(fā)育,,退行病變,糖尿病,,COVID-19等等研究,;從發(fā)表期刊水平來(lái)看,烈冰生物聯(lián)合發(fā)表的單細(xì)胞文章,,CNS一區(qū)期刊占比在30%以上,,其中包括immunity三篇,Nature子刊3篇(Nature cell biology,Nature Plants,,Nature communication),風(fēng)濕類(lèi)領(lǐng)域ARD期刊1篇,,CUT 1篇,Advanced Science多篇,,IF大于10分以上文章占比高達(dá)68.5%,,烈冰專(zhuān)屬單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)團(tuán)隊(duì),將與您攜手譜寫(xiě)下一篇“高分”新文章,。2019年,,烈冰已助力發(fā)表了采用BD Rahpsody平臺(tái)的單細(xì)胞風(fēng)濕類(lèi)文章。廣東BD VDJ單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序

烈冰對(duì)于一個(gè)細(xì)胞群體中的每個(gè)細(xì)胞單獨(dú)進(jìn)行建庫(kù)測(cè)序分析,。北京BD VDJ單細(xì)胞平臺(tái)

烈冰生物為您的實(shí)驗(yàn)定制工作流程: 對(duì)于不同用戶和實(shí)驗(yàn),,單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)工作流程往往需要不同程度的樣本操作、質(zhì)量和通量,。BD儀器選項(xiàng)可以根據(jù)具體需求進(jìn)行配置,。烈冰生物搭建BD FACS流式分選平臺(tái)(如 BD FACSMelody),是上游樣本富集的良好選擇,。此外,,我們具備BD Rhapsody單細(xì)胞成像儀提供自動(dòng)化細(xì)胞計(jì)數(shù)和細(xì)胞樣本活性測(cè)試,幫助用戶制備適用于Cartridge微孔板單細(xì)胞捕獲濃度的樣本,。掃描儀提供了微孔板上磁珠捕獲細(xì)胞的計(jì)數(shù),。BD Rhapsody 樣品上樣工作站輕巧便攜,可在實(shí)驗(yàn)室內(nèi)輕松移動(dòng),。搭配烈冰傾情研發(fā)多年的成果NovelBrain生物信息大數(shù)據(jù)分析系統(tǒng),,完成測(cè)序數(shù)據(jù)的生物信息分析和結(jié)果可視化呈現(xiàn)。這些工具包括 UMI 分析算法和可視化工具,,即使沒(méi)有經(jīng)驗(yàn)的用戶也可分析和理解單細(xì)胞數(shù)據(jù),。北京BD VDJ單細(xì)胞平臺(tái)

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司總部位于江月路999號(hào)奇亞特中心22幢,是一家生物科技,、醫(yī)藥科技,、信息科技、計(jì)算機(jī)科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開(kāi)發(fā),、技術(shù)服務(wù),、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢,,市場(chǎng)營(yíng)銷(xiāo)策劃,,市場(chǎng)信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會(huì)調(diào)查、社會(huì)調(diào)研,、民意調(diào)查,、民意測(cè)驗(yàn)),從事貨物及技術(shù)的進(jìn)出口業(yè)務(wù),,計(jì)算機(jī),、軟件及耗材(除專(zhuān)控),軟件開(kāi)發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,,經(jīng)相關(guān)部門(mén)批準(zhǔn)后方可開(kāi)展經(jīng)營(yíng)活動(dòng)】的公司,。烈冰生物作為生物科技、醫(yī)藥科技,、信息科技,、計(jì)算機(jī)科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開(kāi)發(fā)、技術(shù)服務(wù),、技術(shù)轉(zhuǎn)讓,、技術(shù)咨詢,市場(chǎng)營(yíng)銷(xiāo)策劃,,市場(chǎng)信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會(huì)調(diào)查,、社會(huì)調(diào)研、民意調(diào)查,、民意測(cè)驗(yàn)),,從事貨物及技術(shù)的進(jìn)出口業(yè)務(wù),計(jì)算機(jī),、軟件及耗材(除專(zhuān)控),,軟件開(kāi)發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,經(jīng)相關(guān)部門(mén)批準(zhǔn)后方可開(kāi)展經(jīng)營(yíng)活動(dòng)】的企業(yè)之一,,為客戶提供良好的單細(xì)胞測(cè)序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序,。烈冰生物不斷開(kāi)拓創(chuàng)新,追求出色,,以技術(shù)為先導(dǎo),,以產(chǎn)品為平臺(tái),以應(yīng)用為重點(diǎn),,以服務(wù)為保證,,不斷為客戶創(chuàng)造更高價(jià)值,,提供更優(yōu)服務(wù)。烈冰生物創(chuàng)始人陳岱,,始終關(guān)注客戶,,創(chuàng)新科技,竭誠(chéng)為客戶提供良好的服務(wù),。