現(xiàn)有的單細胞測序技術陣營在幾個主要領域存在差別。一個是基于微流控通道的細胞與Beads的在通道內(nèi)的動態(tài)結合,,通過油相水相不相容的特點將結合了的細胞和Beads進行分隔,,在這個空間,單個細胞的內(nèi)容物釋放,,轉錄本或其他生物分析物被標記或添加索引,以便下游識別,。BD Rhapsody單細胞測序平臺采用靜態(tài)微孔技術(Cyto-Seq具有類似的技術原理),。通過微孔板的物理分隔,將一個個單個細胞和帶有標簽的磁珠,,一對一的“框”在微反應的物理平臺中,。這樣,每一個細胞都會結合一個磁珠,,那么在每一個磁珠中上長滿了不同的Cell Barcode和UMI Barcode連接形成的序列,,再加上一端PolyT的抓手,這個抓手就會使用oligo dT抓住mRNA構建文庫,?;诖胖锽arcode和UMI及polyT的探針結構,精細區(qū)分上萬個細胞中mRNA的來源及表達豐度,。蘇州BD Rhapsody單細胞測序服務
烈冰生物BD Rhapsody單細胞分析系統(tǒng),,可平行分析成千上萬個單細胞內(nèi)數(shù)千個基因的表達水平,單細胞RNA-seq正在改變我們對細胞的理解,。而烈冰作為多平臺的技術服務提供商,,基于BD 在生物學領域40年的專業(yè)技術,滿足您的實驗需求,,在單細胞水平理解細胞形態(tài)和功能,。BD單細胞測序分析系統(tǒng)克服了傳統(tǒng)檢測的局限性,如微陣列和大量細胞RNA-seq,,這些技術檢測通過實現(xiàn)對各個細胞之間的微妙差異的觀察,,依賴于對多個細胞的平行檢測。用戶可以鑒定和表征新型和罕見細胞類型,,其進一步幫助理解從免疫學到疾病發(fā)展的多個領域內(nèi)的生物學過程,。上海BD單細胞平臺深度的單細胞測序數(shù)據(jù)解讀助力醫(yī)療健康大時代。
對于稀有樣本,,或細胞量比較少的稀有組織,,樣本中每一粒細胞都很珍貴,,BD Rhapsody單細胞捕獲平臺對該種類型的樣本能實現(xiàn)友好包容,如果在實際實驗中,,我們發(fā)現(xiàn)因為樣本類型和制備單細胞懸液方法的不同,,容易出現(xiàn)單細胞懸液中死亡細胞的比例較高的情況。也會和您探討是否考慮去除單細胞懸液中的死細胞和其他污染物的操作,,以獲得高質量數(shù)據(jù)是至關重要的,。這是因為,死亡的細胞易裂解導致其中的RNA釋放出來,。這種cell-free RNA會導致檢測的背景噪聲,,并會影響單細胞數(shù)據(jù)的質量。因此當樣本活性較差時,,對細胞懸液中細胞活性檢測后,,需要進行一般死細胞去除的工作(一般懸液活性小于70%時考慮此操作),以保證較高的上機捕獲細胞的質量,。
多樣本數(shù)據(jù)合并:Fraction of Reads Kept:合并樣本時,,各樣本根據(jù)Mapped Barcoded Reads per Cell數(shù)量計算出來的數(shù)據(jù)利用率。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大,,需要進行Downsample處理,,以數(shù)據(jù)量少的樣本為基準將不同樣本中細胞測序深度標化到同一水平,從而避免因測序深度差異導致的基因檢測數(shù)量,、基因表達水平的差異,。烈冰科技自主研發(fā)的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),深度解讀數(shù)據(jù)分析結果,,深入挖掘其背后的生物學意義,;從操作便捷、結果可視化,、分析可追溯,、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細胞研究,加速科研進程,!附加流式分選細胞表面Marker,,對于較低分辨率的標志物也能有效鑒定,助力高要求測序項目,。
單細胞測序結果動輒上百G數(shù)據(jù)量,,龐大的數(shù)據(jù)對于分析平臺和分析能力有著很高的要求,首先針對下機數(shù)據(jù)的質控環(huán)節(jié):單細胞測序產(chǎn)生數(shù)億的結果序列,,不可避免的會出現(xiàn)低質量的測序結果,,存在各種情況的序列污染。因此序列過濾及質量評估就會變得極為重要。序列質量主要通過測序質量值Q20/Q30的占比來表征,,即堿基測序結果的錯誤率在1% / 0.1%以下的比例,。理想的測序結果reads的堿基質量均高于30。保證數(shù)據(jù)獲得后的處理結果的準確性,,為后續(xù)細胞類型鑒定和功能分析打下堅實基礎,。基于“靜態(tài)蜂巢”技術,,實現(xiàn)落孔細胞的物力分割和磁珠的一對一匹配,。無錫BD VDJ單細胞測序
助力探索生命時空多維度的動態(tài)變化的生物學信息;助力醫(yī)療健康時代,!蘇州BD Rhapsody單細胞測序服務
烈冰科技作為國內(nèi)率先同時擁有10X Genomics和BD Rhapsody雙分選平臺的測序服務商及云計算服務供應商,,經(jīng)過多年實戰(zhàn),擁有豐富的單細胞懸液制備和分選經(jīng)驗,,實測BD Rhapsody對能夠高效捕獲粒細胞,。針對不同的分選平臺、建庫方法,,實戰(zhàn)總結搭建出不同的數(shù)據(jù)預處理工作流程;烈冰科技NovelBrain?生物大數(shù)據(jù)平臺能有效支撐生命科學研究,、醫(yī)療健康等領域對大數(shù)據(jù)分析的需求,。高通量測序實驗平臺,包括NovaSeq 6000,、10X Chromium X,、BD FACSMelody、PANNORAMIC數(shù)字切片掃描儀等,,配合一支來自海內(nèi)外名校,、多學科交叉型的高素質綜合團隊,為您的科學研究保駕護航,。蘇州BD Rhapsody單細胞測序服務
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司總部位于江月路999號奇亞特中心22幢,,是一家生物科技、醫(yī)藥科技,、信息科技,、計算機科技領域內(nèi)的技術開發(fā)、技術服務,、技術轉讓,、技術咨詢,市場營銷策劃,,市場信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會調(diào)查,、社會調(diào)研、民意調(diào)查、民意測驗),,從事貨物及技術的進出口業(yè)務,,計算機、軟件及耗材(除??兀?,軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準的項目,經(jīng)相關部門批準后方可開展經(jīng)營活動】的公司,。烈冰生物擁有一支經(jīng)驗豐富,、技術創(chuàng)新的專業(yè)研發(fā)團隊,以高度的專注和執(zhí)著為客戶提供單細胞測序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,,空間轉錄組測序,單細胞多組學測序,。烈冰生物不斷開拓創(chuàng)新,,追求出色,以技術為先導,,以產(chǎn)品為平臺,,以應用為重點,以服務為保證,,不斷為客戶創(chuàng)造更高價值,,提供更優(yōu)服務。烈冰生物始終關注醫(yī)藥健康行業(yè),。滿足市場需求,,提高產(chǎn)品價值,是我們前行的力量,。