單細胞測序是指針對單個細胞進行全轉(zhuǎn)錄組測序分析,,可精確地描述每一個細胞的狀態(tài),,在異質(zhì)性發(fā)育過程中具有不可忽視的應(yīng)用價值。然而,,單細胞測序無法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細胞空間排布信息,,對于揭示發(fā)育過程、病理微環(huán)境都存在很大的局限性,??臻g轉(zhuǎn)錄組測序以點陣形式記錄病理切片細胞的空間信息并進行測序,可以精確指示點陣內(nèi)的全部基因表達情況,??臻g轉(zhuǎn)錄組測序的加入,無疑讓單細胞測序如虎添翼,,更精確地勾勒了組織水平的異質(zhì)性,。目前單細胞多組學(xué)技術(shù)仍然處于技術(shù)探索及高通量開發(fā)階段,但應(yīng)用單細胞多組學(xué)分析是研究發(fā)展的必然趨勢。廈門single cell RNA單細胞多組學(xué)測序服務(wù)
其實,空間轉(zhuǎn)錄組的概念早就已經(jīng)存在了,,目前已經(jīng)發(fā)表的空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)有Slide-seq,LCM-seq,seqFISH,MERFISH,Liversinglecellzonation,Geo-seqandTomo-seq,。但是這些方法存在操作復(fù)雜、檢測精度不準(zhǔn)確,、基因和細胞檢測量的限制等問題,。10xGenomics公司升級spatialTranscriptomic后推出的Visium空間基因表達解決方案是一款商業(yè)化的高精度、高通量空間轉(zhuǎn)錄組測序方案,。烈冰科技自2020年起,,國內(nèi)率先搭建空間轉(zhuǎn)錄組測序服務(wù)平臺,聯(lián)合上線單細胞核轉(zhuǎn)錄組測序,、AbSeq,、單細胞TCR-Seq、單細胞ATAC-Seq(ARCHR測序),、空間轉(zhuǎn)錄組測序產(chǎn)品結(jié)合scRNA-Seq服務(wù),,多組學(xué)聯(lián)合助力科研人員探索時空等多維度、多角度的動態(tài)變化的生物學(xué)信息,。烈冰生物為您提供貼心的單細胞研究完整解決方案,!深圳單細胞多組學(xué)服務(wù)機構(gòu)深度的單細胞測序數(shù)據(jù)解讀助力生物健康醫(yī)療時代。
烈冰與國內(nèi)高校,、研究所,、醫(yī)院和藥企單位開展深度合作,服務(wù)于600+臨床與研究機構(gòu),,1000+客戶和5000+重要科研項目,,助力并聯(lián)合發(fā)表300+篇CNS等國際學(xué)術(shù)期刊(不完全統(tǒng)計),在單細胞領(lǐng)域,,烈冰助力用戶發(fā)表單細胞文獻30+篇,,總IF>300+,IF>10+以上文章占比65%以上,,包含Immunity,、NatureCellBiology、NaturePlants,、AdvancedScience等生物領(lǐng)域國際主流學(xué)術(shù)期刊,,已發(fā)表文章研究領(lǐng)域涵蓋包括COVID-19研究、疾病發(fā)生轉(zhuǎn)移機制,,免疫研究,、腦神經(jīng)、白血病,、胚胎發(fā)育,、糖尿病、退行性疾病和植物領(lǐng)域研究等。
單細胞測序結(jié)果動輒上百G數(shù)據(jù)量,,龐大的數(shù)據(jù)對于分析平臺和分析能力有著很高的要求,,首先針對下機數(shù)據(jù)的質(zhì)控環(huán)節(jié):單細胞測序產(chǎn)生數(shù)億的結(jié)果序列,不可避免的會出現(xiàn)低質(zhì)量的測序結(jié)果,,存在各種情況的序列污染,。因此序列過濾及質(zhì)量評估就會變得極為重要。序列質(zhì)量主要通過測序質(zhì)量值Q20/Q30的占比來表征,,即堿基測序結(jié)果的錯誤率在1%/0.1%以下的比例,。理想的測序結(jié)果reads的堿基質(zhì)量均高于30。保證數(shù)據(jù)獲得后第一步的處理結(jié)果的準(zhǔn)確性,,為后續(xù)細胞類型鑒定準(zhǔn)確和功能分析打下堅實基礎(chǔ),。單細胞測序是高通量測序下的又一重大技術(shù)突破。
單細胞多組學(xué)測序技術(shù)的發(fā)展依賴于各種單一組學(xué)檢測技術(shù)的完善,但即使在單細胞測序技術(shù)迅速發(fā)展的情況下,在單細胞水平協(xié)同檢測多個不同的分子層面仍然非常具有挑戰(zhàn)性.每一種組學(xué)都有不同的特性和測量方法,這些方法在敏感性,、特異性,、通量和適用性上都有所不同.因此,在單細胞水平對多種組學(xué)方法進行整合和應(yīng)用時,需要在策略上做出改進,以保證各組學(xué)間的上游建庫以及下游生物信息分析均能良好地兼容,同時也要明確技術(shù)的局限性及其對研究結(jié)果的潛在影響。烈冰生物為您提供一站式全流程單細胞測序服務(wù),。scRNA單細胞多組學(xué)數(shù)據(jù)分析
單細胞多組學(xué)突破了以往單細胞檢測的單一性,可更多樣化,。廈門single cell RNA單細胞多組學(xué)測序服務(wù)
烈冰生信團隊傾情研發(fā)的NovelBrain®生信大數(shù)據(jù)分析平臺,針對龐大的單細胞測序數(shù)據(jù),,能夠?qū)崿F(xiàn)細胞類型鑒定的快、精,、準(zhǔn):一鍵導(dǎo)入genelist構(gòu)建個性化基因列表,;輕松一點即可展示Marker基因的Featureplot;任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細胞類型,;一鍵獲得t-SNE圖,、Heatmap和Violin圖:輕松獲得并下載基因表達的t-SNE圖、Heatmap,、Violin圖,,還可以通過調(diào)節(jié)寬、高和系數(shù)比例來調(diào)節(jié)美觀,。平臺上線300+task自主分析工具,、50+pipeline工作流模板,幫助烈冰生信分析團隊和自主分析用戶實現(xiàn)分析工具和模板的快速調(diào)用和一站式全流程自動化分析,,節(jié)省您的工作時間并提升整體工作效率,。廈門single cell RNA單細胞多組學(xué)測序服務(wù)
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