基于聚合酶鏈反應(yīng)的遺傳(或脫氧核糖核酸)指紋圖譜協(xié)議的發(fā)展已在法醫(yī)學(xué)中得到較廣應(yīng)用:遺傳指紋以其辨別力的形式,,可以從世界上所有人群中獨(dú)特地區(qū)分任何一個(gè)人,。微小的DNA樣本可以從犯罪現(xiàn)場(chǎng),,和比較的從嫌疑人那里,,或者從DNA資料庫早期的證據(jù)或罪犯,。這些測(cè)試的簡(jiǎn)單版本通常用于在刑事調(diào)查中快速排除嫌疑人,。幾十年前的犯罪證據(jù)可以被檢驗(yàn),,確認(rèn)或免責(zé)很初被定罪的人,。脫氧核糖核酸指紋中較小的區(qū)別有助于親子鑒定,,在親子鑒定中,一個(gè)人和他的近親相匹配,??梢詼y(cè)試未知人類遺骸的DNA,并與可能的父母,、兄弟姐妹或兒童進(jìn)行比較,。類似的測(cè)試可以用來確認(rèn)被收養(yǎng)(或)孩子的親生父母,。新生兒的實(shí)際生父也可以被確認(rèn)(或排除)。聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的引物與模板的結(jié)合及引物鏈的延伸是遵循堿基配對(duì)原則的,。珠海組織Real-time PCR網(wǎng)站
PCR的反應(yīng)條件:dNTP濃度過高會(huì)加快反應(yīng)速度,,但同時(shí)還可以增加堿基的錯(cuò)誤摻入率。引物濃度過高會(huì)引起錯(cuò)配和非特異性產(chǎn)物擴(kuò)增,。TaqDNA聚合酶濃度過高會(huì)引起錯(cuò)配和非特異性產(chǎn)物擴(kuò)增,,低則合成產(chǎn)物量減少。TaqDNA聚合酶無校正功能,,摻入錯(cuò)誤率達(dá)2*E-4個(gè)核苷酸,,一個(gè)30個(gè)循環(huán)的擴(kuò)增反應(yīng)0.1%-0.25%總錯(cuò)誤率。在90~95度下可使整個(gè)基因組的DNA變性為單鏈,。一般94~95度30~60s,。時(shí)間過長(zhǎng)使TaqDNA聚合酶失活和dNTP破壞增多。DNA很快冷卻到40~60度使引物和模板結(jié)合,。引物長(zhǎng)度在15~25時(shí)退火溫度,。珠海組織Real-time PCR網(wǎng)站如果基因的基因組DNA序列是已知的,逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)可以用來繪制基因中外顯子和內(nèi)含子的位置,。
聚合酶鏈反應(yīng):流聚合酶鏈反應(yīng):一種偽等溫PCR方法,。將溶液置于熱梯度下,而不是反復(fù)加熱和冷卻聚合酶鏈反應(yīng)混合物,。由此產(chǎn)生的熱不穩(wěn)定性驅(qū)動(dòng)對(duì)流流動(dòng)自動(dòng)將聚合酶鏈反應(yīng)試劑從熱區(qū)域和冷區(qū)域打亂,,從而反復(fù)啟動(dòng)聚合酶鏈反應(yīng)。通過利用混沌流場(chǎng)的出現(xiàn),,可以優(yōu)化熱邊界條件和PCR外殼的幾何形狀等參數(shù),,以產(chǎn)生特異和快速的PCR。這種對(duì)流聚合酶鏈反應(yīng)設(shè)置明顯降低了設(shè)備功率需求和操作時(shí)間,。逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)(逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)):用于從RNA中擴(kuò)增DNA,。逆轉(zhuǎn)錄酶將核糖核酸逆轉(zhuǎn)錄成cDNA ,然后通過聚合酶鏈反應(yīng)進(jìn)行擴(kuò)增,。逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)較廣用于表達(dá)譜,以確定基因的表達(dá)或鑒定RNA轉(zhuǎn)錄物的序列,,包括轉(zhuǎn)錄起始和終止位點(diǎn),。如果基因的基因組DNA序列是已知的,逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)可以用來繪制基因中外顯子和內(nèi)含子的位置,?;虻?’端(對(duì)應(yīng)于轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn))通常通過 RACE-PCR (快速擴(kuò)增cDNA末端)中。
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng):反應(yīng)的控制:PCR反應(yīng)的緩沖液 提供合適的酸堿度與某些離子,;鎂離子濃度 總量應(yīng)比dNTPs的濃度高,,常用1.5mmol/L,;底物濃度 dNTP以等摩爾濃度配制,20~200umol/L,;TaqDNA聚合酶 2.5U(100ul),;引物濃度一般為0.1 ~ 0.5umol/L;反應(yīng)溫度和循環(huán)次數(shù),;變性溫度和時(shí)間 95℃,,30s;退火溫度和時(shí)間 低于引物Tm值5 ℃左右,,一般在45~55℃,;延伸溫度和時(shí)間 72℃,1min/kb(10kb內(nèi)),;Tm值=4(G+C) +2(A+T),;循環(huán)次數(shù) :一般為25 ~ 30次。循環(huán)數(shù)決定PCR擴(kuò)增的產(chǎn)量,。模板初始濃度低,,可增加循環(huán)數(shù)以便達(dá)到有效的 擴(kuò)增量。但循環(huán)數(shù)并不是可以無限增加的,。一般循環(huán)數(shù)為30個(gè)左右,,循環(huán)數(shù)超過30個(gè)以后,DNA聚合酶活性逐漸達(dá)到飽和,,產(chǎn)物的量不再隨循環(huán)數(shù)的增加而增加,,出現(xiàn)了所謂的“平臺(tái)期”。聚合酶鏈反應(yīng)具有定量合成產(chǎn)物的優(yōu)點(diǎn),。
聚合酶鏈反應(yīng)的常見問題分析與解決方法:無擴(kuò)增條帶:酶失活或在反應(yīng)體系中未加入酶,。Taq DNA聚合酶因保存或運(yùn)輸不當(dāng)而失活,往往通過更換新酶或用另一來源的酶以獲得滿意的結(jié)果,。模板含有雜質(zhì),。特別是對(duì)甲醛固定及石蠟包埋的組織常含甲酸,造成DNA脫嘌呤而影響PCR的結(jié)果,。變性溫度是否準(zhǔn)確:PCR儀指示溫度與實(shí)際溫度是否相符,,過高酶在前幾個(gè)循環(huán)就迅速失活;過低則模板變性不徹底,。反應(yīng)系統(tǒng)中污染了蛋白酶及核酸酶,,應(yīng)在未加Taq酶以前,將反應(yīng)體系95℃加熱5-10 min,。引物變質(zhì)失效,。人工合成的引物是否正確。是否純化,,或因儲(chǔ)存條件不當(dāng)而失活,。引物錯(cuò)誤,。利用BLAST檢查引物特異性或重新設(shè)計(jì)引物。 DNA凝膠電泳時(shí)加入陽性對(duì)照,,確保不是DNA凝膠和PCR程序的問題,。聚合酶鏈反應(yīng)五要素:參加PCR反應(yīng)的物質(zhì)主要有五種即:引物、酶,、dNTP,、模板和緩沖液。珠海分子生物學(xué)數(shù)字PCR技術(shù)服務(wù)
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng):模板的制備,,PCR的模板可以是DNA,,也可以是RNA。珠海組織Real-time PCR網(wǎng)站
聚合酶鏈反應(yīng)同時(shí)擴(kuò)增單個(gè)精子中幾個(gè)基因座的能力]增強(qiáng)了極大地增強(qiáng)了通過研究減數(shù)分裂后染色體交叉來進(jìn)行基因定位的傳統(tǒng)任務(wù),。通過分析數(shù)千個(gè)單個(gè)精子,,已經(jīng)直接觀察到非常緊密基因座之間罕見的交叉事件。類似地,,可以分析異常的缺失,、插入、易位或倒位,,所有這些都無需等待(或支付)漫長(zhǎng)而艱苦的受精,、胚胎發(fā)生等過程。定點(diǎn)突變:聚合酶鏈反應(yīng)可用于產(chǎn)生突變基因,,突變由科學(xué)家隨意選擇,。可以選擇這些突變來理解蛋白質(zhì)是如何完成其功能的,,并改變或改善蛋白質(zhì)功能,。珠海組織Real-time PCR網(wǎng)站
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