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深圳上海烈冰生物單細胞多組學服務機構(gòu)

來源: 發(fā)布時間:2022-08-28

未來,單細胞多組學測序技術的發(fā)展,一方面將集中在對現(xiàn)有技術的優(yōu)化和新方法的開發(fā).現(xiàn)有技術的優(yōu)化不僅包括建庫手段,、測序技術和算法工具等方面,還包括優(yōu)化實驗設計、自動化實驗流程以及提升實驗效率.為了更好地檢測到各種大分子的特征,研究者可以考慮從生物,、化學和物理等多學科中尋找解決方案.此外,新的計算方法和分析工具能幫助研究者越過一些實驗限制,發(fā)現(xiàn)更多新奇的生物過程.例如,擬時序分析(pseudotimetrajectory)將有助于人們理解早期胚胎發(fā)育的細胞分化軌跡.新方法則可以更多地關注目前未能檢測到的一些重要的基因表達調(diào)控層面,如DNA三維結(jié)構(gòu),、非編碼RNA和胞內(nèi)蛋白等.另一方面,目前的單細胞多組學測序技術發(fā)展勢頭強勁,研究者不斷研發(fā)并豐富著單細胞測序工具箱,各種組學方法百家爭鳴.未來,研究者需要從眾多相似的方法中篩選出一些穩(wěn)定、通用,、成本低,、可商業(yè)化的方法,并進一步擴大其實際應用范圍。單細胞多組學技術(single-cell multimodal omics) 是指在同一細胞中同時測量多種組學數(shù)據(jù)的前沿技術,。深圳上海烈冰生物單細胞多組學服務機構(gòu)

相對于Smart-Seq技術在細胞數(shù)量上的問題,,10X平臺普遍提供的細胞數(shù)量都在1000-20000不等的測序細胞量,這個量級的測序細胞量已經(jīng)可以說能夠完全覆蓋絕大部分組織的Single Cell群體類型,。因此,,這兩種技術對于基于基因表達進行準確細胞分型上,無論是從細胞數(shù)量上來說還是表達檢測可靠性來說,,都會更實用,。同時依托Random Cell Label技術,使得其對于NovaSeq,、HiSeq X Ten,、Hiseq 4000等設備存在的Index hooping現(xiàn)象,相對于Smart-Seq數(shù)據(jù)來說,,影響幾乎可以忽略不計(10X Genomics官方網(wǎng)站曾給出hooping測試結(jié)果,,顯示無影響。廈門single cell 單細胞多組學數(shù)據(jù)分析單細胞多組學技術基于單細胞測序技術和高通量組學方法發(fā)展而來,能在單細胞分辨率下同時整合多種組學信息,。

烈冰生物生信分析團隊緊追國際前沿,、整合添加多項國際期刊認可的空轉(zhuǎn)分析工具,構(gòu)建一套完整的數(shù)據(jù)分析流程,;精心研發(fā)空轉(zhuǎn)結(jié)果瀏覽器,,可同步展示空間轉(zhuǎn)錄組與單細胞測序分析結(jié)果,詳細深入地解析空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),。完成從Rawdata(原始數(shù)據(jù))到Spot-Gene的具有定位信息的表達矩陣的過程后,,就進入了空轉(zhuǎn)的第二步,去進行Spot的Cluster的過程,,熟悉單細胞測序的研究者知道,,Cluster在單細胞測序中往往表示為細胞的類型,也就是說能聚在一起采用算法分為一個群體細胞是一個Celltype(當然分情況也會有不同),。而在空轉(zhuǎn)中,,也正是由于前面提到了細胞的非單一性,,導致了這里的分群并不是單純的同一細胞類型,而應該認為是具有相同細胞組成的點陣區(qū)域,,或者說是近似的組織結(jié)構(gòu)區(qū)域,。

烈冰科技作為國內(nèi)同時擁有10XGenomics和BDRhapsody雙分選平臺的測序服務商及云計算服務供應商,經(jīng)過多年實戰(zhàn),,擁有豐富的單細胞懸液制備和分選經(jīng)驗,,實測BDRhapsody對能夠高效捕獲粒細胞。針對不同的分選平臺,、建庫方法,,實戰(zhàn)總結(jié)搭建出不同的數(shù)據(jù)預處理工作流程;烈冰科技NovelBrain®生物大數(shù)據(jù)平臺能有效支撐生命科學研究,、醫(yī)療健康等領域?qū)Υ髷?shù)據(jù)分析的需求,。完備的高通量測序?qū)嶒炂脚_,包括NovaSeq6000,、10XChromiumX,、BDFACSMelody、PANNORAMIC數(shù)字切片掃描儀等,,配合一支來自海內(nèi)外名校,、多學科交叉型的高素質(zhì)綜合團隊,為您的科學研究保駕護航,。烈冰生物為您提供一站式全流程高通量測序服務,。

烈冰科技自主研發(fā)的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),深入解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,,深入挖掘其背后的生物學意義,;從操作便捷、結(jié)果可視化,、分析可追溯,、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細胞研究,加速科研進程,!此外,,烈冰生信團隊根據(jù)豐富的實戰(zhàn)經(jīng)驗為用戶量身打造了一款單細胞測序結(jié)果解讀的神兵利器——單細胞瀏覽器(SingleCellBrowser),不僅可以將海量復雜的結(jié)果文件可視化,,還可以實現(xiàn)分析結(jié)果的三維立體化的展示呈現(xiàn),。專業(yè)的生信代碼交給專業(yè)的烈冰,專業(yè)的生物學意義交給專業(yè)的您,!分子檢測型單細胞多組學測序技術中也有一些集 中于探究單細胞內(nèi)表觀遺傳組各層面的變化及關聯(lián),。廈門烈冰單細胞多組學數(shù)據(jù)分析可視化

單細胞技術從 2009 年發(fā)展到現(xiàn)在,研究范圍不再局限于轉(zhuǎn)錄組,擴展到了基因組,、免疫組、蛋白組等多組學水平,。深圳上海烈冰生物單細胞多組學服務機構(gòu)

二代測序技術在測序方法上取得了重大突破,,基于“邊合成邊測序”(sequencingbysynthesis)和大規(guī)模平行測序技術(massiveparallelanalysis,MPS),,使測序通量和讀取速度得到極大提升,,烈冰生物斥巨資購置的Novaseq6000測序儀的測序原理可以簡化為四步:樣品文庫構(gòu)建、簇生成,、測序和數(shù)據(jù)分析,。由于讀長限制,樣品DNA或由RNA逆轉(zhuǎn)錄得到的cDNA需要被打斷成300-500bp的片段,,并在3和5端接上3種序列:1)Index,,用于區(qū)分樣品來源;2)Adapter,,用于結(jié)合測序通道上的位點,;3)Primerbindingsite,用于結(jié)合PCR引物啟動擴增反應,。深圳上海烈冰生物單細胞多組學服務機構(gòu)

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