聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)準(zhǔn)備:引物內(nèi)部不應(yīng)出現(xiàn)互補(bǔ)序列。兩個(gè)引物之間不應(yīng)存在互補(bǔ)序列,尤其是避免3 ′端的互補(bǔ)重疊,。引物與非特異擴(kuò)增區(qū)的序列的同源性不要超過70%,,引物3′末端連續(xù)8個(gè)堿基在待擴(kuò)增區(qū)以外不能有完全互補(bǔ)序列,否則易導(dǎo)致非特異性擴(kuò)增。引物3‘端的堿基,特別是很末及倒數(shù)第二個(gè)堿基,應(yīng)嚴(yán)格要求配對(duì),,很好選擇是G和C。引物的5′端可以修飾,。如附加限制酶位點(diǎn),,引入突變位點(diǎn),用生物素,、熒光物質(zhì),、地高辛標(biāo)記,加入其它短序列,,包括起始密碼子,、終止密碼子等。PCR產(chǎn)物的電泳檢測時(shí)間一般為48h以內(nèi),,有些很好于當(dāng)日電泳檢測,,大于48h后帶型不規(guī)則甚至消失。南京骨頭PCR檢測技術(shù)網(wǎng)站
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng):Taq(水生棲熱菌)聚合酶耐熱DNA聚合酶的很好活性溫度約為75-80°C(167-176°F),盡管該酶通常使用72°C(162°F)的溫度,。在該步驟中,,DNA聚合酶通過從反應(yīng)混合物中添加在5’-至-3’方向上與模板互補(bǔ)的游離DNA鏈來合成與DNA模板鏈互補(bǔ)的新DNA鏈,在新生(伸長)DNA鏈的末端,,將dNTPs的5'-磷酸基與3'-羥基縮合,。延伸所需的精確時(shí)間取決于所使用的DNA聚合酶和要擴(kuò)增的DNA目標(biāo)區(qū)域的長度。根據(jù)經(jīng)驗(yàn),,在很好溫度下,,大多數(shù)DNA聚合酶每分鐘聚合一千個(gè)堿基,。在很好條件下(即,如果沒有限制底物或試劑的限制),,在每個(gè)延伸/延伸步驟中,,DNA靶序列的數(shù)量加倍。隨著每一個(gè)連續(xù)的循環(huán),,原始模板鏈加上所有新產(chǎn)生的鏈成為下一輪延伸的模板鏈,,導(dǎo)致特定DNA目標(biāo)區(qū)域的指數(shù)(幾何)擴(kuò)增。南京骨頭PCR檢測技術(shù)網(wǎng)站逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)較廣用于表達(dá)譜,,以確定基因的表達(dá)或鑒定RNA轉(zhuǎn)錄物的序列,。
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的常見問題:陰性:需注意的是有時(shí)忘加Taq酶或溴乙錠。引物:引物質(zhì)量,、引物的濃度,、兩條引物的濃度是否對(duì)稱,是PCR失敗或擴(kuò)增條帶不理想,、容易彌散的常見原因。有些批號(hào)的引物合成質(zhì)量有問題,,兩條引物一條濃度高,,一條濃度低,造成低效率的不對(duì)稱擴(kuò)增,,對(duì)策為:選定一個(gè)好的引物合成單位,。引物的濃度不但要看OD值,,更要注重引物原液做瓊脂糖凝膠電泳,,一定要有引物條帶出現(xiàn),,而且兩引物帶的亮度應(yīng)大體一致,如一條引物有條帶,,一條引物無條帶,此時(shí)做PCR有可能失敗,,應(yīng)和引物合成單位協(xié)商解決,。如一條引物亮度高,一條亮度低,,在稀釋引物時(shí)要平衡其濃度,。引物應(yīng)高濃度小量分裝保存,,防止多次凍融或長期放冰箱冷藏部分,,導(dǎo)致引物變質(zhì)降解失效。引物設(shè)計(jì)不合理,,如引物長度不夠,,引物之間形成二聚體等。
聚合酶鏈反應(yīng):多重連接依賴探針擴(kuò)增(MLPA):允許用單個(gè)引物對(duì)擴(kuò)增多個(gè)靶標(biāo),,從而避免多重PCR的分辨率限制。多重聚合酶鏈反應(yīng):由單個(gè)PCR混合物中的多個(gè)引物組組成,,以產(chǎn)生對(duì)不同DNA序列特異的不同大小的擴(kuò)增子,。通過同時(shí)靶向多個(gè)基因,可以從單次測試中獲得額外的信息,,否則將需要幾次試劑和更多時(shí)間來執(zhí)行,。每個(gè)引物組的退火溫度必須優(yōu)化,以在單個(gè)反應(yīng)中正確工作,,并符合擴(kuò)增子尺寸。也就是說,,當(dāng)通過凝膠電泳可視化時(shí),,它們的堿基對(duì)長度應(yīng)該足夠不同以形成不同的條帶。聚合酶鏈反應(yīng)是一種非常強(qiáng)大和實(shí)用的研究工具,。
聚合酶鏈反應(yīng):在檢測病原體方面,病原體培養(yǎng)是臨床診斷的金標(biāo)準(zhǔn) .但是對(duì)于一些苛養(yǎng)菌 生長緩慢的細(xì)菌或難以培養(yǎng)的病原體等培養(yǎng)的陽性檢出率不高.檢測時(shí)間過長 無法滿足臨床早期快速診斷以指導(dǎo)醫(yī)治的需要[3],。當(dāng)前 PCR 技術(shù)是在傳統(tǒng) PCR 技術(shù)應(yīng)用的基礎(chǔ)上進(jìn)行的改進(jìn),包括實(shí)時(shí)定量 PCR 技術(shù) ,、 實(shí)時(shí)熒光定量PCR,、 PCR-酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn) ,、 巢式PCR等,。 在PCR技術(shù)的輔助作用下,,實(shí)驗(yàn)室檢測也逐漸從生化免疫診斷過渡到基因診斷,生化免疫檢測主要從表型表現(xiàn)評(píng)估病癥,,而基因診斷則深入本質(zhì)探究其病因,,以PCR 技術(shù)為主的核酸技術(shù)在臨床實(shí)驗(yàn)室檢測與疾病診斷中表現(xiàn)出了明顯的應(yīng)用價(jià)值,,在未來的臨床醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)中必將會(huì)得到更加較廣的應(yīng)用,。PCR產(chǎn)物的生成量是以指數(shù)方式增加的,能將皮克量級(jí)的起始待測模板擴(kuò)增到微克水平,。南京骨頭PCR檢測技術(shù)網(wǎng)站
聚合酶鏈反應(yīng)的一個(gè)主要限制是,,為了產(chǎn)生允許其選擇性擴(kuò)增的引物,,需要關(guān)于目標(biāo)序列的先前信息。南京骨頭PCR檢測技術(shù)網(wǎng)站
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的常見問題:靶序列變異:如靶序列發(fā)生突變或缺失,,影響引物與模板特異性結(jié)合,,或因靶序列某 段缺失使引物與模板失去互補(bǔ)序列,其PCR擴(kuò)增是不會(huì)成功的,。假陽性:出現(xiàn)的PCR擴(kuò)增條帶與目的靶序列條帶一致,,有時(shí)其條帶更整齊,亮度更高,。引物設(shè)計(jì)不合適:選擇的擴(kuò)增序列與非目的擴(kuò)增序列有同源性,,因而在進(jìn)行PCR擴(kuò)增時(shí),,擴(kuò)增出的PCR產(chǎn)物為非目的性的序列。靶序列太短或引物太短,,容易出現(xiàn)假陽性,。需重新設(shè)計(jì)引物。出現(xiàn)片狀拖帶或涂抹帶:PCR擴(kuò)增有時(shí)出現(xiàn)涂抹帶或片狀帶或地毯樣帶,。其原因往往由于酶量過多或酶的質(zhì)量差,,dNTP濃度過高,,Mg2+濃度過高,,退火溫度過低,,循環(huán)次數(shù)過多引起,。其對(duì)策有:減少酶量,或調(diào)換另一來源的酶,。②減少dNTP的濃度。適當(dāng)降低Mg2+濃 度,。增加模板量,減少循環(huán)次數(shù),。南京骨頭PCR檢測技術(shù)網(wǎng)站
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