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濟南高通量測序空間轉(zhuǎn)錄組多組學(xué)測序

來源: 發(fā)布時間:2022-08-20

烈冰科技于2010年誕生之初便立足于高通量測序行業(yè),,為科研學(xué)者提供專注的測序數(shù)據(jù)分析服務(wù),,先后經(jīng)歷基因芯片時代、基因測序,、轉(zhuǎn)錄組測序時代...在科技日新月異的洪流中始終獨占鰲頭。2018年以來,,烈冰依托自主研發(fā)的NovelBrain®生物大數(shù)據(jù)分析平臺,,為用戶提供一站式全流程的空間轉(zhuǎn)錄組測序服務(wù)和解決方案。烈冰經(jīng)過十幾年的經(jīng)歷,,已具備大鼠,、小鼠、斑馬魚,、猴,、裸鼴鼠、水稻,、擬南芥等10+物種,,皮膚、腦,、胰腺,、脂肪、心臟,、花序等50+組織類型,,100+細胞類型,1000+靶標(biāo)基因,,10000+樣本處理經(jīng)驗,。空間轉(zhuǎn)錄組測序因其強大的探究疾病--細胞--基因的關(guān)系,,一度成為高通量測序技術(shù)的“天花板”,。濟南高通量測序空間轉(zhuǎn)錄組多組學(xué)測序

烈冰與國內(nèi)高校、研究所,、醫(yī)院和藥企單位開展深度合作,,服務(wù)于600+臨床與研究機構(gòu),1000+客戶和5000+重要科研項目,,助力并聯(lián)合發(fā)表300+篇CNS等國際學(xué)術(shù)期刊(不完全統(tǒng)計),,在單細胞領(lǐng)域,,烈冰助力用戶發(fā)表單細胞文獻30+篇,總IF>300+,,IF>10+以上文章占比65%以上,,包含Immunity、NatureCellBiology,、NaturePlants,、AdvancedScience等生物領(lǐng)域國際主流學(xué)術(shù)期刊,已發(fā)表文章研究領(lǐng)域涵蓋包括COVID-19研究,、疾病發(fā)生轉(zhuǎn)移機制,,免疫研究、腦神經(jīng),、白血病,、胚胎發(fā)育、糖尿病,、退行性疾病和植物領(lǐng)域研究等,。青島烈冰空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析可視化空間轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)遍地開花,烈冰服務(wù)讓您的生物醫(yī)學(xué)研究如虎添翼,。

空間轉(zhuǎn)錄組測序的數(shù)據(jù)質(zhì)量和玻片有效區(qū)域的利用率,、貼片的質(zhì)量和透化時間息息相關(guān)。貼片質(zhì)量不良會影響總的有效spot數(shù)等,;而透化不合理會導(dǎo)致spot的reads數(shù),、基因中位數(shù)等參數(shù)。而在特異性基因表達方面,,我們也可以統(tǒng)計空間轉(zhuǎn)錄組群體的特異性基因表達即Markergene,,將他們在組織切片以及空轉(zhuǎn)上進行著色。我們也可以對于任意一個已知的基因或者數(shù)據(jù)庫中的一些細胞Marker,,然后將其在基因表達在空間轉(zhuǎn)錄組的切片以及HE染色上展示自己的基因表達進而了解,,群體中的可能的細胞組成關(guān)系。

其實,,空間轉(zhuǎn)錄組的概念早就已經(jīng)存在了,,目前已經(jīng)發(fā)表的空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)有Slide-seq,LCM-seq,seqFISH,MERFISH,Liversinglecellzonation,Geo-seqandTomo-seq。但是這些方法存在操作復(fù)雜,、檢測精度不準(zhǔn)確,、基因和細胞檢測量的限制等問題。10xGenomics公司升級spatialTranscriptomic后推出的Visium空間基因表達解決方案是一款商業(yè)化的高精度,、高通量空間轉(zhuǎn)錄組測序方案,。烈冰科技自2020年起,國內(nèi)率先搭建空間轉(zhuǎn)錄組測序服務(wù)平臺,,聯(lián)合上線單細胞核轉(zhuǎn)錄組測序,、AbSeq,、單細胞TCR-Seq、單細胞ATAC-Seq(ARCHR測序),、空間轉(zhuǎn)錄組測序產(chǎn)品結(jié)合scRNA-Seq服務(wù),,多組學(xué)聯(lián)合助力科研人員探索時空等多維度、多角度的動態(tài)變化的生物學(xué)信息,。烈冰生物為您提供貼心的單細胞研究完整解決方案,!截至2021年10月,烈冰助力發(fā)表空間轉(zhuǎn)錄組測序文章近20篇,。

細胞在組織樣本中的相對空間位置關(guān)系對于了解疾病病理學(xué)非常重要,。但是scRNA-Seq在單細胞懸液制備的過程中破壞了細胞的空間結(jié)構(gòu),無法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細胞空間排布信息,。而空間轉(zhuǎn)錄組可以解決這個問題,,通過記錄組織切片細胞的空間信息,捕獲組織切片中的組織學(xué)信息,;通過免疫熒光進行蛋白組檢測,將基因表達譜映射回組織樣本中的原始位置,,同時獲得細胞/基因的空間表達特異性,。該技術(shù)可以為神經(jīng)科學(xué),發(fā)育生物學(xué),,免疫生理學(xué)等領(lǐng)域的研究提供組織和基因表達情況的新視角,。烈冰實驗室包含從樣本處理到測序下機的全套實驗平臺。北京烈冰空間轉(zhuǎn)錄組多組學(xué)測序

ATCG堿基的排列組合構(gòu)成了測序的龐大世界,。濟南高通量測序空間轉(zhuǎn)錄組多組學(xué)測序

空間轉(zhuǎn)錄組測序的關(guān)鍵就在于,,解決了空間位置保留的問題。被放置在芯片區(qū)域內(nèi)的冰凍組織切片在經(jīng)過H&E染色和成像記錄后,,會被進行透化處理,,釋放細胞中的RNA。芯片上的捕獲引物的中段設(shè)置了帶有獨特標(biāo)識的條形碼區(qū)域,。芯片被劃分為了數(shù)個不同的捕獲區(qū)域,,每個捕獲區(qū)域中錨定的引物都帶有不同的條形碼序列。每個區(qū)域?qū)?yīng)的組織位置會被記錄下來,,然后再進行測序后,,通過條形碼將不同區(qū)域的測序結(jié)果,映射到對應(yīng)的組織位置上,,拼貼形成組織樣品的空間轉(zhuǎn)錄組圖像,。濟南高通量測序空間轉(zhuǎn)錄組多組學(xué)測序

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司位于江月路999號奇亞特中心22幢。公司業(yè)務(wù)分為單細胞測序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,,空間轉(zhuǎn)錄組測序,,單細胞多組學(xué)測序等,目前不斷進行創(chuàng)新和服務(wù)改進,,為客戶提供良好的產(chǎn)品和服務(wù),。公司將不斷增強企業(yè)重點競爭力,努力學(xué)習(xí)行業(yè)知識,,遵守行業(yè)規(guī)范,,植根于醫(yī)藥健康行業(yè)的發(fā)展。烈冰生物秉承“客戶為尊,、服務(wù)為榮,、創(chuàng)意為先、技術(shù)為實”的經(jīng)營理念,,全力打造公司的重點競爭力,。