單細(xì)胞測序方法不但改進(jìn)了實(shí)驗(yàn)過程,,還幫助科學(xué)家在健康和疾病研究的關(guān)鍵領(lǐng)域取得新進(jìn)展。那些過去從轉(zhuǎn)錄平均值或單項(xiàng)參數(shù)讀取中無法獲得的新發(fā)現(xiàn)正在改變我們對傳染病,、神經(jīng)退行性疾病等疾病的認(rèn)識,。從鑒定新的細(xì)胞類型和狀態(tài),,到揭開疾病用藥應(yīng)答和耐藥的潛在機(jī)制,,單細(xì)胞測序正在推動突破性的研究,,有望改變生物學(xué)和醫(yī)療。無論是無法解釋的疾病,,還是人體或自然界中尚未探索的系統(tǒng),,曾經(jīng)模糊的東西正變得越來越清晰。隨著我們邁向科學(xué)的未來,,我們手頭的工具就像伽利略的望遠(yuǎn)鏡一樣能夠提高焦距和放大倍數(shù),而定義科學(xué)未來的知識新深度是十年前的人們所無法想象的,。ATCG堿基的排列組合構(gòu)成了測序的龐大世界,。BD單細(xì)胞多組學(xué)測序
烈冰生物在上海、北京,、廣州,、西安、江西等多地部署單細(xì)胞測序?qū)嶒?yàn)組中心,,多地部署搭建BD Rhapsody單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺,,基于微孔的強(qiáng)大的高通量單細(xì)胞分析系統(tǒng),為您提供可靠的單細(xì)胞分析工作流程,,該系統(tǒng)可通過簡單的唯恐把工作流程和多重條碼標(biāo)記系統(tǒng),,對高通量單細(xì)胞進(jìn)行多組學(xué)的信息捕獲,由此捕獲的信息科進(jìn)一步生成各種類型的二代測序(NGS)文庫,。之后對文庫進(jìn)行測序和基于NovelBrain生物大數(shù)據(jù)分析平臺(云平臺)的數(shù)據(jù)可視化分析,,實(shí)現(xiàn)高位分辨率下的組織內(nèi)基因的表達(dá)差異和表達(dá)豐度。吉林BD單細(xì)胞多組學(xué)測序單個(gè)細(xì)胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)狀態(tài),,并鑒定細(xì)胞的類型,。
科研的魅力之處,,在于無窮盡的探尋生命的本底,通過單細(xì)胞測序,,我們對組織的分子基礎(chǔ)的研究也從初級到深層,,并在單細(xì)胞層面逐漸達(dá)成一致,那么不禁要問一句,,組織的空間位置到底重不重要,?空間異質(zhì)性是功能的關(guān)鍵特征,細(xì)胞的位置信息更能反應(yīng)細(xì)胞命運(yùn)調(diào)控機(jī)制和細(xì)胞譜系發(fā)生過程,。因此時(shí)間和空間即像組織的AB面,,而不可否認(rèn)的是,此時(shí)空間坐標(biāo)的記錄,,像一個(gè)還未長大的娃娃,,雖未觸及分子基礎(chǔ)研究的深層,但仍在努力攀登探尋生命本底的下一個(gè)高峰,。
機(jī)體為響應(yīng)各種應(yīng)激,,其細(xì)胞會從一種功能“狀態(tài)”轉(zhuǎn)變?yōu)榱硪环N功能“狀態(tài)”;當(dāng)細(xì)胞在不同狀態(tài)之間轉(zhuǎn)變時(shí),,往往會經(jīng)歷轉(zhuǎn)錄重組,,導(dǎo)致一些基因被沉默,一些基因被重新“喚醒”,,但純化這些瞬態(tài)細(xì)胞進(jìn)行研究是很困難或不可能的,;scRNA-seq擬時(shí)序分析可以讓我們在不需要純化的情況下查看這些細(xì)胞狀態(tài)。擬時(shí)序分析,,即根據(jù)不同細(xì)胞亞群基因表達(dá)量隨時(shí)間的變化情況,,構(gòu)建細(xì)胞譜系發(fā)育,但這里的時(shí)間并不是真時(shí)間,,而是一個(gè)虛擬的時(shí)間,,是指的細(xì)胞與細(xì)胞之間的轉(zhuǎn)化和演替的順序和軌跡。即使在同一個(gè)樣本中,,也會存在多種不同的細(xì)胞形態(tài),。因此,不論測定了多少樣本,,我們都可以采用擬時(shí)序分析對樣本中的細(xì)胞轉(zhuǎn)化和變化進(jìn)行描述,。基于磁珠Barcode和UMI及polyT的探針結(jié)構(gòu),,精細(xì)區(qū)分上萬個(gè)細(xì)胞中mRNA的來源及表達(dá)豐度,。
根據(jù)烈冰多年單細(xì)胞測序服務(wù)經(jīng)驗(yàn),為什么不建議您一味的追求高細(xì)胞數(shù)量的捕獲:單細(xì)胞測序所有的分析都是基于細(xì)胞聚類進(jìn)行,而細(xì)胞聚類是在區(qū)分cell和non-cell后,,獲得細(xì)胞基因表達(dá)譜,,通過降維(pca),無監(jiān)督聚類以及可視化(t-SNE)得到的,。進(jìn)行細(xì)胞聚類時(shí)需要考慮到每個(gè)細(xì)胞的基因表達(dá)模式,,因此即使是相同的數(shù)據(jù),在剔除幾個(gè)細(xì)胞的情況下,,前后獲得的聚類圖也會出現(xiàn)明顯不同,。而當(dāng)細(xì)胞捕獲數(shù)過多時(shí),無論是假陰性和假陽性數(shù)據(jù)還是多細(xì)胞數(shù)據(jù),,都會對正常細(xì)胞聚類產(chǎn)生影響,,造成聚類結(jié)果失真。這也是很多文章,,特別是很多高分文章,,為什么單個(gè)樣本捕獲細(xì)胞數(shù)在2000-3000的原因了。烈冰建議單個(gè)樣本捕獲細(xì)胞數(shù)在3000-5000個(gè)時(shí),,數(shù)據(jù)量在100G左右時(shí),,可以滿足分析和文章發(fā)表的多重需求。烈冰生物全國五大實(shí)驗(yàn)中心,,多地部署B(yǎng)D Rahpsody平臺,,助您的樣本更快速抵達(dá)“戰(zhàn)場”。BD Rhapsody單細(xì)胞
單細(xì)胞測序技術(shù)遍地開花,,烈冰BD 單細(xì)胞測序服務(wù)讓您的醫(yī)學(xué)研究如虎添翼,。BD單細(xì)胞多組學(xué)測序
據(jù)不完全統(tǒng)計(jì),截至2022年6月,,烈冰生物助力發(fā)表單細(xì)胞文章近40篇,,從平臺應(yīng)用比例來看,應(yīng)用10X Genomics和BD Rhapsody兩大平臺發(fā)文比例各占50%左右,,研究類型涵蓋疾病發(fā)展,靶點(diǎn)探索,,免疫研究,,神經(jīng)發(fā)育,干細(xì)胞分化,,植物發(fā)育,,退行病變,糖尿病,,COVID-19等等研究,;從發(fā)表期刊水平來看,烈冰生物聯(lián)合發(fā)表的單細(xì)胞文章,CNS一區(qū)期刊占比在30%以上,,其中包括immunity三篇,,Nature子刊3篇(Nature cell biology,Nature Plants,Nature communication),風(fēng)濕類領(lǐng)域ARD期刊1篇,,CUT 1篇,,Advanced Science多篇,IF大于10分以上文章占比高達(dá)68.5%,,烈冰專屬單細(xì)胞測序服務(wù)團(tuán)隊(duì),,將與您攜手譜寫下一篇“高分”新文章。BD單細(xì)胞多組學(xué)測序
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司致力于醫(yī)藥健康,,是一家服務(wù)型的公司,。公司業(yè)務(wù)涵蓋單細(xì)胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,,空間轉(zhuǎn)錄組測序,,單細(xì)胞多組學(xué)測序等,價(jià)格合理,,品質(zhì)有保證,。公司秉持誠信為本的經(jīng)營理念,在醫(yī)藥健康深耕多年,,以技術(shù)為先導(dǎo),,以自主產(chǎn)品為重點(diǎn),發(fā)揮人才優(yōu)勢,,打造醫(yī)藥健康良好品牌,。在社會各界的鼎力支持下,持續(xù)創(chuàng)新,,不斷鑄造***服務(wù)體驗(yàn),,為客戶成功提供堅(jiān)實(shí)有力的支持。