上皮型鈣黏附素（E-cadherin）是介導(dǎo)細(xì)胞間粘附的一種跨膜糖蛋白,，其編碼基因CDH-1屬于**侵襲轉(zhuǎn)移抑制基因,。在**組織中，E-cadherin表達(dá)的下調(diào)或沉默可導(dǎo)致細(xì)胞間相互黏附力減弱,，造成**細(xì)胞的分散,，脫離原發(fā)灶處而轉(zhuǎn)移。而E-cadherin下調(diào)的因素之一就是其啟動(dòng)子區(qū)域CpG島的超甲基化,。**細(xì)胞突破血管內(nèi)皮及基底膜進(jìn)入血循環(huán)是**細(xì)胞侵襲和轉(zhuǎn)移的重要步驟,。基底膜組成蛋白Nidogen的缺失將嚴(yán)重影響基底膜的完整性,，有利于**細(xì)胞順利通過(guò)進(jìn)入血循環(huán)進(jìn)而發(fā)生侵襲轉(zhuǎn)移,。有研究表明，Nidogen基因啟動(dòng)子在**細(xì)胞中表現(xiàn)出很高的甲基化水平,，而在正常細(xì)胞中卻極少或沒(méi)有發(fā)生甲基化,。另外，某些miRNA（如MiR-148a,、miR-34b/c,、miR-9）能夠起到抑制**細(xì)胞生長(zhǎng)和轉(zhuǎn)移的作用，而在**細(xì)胞中,，這些miRNA通常由于發(fā)生超甲基化而沉默,。中小樣本篩選, 大樣本中進(jìn)一步驗(yàn)證。四川oxBSDNA甲基化口碑推薦

相比之下,，VeraCode GoldenGate甲基化分析技術(shù)更適合中通量的篩選及驗(yàn)證研究,，它以以矩陣微珠芯片(Sentrix Array Matrix(SAM)）形式分析48至384個(gè)用戶(hù)指定的CpG位點(diǎn)。首先,，將亞硫酸氫鹽處理的基因組DNA 與分析oligo混合,，oligo與未甲基化位點(diǎn)的U互補(bǔ)，或者與甲基化位點(diǎn)的C互補(bǔ),。雜交之后,，引物延伸，并連接上位點(diǎn)特異的oligo來(lái)產(chǎn)生通用 PCR的模板,。***,，用標(biāo)記的PCR引物生成可檢測(cè)的產(chǎn)物。據(jù)Illumina的產(chǎn)品**介紹,，其產(chǎn)品的**優(yōu)勢(shì)在于單個(gè)CpG位點(diǎn)的分辨率,。其它分析將甲基化定位在一段區(qū)域,，而通過(guò)Illumina分析，你能精確測(cè)定某個(gè)CpG位點(diǎn)的甲基化水平,。山東oxBSDNA甲基化經(jīng)驗(yàn)豐富甲基化驗(yàn)證是甲基化研究必不可少的一環(huán),。

甲基化DNA免疫沉淀測(cè)序（MethylatedDNAImmunoprecipitationSequencing，MeDIP-Seq）是通過(guò)5mC特異性抗體富集甲基化的DN**段,，然后結(jié)合高通量測(cè)序技術(shù)在全基因組水平上以較小的數(shù)據(jù)量,，快速、高效地尋找甲基化區(qū)域,?？蓮V泛應(yīng)用于甲基化與疾病關(guān)系研究。樣本要求：基因組DNA:>=3ug,；樣品濃度>50ng/ul,；無(wú)RNA和蛋白污染，建庫(kù)測(cè)序：測(cè)序策略：IlluminaHiSeq,PE150;測(cè)序深度：20-30Mreads,。信息分析：基于全基因組范圍的羥甲基化分析,，數(shù)據(jù)質(zhì)控，Peak鋒Calling,，Peak鋒在基因組,、染色體、功能元件上的分布,，多樣本羥甲基化差異聚類(lèi),，差異羥甲基化DMR鑒定及相關(guān)基因的功能分析,，結(jié)合項(xiàng)目背景和科學(xué)問(wèn)題的數(shù)據(jù)亮點(diǎn)挖掘,。

miRNA的超甲基化：**細(xì)胞另一個(gè)重要的特點(diǎn)是miRNA表達(dá)水平的整體下降，通常也是由于miRNA啟動(dòng)子區(qū)域高甲基化造成的,。這種miRNA表達(dá)失活不僅與**的發(fā)***展有關(guān),，而且與**的轉(zhuǎn)移密切相關(guān)。如**細(xì)胞中miR-148a,、miR-34b/c,、miR-9這三種miRNA都發(fā)生了明顯得超甲基化，同時(shí)外源表達(dá)這三種miRNA均可抑制**細(xì)胞的生長(zhǎng)和轉(zhuǎn)移,。**發(fā)生是一個(gè)涉及多基因,、多步驟的復(fù)雜過(guò)程，越來(lái)越多的研究表明DNA甲基化在**的發(fā)生,、發(fā)展,、轉(zhuǎn)移中起到了重要的作用，特征性甲基化位點(diǎn)對(duì)于**的診斷,、分型,、預(yù)后及***具有重要意義,。全基因組甲基化分析及特異位點(diǎn)甲基化檢測(cè)。

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WGBS：科學(xué)方案設(shè)計(jì)：從項(xiàng)目背景了解,、協(xié)助方案設(shè)計(jì)、實(shí)驗(yàn)材料選取,、建庫(kù)測(cè)序,，到數(shù)據(jù)分析每個(gè)項(xiàng)目有特定的科學(xué)問(wèn)題；需要專(zhuān)業(yè),、有價(jià)值的建議,；科學(xué)、縝密的設(shè)計(jì)及時(shí)高效的溝通,；以保障高質(zhì)量研究成果,。樣本要求：基因組DNA:>=3ug；樣品濃度>30ng/ul,；無(wú)RNA和蛋白污染建庫(kù)測(cè)序：測(cè)序策略：IlluminaHiSeq,PE150,；測(cè)序深度：>=30X。信息分析：基于全基因組范圍的甲基化分析,，數(shù)據(jù)質(zhì)控,，5mCCalling，5mC在基因組,、染色體,、功能元件上的分布，多樣本甲基化差異聚類(lèi),，差異甲基化DMR鑒定及相關(guān)基因的功能分析,，結(jié)合項(xiàng)目背景和科學(xué)問(wèn)題的數(shù)據(jù)亮點(diǎn)挖掘。四川oxBSDNA甲基化口碑推薦