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北京BD Rhapsody空間轉(zhuǎn)錄組多組學(xué)測序

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-08-10

機(jī)體為響應(yīng)各種應(yīng)激,其細(xì)胞會從一種功能“狀態(tài)”轉(zhuǎn)變?yōu)榱硪环N功能“狀態(tài)”,;當(dāng)細(xì)胞在不同狀態(tài)之間轉(zhuǎn)變時(shí),,往往會經(jīng)歷轉(zhuǎn)錄重組,導(dǎo)致一些基因被“沉默”,,一些基因被重新“喚醒”,,但純化這些瞬態(tài)細(xì)胞進(jìn)行研究是很困難或不可能的;scRNA-seq擬時(shí)序分析可以讓我們在不需要純化的情況下查看這些細(xì)胞狀態(tài),。擬時(shí)序分析,,即根據(jù)不同細(xì)胞亞群基因表達(dá)量隨時(shí)間的變化情況,構(gòu)建細(xì)胞譜系發(fā)育,,但這里的時(shí)間并不是真時(shí)間,,而是一個虛擬的時(shí)間,是指的細(xì)胞與細(xì)胞之間的轉(zhuǎn)化和演替的順序和軌跡,。即使在同一個樣本中,也會存在多種不同的細(xì)胞形態(tài)。因此,,不論測定了多少樣本,,我們都可以采用擬時(shí)序分析對樣本中的細(xì)胞轉(zhuǎn)化和變化進(jìn)行描述。烈冰全線實(shí)驗(yàn)平臺滿足超深度,、大規(guī)模發(fā)現(xiàn)和復(fù)雜疾病研究的測序,。北京BD Rhapsody空間轉(zhuǎn)錄組多組學(xué)測序

烈冰生物真正實(shí)現(xiàn)空間轉(zhuǎn)錄組測序的全程把控,做到從實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì),、空間信息標(biāo)記,、建庫測序、定制化分析的全流程一站式服務(wù),,助力高分文章發(fā)表,;專業(yè)實(shí)驗(yàn)團(tuán)隊(duì)保證樣本的高度一致性;專業(yè)的生物學(xué)團(tuán)隊(duì)提供個性化的產(chǎn)品應(yīng)用場景解讀,、保持對生物學(xué)意義的關(guān)注,;強(qiáng)大的生信分析團(tuán)隊(duì)一對一地進(jìn)行詳實(shí)科學(xué)的實(shí)驗(yàn)方案設(shè)計(jì)并提供多次售后分析;可接受樣品類別為冰凍組織:新鮮樣本經(jīng)液氮預(yù)冷的異戊烷速凍,,-80℃保存OCT包埋組織:新鮮組織異戊烷速凍后進(jìn)行OCT包埋,,或新鮮組織直接OCT包埋后-80℃速凍,注意標(biāo)明樣本方向,樣本于-80℃保存樣本處理和運(yùn)輸過程需要在低溫環(huán)境蘇州scRNA空間轉(zhuǎn)錄組平臺從樣本處理到終端數(shù)據(jù)分析,,只要您需要,,烈冰提供全流程的無憂服務(wù)。

單細(xì)胞測序技術(shù)是一種在單細(xì)胞水平上對基因組,、轉(zhuǎn)錄組,、表觀組等進(jìn)行高通量測序分析的技術(shù)。單細(xì)胞測序技術(shù)能夠在組學(xué)水平揭示細(xì)胞間的異質(zhì)性,。單細(xì)胞水平細(xì)胞譜系追蹤技術(shù)位居2018年Science 雜志評選的科學(xué)突破,。常規(guī)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)丟失了細(xì)胞在原組織中至關(guān)重要的空間位置信息,而單細(xì)胞空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)在進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序的同時(shí)保留并記錄了細(xì)胞的空間位置信息,??臻g轉(zhuǎn)錄組技術(shù)能夠揭示細(xì)胞間的相互作用以及細(xì)胞所處的微環(huán)境,將成為發(fā)育生物學(xué),、神經(jīng)生物學(xué),、免疫生物學(xué)等領(lǐng)域的研究利器。

空間組學(xué)可以應(yīng)用的方向:1.可以鑒定到疾病的空間位置異質(zhì)性:對于阿爾茨海默癥的研宄可以探索到小神經(jīng)質(zhì)細(xì)胞趨向于阿爾茨海默神經(jīng)班,。 2.建立空間轉(zhuǎn)錄組圖譜構(gòu)建個人空間轉(zhuǎn)錄組圖譜將極大提升科研人員對生物體組織間的細(xì)胞差異,。3、描述胚胎發(fā)育及空間藍(lán)區(qū)胚胎發(fā)育的動態(tài)過程是科研人員一直為之著迷的,,空間組學(xué)發(fā)展可以清晣的描繪胚胎發(fā)育的藍(lán)圖,。除了皮膚,、胰腺和骨頭組織外,其余樣本類型均可開展10xGenomics空間轉(zhuǎn)錄組研究,。10xGenomics公司已經(jīng)測試完畢的組織類型有:人:心勝,、腎勝、卵巢,、乳房,、淋巴結(jié)、大腦,、大腸,、肺、脾臟小鼠:大腦,、眼睛,、心勝、腎勝,、大腸,、肝臟、肺,、卵巢,,四頭肌、小腸,、脾勝,、胃、翠丸,、甲狀腺,、舌頭大鼠:大腦、腎臟,、心臟空間轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)提供了空間轉(zhuǎn)錄組水平下的科學(xué)研究視角,。

多樣本數(shù)據(jù)合并:FractionofReadsKept:合并樣本時(shí),各樣本根據(jù)MappedBarcodedReadsperCell數(shù)量計(jì)算出來的數(shù)據(jù)利用率,。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大,,需要進(jìn)行Downsample處理,以數(shù)據(jù)量少的樣本為基準(zhǔn)將不同樣本中細(xì)胞測序深度標(biāo)化到同一水平,,從而避免因測序深度差異導(dǎo)致的基因檢測數(shù)量,、基因表達(dá)水平的差異。烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),,深入解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,,深入挖掘其背后的生物學(xué)意義;從操作便捷,、結(jié)果可視化,、分析可追溯,、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究,加速科研進(jìn)程,!烈冰引進(jìn)國際主流空間轉(zhuǎn)錄組測序平臺,,提供保留組織內(nèi)部精細(xì)區(qū)域的空間信息的轉(zhuǎn)錄組測序。上海烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)支持

十二年測序經(jīng)驗(yàn),,累計(jì)服務(wù)與5000余項(xiàng)重要科研項(xiàng)目。北京BD Rhapsody空間轉(zhuǎn)錄組多組學(xué)測序

當(dāng)組織冷凍切片附在帶有spatialbarcode的空間轉(zhuǎn)錄組芯片上時(shí),,通過透化處理,,細(xì)胞內(nèi)的mRNA釋放出來,從而被芯片上帶有oligo-dT的探針捕獲,。被捕獲的mRNA開始逆轉(zhuǎn)錄,,得到的cDNA中包含了spatialbarcode序列。通過上機(jī)測序,,可以將每個mRNA轉(zhuǎn)錄的序列映射回組織切片中的映射回組織切片中的原始位置,。Visium空間轉(zhuǎn)錄組的重點(diǎn)在于芯片部分:正式文庫構(gòu)建的芯片上有4個捕獲區(qū)域(6.5mmX6.5mm,可以檢測4個樣本)每個捕獲區(qū)域含有約5000個被條形碼標(biāo)記的點(diǎn)(barcodedspots)每個spot直徑55μm,,每個spot能捕獲1-10個細(xì)胞spot與spot中心點(diǎn)之間的距離為100μm每個spot含有上百萬個可以與mRNA結(jié)合的捕獲探針,,每個探針上都帶有獨(dú)特的spatialbarcodes,用以標(biāo)記捕獲的mRNA的空間位置,。北京BD Rhapsody空間轉(zhuǎn)錄組多組學(xué)測序

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司辦公設(shè)施齊全,,辦公環(huán)境優(yōu)越,為員工打造良好的辦公環(huán)境,。致力于創(chuàng)造***的產(chǎn)品與服務(wù),,以誠信、敬業(yè),、進(jìn)取為宗旨,,以建NovelBio,烈冰生物,NovelBrain,PanoCell,烈冰智造產(chǎn)品為目標(biāo),努力打造成為同行業(yè)中具有影響力的企業(yè),。公司不僅*提供專業(yè)的生物科技,、醫(yī)藥科技、信息科技,、計(jì)算機(jī)科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā),、技術(shù)服務(wù)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓,、技術(shù)咨詢,,市場營銷策劃,市場信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會調(diào)查,、社會調(diào)研,、民意調(diào)查,、民意測驗(yàn)),從事貨物及技術(shù)的進(jìn)出口業(yè)務(wù),,計(jì)算機(jī),、軟件及耗材(除專控),,軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,,經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營活動】,同時(shí)還建立了完善的售后服務(wù)體系,,為客戶提供良好的產(chǎn)品和服務(wù),。自公司成立以來,一直秉承“以質(zhì)量求生存,,以信譽(yù)求發(fā)展”的經(jīng)營理念,,始終堅(jiān)持以客戶的需求和滿意為重點(diǎn),為客戶提供良好的單細(xì)胞測序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,,空間轉(zhuǎn)錄組測序,單細(xì)胞多組學(xué)測序,,從而使公司不斷發(fā)展壯大,。