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湖北BD VDJ單細(xì)胞多組學(xué)測序

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-07-24

根據(jù)烈冰多年單細(xì)胞測序服務(wù)經(jīng)驗(yàn),,為什么不建議您一味的追求高細(xì)胞數(shù)量的捕獲:單細(xì)胞測序所有的分析都是基于細(xì)胞聚類進(jìn)行,,而細(xì)胞聚類是在區(qū)分cell和non-cell后,獲得細(xì)胞基因表達(dá)譜,,通過降維(pca),,無監(jiān)督聚類以及可視化(t-SNE)得到的,。進(jìn)行細(xì)胞聚類時(shí)需要考慮到每個(gè)細(xì)胞的基因表達(dá)模式,因此即使是相同的數(shù)據(jù),,在剔除幾個(gè)細(xì)胞的情況下,,前后獲得的聚類圖也會(huì)出現(xiàn)明顯不同。而當(dāng)細(xì)胞捕獲數(shù)過多時(shí),,無論是假陰性和假陽性數(shù)據(jù)還是多細(xì)胞數(shù)據(jù),,都會(huì)對(duì)正常細(xì)胞聚類產(chǎn)生影響,,造成聚類結(jié)果失真。這也是很多文章,,特別是很多高分文章,,為什么單個(gè)樣本捕獲細(xì)胞數(shù)在2000-3000的原因了。烈冰建議單個(gè)樣本捕獲細(xì)胞數(shù)在3000-5000個(gè)時(shí),,數(shù)據(jù)量在100G左右時(shí),,可以滿足分析和文章發(fā)表的多重需求?;凇办o態(tài)蜂巢”技術(shù),,實(shí)現(xiàn)落孔細(xì)胞的物力分割和磁珠的一對(duì)一匹配。湖北BD VDJ單細(xì)胞多組學(xué)測序

針對(duì)BD Rhapsody單細(xì)胞捕獲平臺(tái),,烈冰生物提供專業(yè)的優(yōu)化試劑和專業(yè)知識(shí):BD Rhapsody試劑是轉(zhuǎn)為 Rhapsody 系統(tǒng)設(shè)計(jì),,旦性能已得到驗(yàn)證的產(chǎn)品,因此研究人員可以專注于解決生物學(xué)問題,,而不必花費(fèi)時(shí)間應(yīng)對(duì)多組學(xué)分析的技術(shù)障礙,。此外,我們還提基于BD平臺(tái)的單細(xì)胞多組學(xué)服務(wù),,如Ab-Seq檢測試劑盒使用的抗體已在流式細(xì)胞分析中得到充分研究,,這使得研究人員能夠建立真值并迅速加深對(duì)生物學(xué)系統(tǒng)的理解。作為BD中國單細(xì)胞聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室的合作伙伴,,我們將繼續(xù)擴(kuò)展檢測試劑盒和試劑產(chǎn)品組合的范圍,,以支持前沿多組學(xué)分析。我們經(jīng)驗(yàn)豐富的專業(yè)客戶服務(wù)團(tuán)隊(duì)可在多組學(xué)分析的各個(gè)方面為您提供幫助,。合肥BD單細(xì)胞服務(wù)機(jī)構(gòu)單細(xì)胞測序技術(shù)的迅速發(fā)展和應(yīng)用推廣,,為從多維度揭示疾病發(fā)展提供了強(qiáng)有力的工具。

單細(xì)胞測序技術(shù)(Single Cell Sequencing)從一種新興的研究角度,,借助已有的高通量測序手段,,幫助研究者在樣本中細(xì)胞的異質(zhì)性、免疫微環(huán)境,、發(fā)育學(xué),、免疫學(xué)以及其他領(lǐng)域中進(jìn)行單細(xì)胞層面的數(shù)據(jù)解析,解決了Bulk Population Sequencing所無法解決的問題,。這樣一個(gè)新的研究領(lǐng)域必然也需要足夠可靠的實(shí)驗(yàn)手段來支撐,。BD Rhapsody單細(xì)胞分選系統(tǒng)為此提供了完善的硬件設(shè)備,保證了從單細(xì)胞懸液質(zhì)量評(píng)估到單細(xì)胞分選標(biāo)記過程中每一個(gè)實(shí)驗(yàn)步驟的準(zhǔn)確質(zhì)控,。NovelBio單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)團(tuán)隊(duì)借助BD Rhapsody單細(xì)胞分選系統(tǒng),,在實(shí)驗(yàn)實(shí)施層面對(duì)單細(xì)胞測序結(jié)果的可靠性提供了強(qiáng)有力的保證。繼單細(xì)胞懸液制備之后,,又在另一道關(guān)鍵關(guān)卡提供了可靠的支持,,幫助研究者在單細(xì)胞測序領(lǐng)域收獲更多的成果,。

據(jù)不完全統(tǒng)計(jì),截至2022年6月,,烈冰生物助力發(fā)表單細(xì)胞文章近40篇,,從平臺(tái)應(yīng)用比例來看,應(yīng)用10X Genomics和BD Rhapsody兩大平臺(tái)發(fā)文比例各占50%左右,,研究類型涵蓋疾病發(fā)展,,靶點(diǎn)探索,免疫研究,,神經(jīng)發(fā)育,,干細(xì)胞分化,植物發(fā)育,,退行病變,,糖尿病,COVID-19等等研究,;從發(fā)表期刊水平來看,,烈冰生物聯(lián)合發(fā)表的單細(xì)胞文章,,CNS一區(qū)期刊占比在30%以上,,其中包括immunity三篇,Nature子刊3篇(Nature cell biology,Nature Plants,,Nature communication),風(fēng)濕類領(lǐng)域ARD期刊1篇,,CUT 1篇,Advanced Science多篇,,IF大于10分以上文章占比高達(dá)68.5%,,烈冰專屬單細(xì)胞測序服務(wù)團(tuán)隊(duì),將與您攜手譜寫下一篇“高分”新文章,。單細(xì)胞測序平臺(tái),,烈冰提供高性價(jià)比服務(wù)方案。

現(xiàn)有的單細(xì)胞測序技術(shù)陣營在幾個(gè)主要領(lǐng)域存在差別,。一個(gè)是基于微流控通道的細(xì)胞與Beads的在通道內(nèi)的動(dòng)態(tài)結(jié)合,,通過油相水相不相容的特點(diǎn)將結(jié)合了的細(xì)胞和Beads進(jìn)行分隔,在這個(gè)空間,,單個(gè)細(xì)胞的內(nèi)容物釋放,,轉(zhuǎn)錄本或其他生物分析物被標(biāo)記或添加索引,以便下游識(shí)別,。BD Rhapsody單細(xì)胞測序平臺(tái)采用靜態(tài)微孔技術(shù)(Cyto-Seq具有類似的技術(shù)原理),。通過微孔板的物理分隔,將一個(gè)個(gè)單個(gè)細(xì)胞和帶有標(biāo)簽的磁珠,,一對(duì)一的“框”在微反應(yīng)的物理平臺(tái)中,。這樣,,每一個(gè)細(xì)胞都會(huì)結(jié)合一個(gè)磁珠,那么在每一個(gè)磁珠中上長滿了不同的Cell Barcode和UMI Barcode連接形成的序列,,再加上一端PolyT的抓手,,這個(gè)抓手就會(huì)使用oligo dT抓住mRNA構(gòu)建文庫。烈冰測序服務(wù)已助力300余篇國際期刊研究文章發(fā)表,。杭州single cell 單細(xì)胞測序服務(wù)公司

附加流式分選細(xì)胞表面Marker,,對(duì)于較低分辨率的標(biāo)志物也能有效鑒定,助力高要求測序項(xiàng)目,。湖北BD VDJ單細(xì)胞多組學(xué)測序

關(guān)于單細(xì)胞測序?qū)嶒?yàn)樣本制備,,這與流式細(xì)胞術(shù)用戶熟悉的步驟完全一致,也就是通過酶促或機(jī)械消化,、細(xì)胞分選或其他細(xì)胞分離技術(shù)從整個(gè)樣本中制備生成活的單細(xì)胞懸液,。隨后是細(xì)胞計(jì)數(shù)和質(zhì)量控制步驟,以確保您的樣本有適當(dāng)濃度的活細(xì)胞,,并且不含細(xì)胞團(tuán)塊和死細(xì)胞碎片,。如有必要,您還可以使用抗體對(duì)樣本進(jìn)行染色,,標(biāo)記細(xì)胞表面蛋白或其他生物分析物,,或者通過FACS來富集感興趣的細(xì)胞類型。解離樣本時(shí)采取的具體步驟將根據(jù)您的起始材料和實(shí)驗(yàn)?zāi)繕?biāo)而定,。也許需要額外的制備步驟,,具體取決于組織質(zhì)量、樣本豐度,、細(xì)胞大小,,以及是否需要提取出細(xì)胞核進(jìn)行染色質(zhì)可接近性分析。無論具體的考慮因素如何,,所有樣本類型都遵循同一個(gè)基本原則,,那就是生成高質(zhì)量的單細(xì)胞懸液。湖北BD VDJ單細(xì)胞多組學(xué)測序

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司坐落在江月路999號(hào)奇亞特中心22幢,,是一家專業(yè)的生物科技,、醫(yī)藥科技、信息科技,、計(jì)算機(jī)科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā),、技術(shù)服務(wù)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓,、技術(shù)咨詢,,市場營銷策劃,市場信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會(huì)調(diào)查,、社會(huì)調(diào)研,、民意調(diào)查,、民意測驗(yàn)),從事貨物及技術(shù)的進(jìn)出口業(yè)務(wù),,計(jì)算機(jī),、軟件及耗材(除專控),,軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,,經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營活動(dòng)】公司。一批專業(yè)的技術(shù)團(tuán)隊(duì),,是實(shí)現(xiàn)企業(yè)戰(zhàn)略目標(biāo)的基礎(chǔ),,是企業(yè)持續(xù)發(fā)展的動(dòng)力。公司以誠信為本,,業(yè)務(wù)領(lǐng)域涵蓋單細(xì)胞測序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),空間轉(zhuǎn)錄組測序,,單細(xì)胞多組學(xué)測序,,我們本著對(duì)客戶負(fù)責(zé),對(duì)員工負(fù)責(zé),,更是對(duì)公司發(fā)展負(fù)責(zé)的態(tài)度,,爭取做到讓每位客戶滿意。一直以來公司堅(jiān)持以客戶為中心,、單細(xì)胞測序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),,空間轉(zhuǎn)錄組測序,,單細(xì)胞多組學(xué)測序市場為導(dǎo)向,重信譽(yù),,保質(zhì)量,,想客戶之所想,急用戶之所急,,全力以赴滿足客戶的一切需要,。