您的珍貴樣本,,可以放心依賴烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞捕獲系統(tǒng),,首先,該系統(tǒng)的技術(shù)原理是基于cyto-seq的微孔技術(shù),,因此不會因為樣本細(xì)胞體積太大或懸液背景太雜等問題導(dǎo)致捕獲通道的堵塞進(jìn)而導(dǎo)致樣本的損失,;其次,,BD RhapsodyTM單細(xì)胞捕獲系統(tǒng)無電子元件,便于攜帶,,當(dāng)您的樣本需及時實驗時,,我們可以“拎包上門”,快速的完成細(xì)胞捕獲部分,,不至于珍貴樣本因細(xì)胞活性快速下降帶來的損失,;在這,BD Rhapsody單細(xì)胞捕獲系統(tǒng)對細(xì)胞數(shù)量包容性較好,,細(xì)胞懸液上樣量高達(dá)575ul,,針對樣本中細(xì)胞數(shù)量較少的組織類型,,也能完成整個項目的細(xì)胞捕獲工作,。單細(xì)胞測序是高通量測序下的又一重大技術(shù)突破。吉林BD VDJ單細(xì)胞平臺
由于高通量測序?qū)嶒灧椒ㄏ嚓P(guān)的測序成本,,使得單細(xì)胞實驗往往非常昂貴,,烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞測序服務(wù)珍視您的每一份樣本,在平臺搭建前,,我們測試評估了BD Rhapsody的性能,,與BD官方公布的數(shù)據(jù)結(jié)合來看,將人293T和小鼠NIH/3T3細(xì)胞的1:1混合物以不同濃度上樣到BD Rhapsody卡式芯片上,。存儲的cDNA分子普遍擴(kuò)增并進(jìn)行低通量測序(每個細(xì)胞月8700個讀數(shù)),。在測序數(shù)據(jù)中檢測到1109個細(xì)胞的上樣條件下,每個細(xì)胞中,,來自每個細(xì)胞的平均99.4%的分子經(jīng)檢測為人或小鼠,,這表明微孔之間的串?dāng)_非常小,在測序數(shù)據(jù)中檢測到1000個或更少細(xì)胞的上樣密度下,,多重態(tài)發(fā)生率接近零,,并且在15000個細(xì)胞下小于5%。長沙BD VDJ單細(xì)胞實驗服務(wù)助力探索生命時空多維度的動態(tài)變化的生物學(xué)信息,;助力醫(yī)療健康時代,!
BD Rhapsody單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序是利用單細(xì)胞水平上的高通量測序分析基因表達(dá)譜的技術(shù),突破傳統(tǒng)高通量測序的局限性,,針對多種組織類型的樣本,,采用BD 細(xì)胞懸液制備protocol組織解離后,單個樣本一次上機能捕獲500-10000個細(xì)胞,, 基于每個細(xì)胞分別建庫測序,,獲得單個細(xì)胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)狀態(tài),并鑒定細(xì)胞的類型,,可以在不同樣本間從細(xì)胞類型的組成和豐度角度進(jìn)行比較,,反映細(xì)胞間的異質(zhì)性,,提供足夠靈活的定制測定法以滿足多種實驗需要,并有效縮短實驗是時間和降低測序成本,。
針對單細(xì)胞測序的細(xì)胞數(shù)量判斷環(huán)節(jié):主要是對細(xì)胞數(shù)量,、基因表達(dá)量、測序質(zhì)量進(jìn)行整體描述,。過濾標(biāo)準(zhǔn):由于細(xì)胞破碎后游離RNA會釋放到環(huán)境或孔中,,并且測序中也會存在一些死細(xì)胞,導(dǎo)致數(shù)據(jù)存在background值,。因此,,我們需要設(shè)定一定的標(biāo)準(zhǔn)來過濾掉假細(xì)胞或死細(xì)胞。以10× Genomics為例,,細(xì)胞數(shù)量判斷主要通過分析UMI Counts-Barcode曲線斜率拐點,,當(dāng)存在多個斜率拐點的時候,結(jié)合預(yù)期UMI=500時的細(xì)胞數(shù)量進(jìn)行過濾,。當(dāng)斜率拐點低于UMI=500的時候,,選擇UMI=500作為細(xì)胞的判斷的標(biāo)準(zhǔn);否則,,選擇和預(yù)期細(xì)胞數(shù)量接近的拐點作為細(xì)胞判斷的位置,。這樣我們能夠有效獲得真實的并且在基因數(shù)量上可以分析的數(shù)據(jù)。2019年,,烈冰已助力發(fā)表了采用BD Rahpsody平臺的單細(xì)胞風(fēng)濕類文章,。
相對于Smart-Seq技術(shù)在細(xì)胞數(shù)量上的問題,BD平臺普遍提供的細(xì)胞數(shù)量都在1000-10000不等的測序細(xì)胞量,,特殊研究需求的項目,,可提供上限40000個細(xì)胞的捕獲量(單個樣本)。這個量級的測序細(xì)胞量已經(jīng)可以說能夠完全覆蓋絕大部分組織的Single Cell群體類型,。因此,,對于基于基因表達(dá)進(jìn)行準(zhǔn)確細(xì)胞分型上,無論是從細(xì)胞數(shù)量上來說還是表達(dá)檢測可靠性來說,,都會更實用,。此外針對特殊項目研究,如需要捕獲和分析脆弱的細(xì)胞,,如粒細(xì)胞,、中性粒細(xì)胞、CAR-T細(xì)胞,、干細(xì)胞,、移植瘤細(xì)胞、骨髓瘤細(xì)胞等,,烈冰生BD平臺也有更好的捕獲效能,,滿足您的實際需求,。十二年測序經(jīng)驗,烈冰生物單細(xì)胞多組學(xué)領(lǐng)域的佼佼者,。長春BD VDJ單細(xì)胞測序
烈冰對于一個細(xì)胞群體中的每個細(xì)胞單獨進(jìn)行建庫測序分析,。吉林BD VDJ單細(xì)胞平臺
關(guān)于BD Rhapsody單細(xì)胞平臺的樣本類型和樣本制備 :在上機前需要注意細(xì)胞消化后的細(xì)胞團(tuán)塊,獲得分離良好的細(xì)胞懸液,、且細(xì)胞活力高(>70%),;此外,了解您所研究細(xì)胞的大小范圍也很重要,。細(xì)胞大小通常與細(xì)胞表達(dá)的轉(zhuǎn)錄本數(shù)量有關(guān),。各種尺寸不同的細(xì)胞(一般直徑不大于50μm)均可與我們基因表達(dá)解決方案中使用的BD Rhapsody平臺兼容。一般來說,,細(xì)胞制備方案將根據(jù)組織來源和細(xì)胞類型而變化,。每種組織類型都是獨特的,因此,,必須在開始任何單細(xì)胞實驗之前優(yōu)化樣本制備,,烈冰多年樣本解離消化經(jīng)驗,,累積10+物種,、50+組織的消化protocol,若您的樣本為組織,,且尚未成功將組織樣本消化成單細(xì)胞懸液,,烈冰將盡可能提供技術(shù)及實驗上的幫助。吉林BD VDJ單細(xì)胞平臺
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司位于江月路999號奇亞特中心22幢,,交通便利,,環(huán)境優(yōu)美,是一家服務(wù)型企業(yè),。公司是一家有限責(zé)任公司(自然)企業(yè),,以誠信務(wù)實的創(chuàng)業(yè)精神、專業(yè)的管理團(tuán)隊,、踏實的職工隊伍,,努力為廣大用戶提供***的產(chǎn)品。公司擁有專業(yè)的技術(shù)團(tuán)隊,,具有單細(xì)胞測序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,空間轉(zhuǎn)錄組測序,,單細(xì)胞多組學(xué)測序等多項業(yè)務(wù),。烈冰生物順應(yīng)時代發(fā)展和市場需求,通過**技術(shù),,力圖保證高規(guī)格高質(zhì)量的單細(xì)胞測序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,,空間轉(zhuǎn)錄組測序,單細(xì)胞多組學(xué)測序,。