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烈冰生物單細胞轉(zhuǎn)錄組測序

來源: 發(fā)布時間:2022-07-25

單細胞測序?qū)嶒炘贅颖炯毎蠙C分選簽,,需要對細胞數(shù)量,、細胞活性進準判斷,這對Single Cell分選標記,、建庫,、下機數(shù)據(jù)的質(zhì)量都具有著決定性的作用。如若細胞計數(shù)偏高,,將會影響建庫的成功率,;計數(shù)偏低,則會提高雙細胞的比例,;而細胞活率過低,,就會使測序數(shù)據(jù)的利用率大打折扣,因此把好單細胞懸液質(zhì)量這一關(guān)尤為重要,。而在鋪板過程中,,由于不同操作人員手法具有不可避免的差異,不同的液體流速將直接影響單細胞的入孔效果,。因此烈冰生物BD Rhapsody單細胞分選平臺配套了專門定制的電動移液器,,其具有Prime Treat、Cell Load,、Bead Load,、Wash、Lysis、Retrieval多種操作模式,,來對應(yīng)各種不同的操作,。通過已經(jīng)設(shè)定的程序來控制液體的流速,大幅度降低人為操作習(xí)慣帶來的差異,,保證實驗操作的一致性,。烈冰對于一個細胞群體中的每個細胞單獨進行建庫測序分析。烈冰生物單細胞轉(zhuǎn)錄組測序

烈冰生信團隊傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺,,針對龐大的單細胞測序數(shù)據(jù),,能夠?qū)崿F(xiàn)細胞類型鑒定的快、精,、準:一鍵導(dǎo)入gene list構(gòu)建個性化基因列表,;輕松一點即可展示Marker基因的Feature plot;任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細胞類型,;一鍵獲得t-SNE圖,、Heatmap和Violin圖:輕松獲得并下載基因表達的t-SNE圖、Heatmap,、Violin圖,,還可以通過調(diào)節(jié)寬、高和系數(shù)比例來調(diào)節(jié)美觀,。平臺上線300+task自主分析工具,、50+pipeline工作流模板,幫助烈冰生信分析團隊和自主分析用戶實現(xiàn)分析工具和模板的快速調(diào)用和一站式全流程自動化分析,,節(jié)省工作時間并提升整體工作效率,。青島single cell RNA單細胞服務(wù)機構(gòu)單細胞測序是高通量測序下的又一重大技術(shù)突破。

針對單細胞測序數(shù)據(jù)分析時的reads數(shù),、基因表達量及細胞數(shù)量判定過程中:以捕獲5000個細胞,、100G的測序量為標準,每個細胞的reads數(shù)大約在50k左右,;每個細胞的基因中位數(shù)取決于樣本的細胞類型,,例如成熟的B,T,,粒細胞數(shù)量較多的組織中,,由于該類型細胞表達的基因數(shù)普遍較少,導(dǎo)致基因中位數(shù)下降,。而某些疾病組織,、或者體外培養(yǎng)的如干細胞等,他們的基因表達數(shù)較高,,甚至可以超過1W,,這就導(dǎo)致該類樣本基因中位數(shù)非常高。因此,我們對細胞數(shù)量以及基因中位數(shù)確認時,,需要考察實際組織的細胞組成,。

烈冰科技自主研發(fā)的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,,深入挖掘其背后的生物學(xué)意義;從操作便捷,、結(jié)果可視化,、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細胞研究,,加速科研進程,!此外,烈冰生信團隊根據(jù)豐富的實戰(zhàn)經(jīng)驗為用戶量身打造了一款單細胞測序結(jié)果解讀的神兵利器——單細胞瀏覽器(Single Cell Browser),,不但可以將海量復(fù)雜的結(jié)果文件可視化,,還是可以實現(xiàn)三維立體化展示的軟件。專業(yè)的生信代碼交給專業(yè)的烈冰,,專業(yè)的生物學(xué)意義交給專業(yè)的您,!對于消化背景雜,樣本初始數(shù)量少,,關(guān)注粒細胞的項目,,推薦您使用烈冰BD 單細胞測序平臺。

現(xiàn)有的單細胞測序技術(shù)陣營在幾個主要領(lǐng)域存在差別,。一個是基于微流控通道的細胞與Beads的在通道內(nèi)的動態(tài)結(jié)合,,通過油相水相不相容的特點將結(jié)合了的細胞和Beads進行分隔,在這個空間,,單個細胞的內(nèi)容物釋放,,轉(zhuǎn)錄本或其他生物分析物被標記或添加索引,以便下游識別,。BD Rhapsody單細胞測序平臺采用靜態(tài)微孔技術(shù)(Cyto-Seq具有類似的技術(shù)原理),。通過微孔板的物理分隔,將一個個單個細胞和帶有標簽的磁珠,,一對一的“框”在微反應(yīng)的物理平臺中,。這樣,每一個細胞都會結(jié)合一個磁珠,,那么在每一個磁珠中上長滿了不同的Cell Barcode和UMI Barcode連接形成的序列,,再加上一端PolyT的抓手,這個抓手就會使用oligo dT抓住mRNA構(gòu)建文庫,。搭配BD FACSMelody流式分選儀,,全線搭建BD Rahpsody單細胞測序平臺。云南BD單細胞多組學(xué)測序

單細胞測序因其強大的探究疾病--細胞--基因的關(guān)系,一度成為高通量測序技術(shù)的“天花板”,。烈冰生物單細胞轉(zhuǎn)錄組測序

在政策促進下,,未來3—5年內(nèi),我國將在醫(yī)藥健康短缺地區(qū)建設(shè)一批高水平臨床醫(yī)治中心,、高層次的人才 培養(yǎng)基地和高水平的科研創(chuàng)新與轉(zhuǎn)化平臺,,培育一批品牌優(yōu)勢明顯、跨區(qū)域提供高水平服務(wù)的集團,。打造一批以為依托的“互聯(lián)網(wǎng)+醫(yī)藥健康”協(xié)作平臺,。這定將給相關(guān)企業(yè),帶來非常大的發(fā)展機遇,。2019年醫(yī)藥健康新政頻出,,無論是醫(yī)藥研發(fā)企業(yè)還是生產(chǎn)企業(yè),都面臨了很多挑戰(zhàn),。隨著2020年離我們已經(jīng)越來越近,,遵循政策導(dǎo)向,調(diào)整企業(yè)布局將成為未來企業(yè)戰(zhàn)略布局的重中之重,。隨著我國醫(yī)藥健康深入推進,、“兩票制”進一步推行,以及各項行業(yè)政策的出臺,,使得我國冷鏈物流市場規(guī)模不斷擴大,。對于冷鏈物流行業(yè)而言,“十三五”規(guī)劃時期是冷鏈物流調(diào)整和發(fā)展的關(guān)鍵時期,。隨著西方健康服務(wù)理念的進入及國內(nèi)需求市場的飛速增長,,國內(nèi)以體檢為重點的有限責(zé)任公司(自然)得到了飛速發(fā)展,尤其是近年來,,健康服務(wù)機構(gòu)飛速發(fā)展,。盡管中國老年健康服務(wù)目前仍處于初始發(fā)展階段,但近年來我國出臺了一些扶持政策,,市場空間逐漸打開,。烈冰生物單細胞轉(zhuǎn)錄組測序

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司發(fā)展規(guī)模團隊不斷壯大,現(xiàn)有一支專業(yè)技術(shù)團隊,,各種專業(yè)設(shè)備齊全,。專業(yè)的團隊大多數(shù)員工都有多年工作經(jīng)驗,熟悉行業(yè)專業(yè)知識技能,,致力于發(fā)展NovelBio,烈冰生物,NovelBrain,PanoCell,烈冰智造的品牌,。公司以用心服務(wù)為重點價值,希望通過我們的專業(yè)水平和不懈努力,,將生物科技,、醫(yī)藥科技,、信息科技、計算機科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā),、技術(shù)服務(wù),、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢,,市場營銷策劃,,市場信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會調(diào)查、社會調(diào)研,、民意調(diào)查,、民意測驗),從事貨物及技術(shù)的進出口業(yè)務(wù),,計算機、軟件及耗材(除??兀?,軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準的項目,經(jīng)相關(guān)部門批準后方可開展經(jīng)營活動】等業(yè)務(wù)進行到底,。烈冰生物始終以質(zhì)量為發(fā)展,,把顧客的滿意作為公司發(fā)展的動力,,致力于為顧客帶來***的單細胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,,空間轉(zhuǎn)錄組測序,單細胞多組學(xué)測序,。