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杭州scRNA空間轉(zhuǎn)錄組服務機構

來源: 發(fā)布時間:2022-08-30

在發(fā)育過程或疾病發(fā)生過程中,,組織內(nèi)部的不同細胞經(jīng)歷了復雜的生物學過程,,因此,,組織內(nèi)部的異質(zhì)性研究是目前揭示重要生物學研究的一個重要研究手段。組織內(nèi)部的異質(zhì)性包括細胞類型的異質(zhì)性和空間位置的異質(zhì)性兩個層面,,細胞類型異質(zhì)性可由單細胞測序來完美呈現(xiàn),,而空間位置的異質(zhì)性,則需要可高通量地檢測全轉(zhuǎn)錄組空間信息的新型研究方法來解決,。烈冰生物真正實現(xiàn)空間轉(zhuǎn)錄組測序的全程把控,,做到從實驗設計、空間信息標記,、建庫測序,、定制化分析的全流程一站式服務,助力高分文章發(fā)表,??臻g轉(zhuǎn)錄組測序機構,請認準上海烈冰生物科技,。杭州scRNA空間轉(zhuǎn)錄組服務機構

細胞在組織樣本中的相對空間位置關系對于了解疾病病理學非常重要。但是scRNA-Seq在單細胞懸液制備的過程中破壞了細胞的空間結(jié)構,,無法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細胞空間排布信息,。而空間轉(zhuǎn)錄組可以解決這個問題,通過記錄組織切片細胞的空間信息,,捕獲組織切片中的組織學信息,;通過免疫熒光進行蛋白組檢測,將基因表達譜映射回組織樣本中的原始位置,,同時獲得細胞/基因的空間表達特異性,。該技術可以為神經(jīng)科學,發(fā)育生物學,,免疫生理學等領域的研究提供組織和基因表達情況的新視角,。上海上海烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組服務機構烈冰對于一個細胞群體中的每個細胞單獨進行建庫測序分析。

空間轉(zhuǎn)錄組學(Spatial Transcriptomics)是指在組織切片上完成,,保留樣本空間信息的組學研究,。空間轉(zhuǎn)錄組可展示組織切片中不同區(qū)域的基因表達情況,,揭示精細病理區(qū)域中激發(fā)的信號通路,,完成分子特征驅(qū)動病理特征的機制解析??臻g轉(zhuǎn)錄組學完成了病理數(shù)字化結(jié)合病理影像化的技術革新,,對于診斷標志物、耐藥位點以及靶向藥物的研發(fā),,免疫治等新興領域都具有重要作用,。當組織冷凍切片附在帶有spatialbarcode的空間轉(zhuǎn)錄組芯片上時,,通過透化處理,細胞內(nèi)的mRNA釋放出來,,從而被芯片上帶有oligo-dT的探針捕獲,。被捕獲的mRNA開始逆轉(zhuǎn)錄,得到的cDNA中包含了spatialbarcode序列,。通過上機測序,,可以將每個mRNA轉(zhuǎn)錄的序列映射回組織切片中的映射回組織切片中的原始位置。

空間轉(zhuǎn)錄組測序在病理學中,,通過添加基因表達維度,,得出形態(tài)學結(jié)論,通過觀察基因表達區(qū)域,,了解可能發(fā)生假陰性/假陽性的位置; 在免疫學,,研究免疫細胞浸潤、不同區(qū)域的免疫細胞中的基因表達特征,;免疫群體擴散,、不同類型免疫細胞的空間位置解析; 在神經(jīng)科學,,研究大腦皮層層狀組織解析,,揭示大腦皮層的結(jié)構-功能關系,正常vs.疾病大腦結(jié)構特征分析與疾病相關的基因表達于特定的大腦皮層,; 在發(fā)育生物學,,通過解析每個發(fā)育階段不同解剖區(qū)域特有的基因表達特征,解析組織中與形態(tài)形成相關基因,;豐富基因表達的空間注釋信息,,創(chuàng)建組織發(fā)育的空間細胞圖譜??臻g轉(zhuǎn)錄組可展示組織切片中不同區(qū)域的基因表達情況,,揭示精細病理區(qū)域的信號通路。

空間轉(zhuǎn)錄組測序是在組織原位檢測全轉(zhuǎn)錄組基因表達的?種技術,,可以展?組織切?中不同區(qū)域的基因表達情況,,同時能夠得到?的基因在組織內(nèi)部的空間位置信息。與傳統(tǒng)的全基因轉(zhuǎn)錄組或單細胞轉(zhuǎn)錄組測序相?,,空間轉(zhuǎn)錄組測序漿病理影像(H&E染?)與測序數(shù)據(jù)映射在?起,,進?可以分析組織切內(nèi)部空間結(jié)構的細胞異質(zhì)性。常規(guī)單細胞轉(zhuǎn)錄組測序技術丟失了細胞在原組織中至關重要的空間位置信息,,而單細胞空間轉(zhuǎn)錄組技術在進行單細胞轉(zhuǎn)錄組測序的同時保留并記錄了細胞的空間位置信息,。空間轉(zhuǎn)錄組技術能夠揭示細胞間的相互作用以及細胞所處的微環(huán)境,,將成為發(fā)育生物學,、神經(jīng)生物學,、免疫生物學等領域的研究利器。烈冰生物全轉(zhuǎn)錄組測序通過雙文庫構建,,實現(xiàn)多種RNA的一網(wǎng)打盡,。蘇州高通量測序空間轉(zhuǎn)錄組技術支持

烈冰科技已建立了基于空間轉(zhuǎn)錄組的高通量測序?qū)嶒灦嗥脚_。杭州scRNA空間轉(zhuǎn)錄組服務機構

單細胞測序技術是一種在單細胞水平上對基因組,、轉(zhuǎn)錄組,、表觀組等進行高通量測序分析的技術。單細胞測序技術能夠在組學水平揭示細胞間的異質(zhì)性,。單細胞水平細胞譜系追蹤技術位居2018年Science 雜志評選的科學突破,。常規(guī)單細胞轉(zhuǎn)錄組測序技術丟失了細胞在原組織中至關重要的空間位置信息,而單細胞空間轉(zhuǎn)錄組技術在進行單細胞轉(zhuǎn)錄組測序的同時保留并記錄了細胞的空間位置信息,??臻g轉(zhuǎn)錄組技術能夠揭示細胞間的相互作用以及細胞所處的微環(huán)境,將成為發(fā)育生物學,、神經(jīng)生物學,、免疫生物學等領域的研究利器。杭州scRNA空間轉(zhuǎn)錄組服務機構

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